| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,336,233 | C→G | 6.2% | A872G (GCC→GGC) | PP_4695 → | two‑component system sensor histidine kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,336,233 | 0 | C | G | 6.2% | 350.1 / 12.5 | 113 | A872G (GCC→GGC) | PP_4695 | two‑component system sensor histidine kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (55/51); new base G (2/5); total (57/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.27e-01 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
CCACCAGAACAGCGAGGAGCCCGTGTGCCTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAGCGGGATTCCGAAGAACATCATGGACCGCC > NC_002947/5336084‑5336382 | ccaccaGAACAGCGAGGAGCCCGTGTGCCTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGc < 2:1426161/150‑1 (MQ=255) accaGAACAGCGAGGAGCCCGTGTGCCTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGccc > 1:1562716/1‑150 (MQ=255) accaGAACAGCGAGGAGCCCGTGTGCCTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGccc > 1:1951669/1‑150 (MQ=255) ccaGAACAGCGAGGAGCCCGTGTGCCTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCACCTGGGCCa > 2:1396517/1‑150 (MQ=255) caGAACAGCGAGGAGCCCGTGTGCCTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCACTTTCGACGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGGGACCCGCAGCGCCTGGCCCAg > 1:2382850/1‑150 (MQ=255) caGAACAGCGAGGAGCCCGTGTGCCTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAg < 1:208040/150‑1 (MQ=255) aCAGCGAGGAGCCCGTGTGCCTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGc < 2:844519/150‑1 (MQ=255) aGCGAGGAGCCCGTGTGCCTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTg < 2:2442364/150‑1 (MQ=255) aGCGAGGAGCCCGTGTGCCTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTg > 2:1016996/1‑150 (MQ=255) gCGAGGAGCCCGTGTGCCTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGa < 1:1563839/150‑1 (MQ=255) gCGAGGAGCCCGTGTGCCTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTGCGAAGCACAGTTCTTCAACCTTTGCGCCCCGGACCATTGGGCCGCAGGTGACCCGCAGCACCTGGGCCAGGCGCTgc < 2:1331138/150‑2 (MQ=255) cGAGGAGCCCGTGTGCCTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGAt > 2:1171408/1‑150 (MQ=255) gaggagCCCGTGTGCCTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCACCTGGGCCAGGCGCTgcgg < 1:808823/150‑4 (MQ=255) ggagCCCGTGTGCCTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGCCGGACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCACCTGGGCCAGGCGCTgcgggt < 1:156960/150‑6 (MQ=255) gCCCGTGTGCCTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCt > 2:2086510/1‑150 (MQ=255) gCCCGTGTGCCTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCAACTGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCt > 1:2017565/1‑150 (MQ=255) cTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCTCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAAc > 2:2171476/1‑150 (MQ=255) ggCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGc < 2:1031829/150‑1 (MQ=255) cTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGccc > 2:2013326/1‑150 (MQ=255) tGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCcg > 2:2322769/1‑150 (MQ=255) aGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACCGTTCCTCACCCTCTGCTATTCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGa < 1:2120811/150‑1 (MQ=255) aGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGa < 2:1131100/150‑1 (MQ=255) gTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGAt < 2:2032871/150‑1 (MQ=255) tGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATg > 2:250033/1‑150 (MQ=255) acaAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTc > 1:727142/1‑150 (MQ=255) aaGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGc < 1:888676/145‑1 (MQ=255) aaGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGc > 2:888676/1‑145 (MQ=255) gATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAAGTGCGTGTGAGCCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTcgccg > 2:1773168/1‑150 (MQ=255) gCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGccc < 2:1672201/150‑1 (MQ=255) gCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGccc < 2:1679931/150‑1 (MQ=255) gCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGccc < 2:1951669/150‑1 (MQ=255) cATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCgg < 1:2322769/150‑1 (MQ=255) aTCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGc > 1:223318/1‑150 (MQ=255) aTCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGc > 1:1248189/1‑150 (MQ=255) aTCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGc > 1:454260/1‑150 (MQ=255) aTCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCACCTGGGCCAGGCGCTgcgg < 2:1630616/111‑4 (MQ=255) aTCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCACCTGGGCCAGGCGCTgcgg > 1:1630616/1‑108 (MQ=255) tCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCa > 2:1394151/1‑150 (MQ=255) gTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGTGATGCCTCGCCGCCCGGCAgcg > 2:977747/1‑150 (MQ=255) gTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAgcg < 1:1089702/150‑1 (MQ=255) tCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGAAgcgc > 1:2051214/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGACAGCGCcgtgcg > 2:579818/1‑150 (MQ=255) aCCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCcgtgc < 1:1385059/141‑1 (MQ=255) ccGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAg > 1:2239467/1‑150 (MQ=255) gcgcAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGa < 1:218701/150‑1 (MQ=255) cgcAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAg < 1:515937/150‑1 (MQ=255) gcAATTTCGCAGTACAGTTCTTCCACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCACCGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAgg < 2:1099214/150‑1 (MQ=255) gcAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAgg < 1:732409/150‑1 (MQ=255) cAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGt < 1:1171408/150‑1 (MQ=255) aaTTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGtt > 1:1392667/1‑150 (MQ=255) aTTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTa < 1:903352/150‑1 (MQ=255) tttCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTaa > 1:1555349/1‑150 (MQ=255) ttCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAAc < 1:1394151/150‑1 (MQ=255) ttCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAAc < 1:104557/150‑1 (MQ=255) gAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAg > 1:1386667/1‑150 (MQ=255) gAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAg > 2:2071406/1‑150 (MQ=255) aaGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGc < 2:2382850/150‑1 (MQ=255) aaGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGc > 2:1597239/1‑150 (MQ=255) aaGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGc > 2:2175985/1‑150 (MQ=255) aGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGca > 1:2354517/1‑150 (MQ=255) cAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACAcc > 2:172702/1‑150 (MQ=255) gTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGt > 2:411556/1‑150 (MQ=255) ttcttcAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCTCGCGATGCCTCGCCGCGCGGCAGCGCCGTTCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTc < 1:47340/150‑1 (MQ=255) ttcttcAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCTTCGCCCGCCAGCTCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTc < 1:47143/150‑1 (MQ=255) ttcAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGAc < 1:2175985/150‑1 (MQ=255) ttcAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCGCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGGTGGCG‑CAGTGAGGTTAACGAGCACACCGTCGAc < 1:1773168/150‑1 (MQ=255) tcAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCcgtgcgcgtgc > 1:1038287/1‑120 (MQ=255) tcAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCcgtgcgcgtgc < 2:1038287/120‑1 (MQ=255) tcAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGAcc > 2:80688/1‑150 (MQ=255) cAANCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCt > 2:1500643/1‑150 (MQ=255) aaCCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTg > 1:498243/1‑150 (MQ=255) aCCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGa < 2:2094358/150‑1 (MQ=255) ccTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGAt > 2:68176/1‑150 (MQ=255) cTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGAtc > 1:1721860/1‑150 (MQ=255) tGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGAtcgtc < 2:1386667/150‑1 (MQ=255) gCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGAtcgtcg < 1:2013326/150‑1 (MQ=255) gACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGaa < 1:68176/150‑1 (MQ=255) cccGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCGACAG‑ATTCCGAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGa > 1:723352/1‑150 (MQ=255) cccGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGa > 2:716312/1‑150 (MQ=255) cGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACg > 2:2140917/1‑150 (MQ=255) gACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGaa > 2:2325618/1‑150 (MQ=255) ttGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAg > 1:420890/1‑150 (MQ=255) tGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCACAAATACTGTTCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAGc < 2:2017565/150‑1 (MQ=255) cgggCCGCAGGTGCGCTCCACCGACTGGCCGAGTCGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAGc < 2:1721860/149‑1 (MQ=255) tggCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCATCACCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAGCg > 2:344986/2‑150 (MQ=255) ggCCTAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAGCgg < 1:1290318/150‑1 (MQ=255) ggcGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTAATCGACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGTGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAGCggg > 1:2136014/3‑150 (MQ=255) ccGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAGCGGGa > 1:359893/1‑150 (MQ=255) cGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAGCGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGCCAAAGGCAGCGGGaa > 2:1321535/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAGCGGGAtt > 1:696646/1‑150 (MQ=255) tGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGCCCATCCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAGCGGGATTCCgaa < 2:2136014/150‑1 (MQ=255) ccGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAGCGGGATTCCGAAGAAc > 2:668862/1‑150 (MQ=255) ccGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGAAGCGTAGCGGGCTTGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAGCGGGATTCCGAAGAAc > 2:920408/1‑150 (MQ=255) ggcgcCGTGCCCAGGTGCGGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCTATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAGCGGGATTCCGAAGAAcatca < 2:543608/149‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAGCGGGATTCCGAAGAAcatca < 1:2325618/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACGCCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAGCGGGATTCCGAAGAACATCATGGa > 1:485982/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAGCGGGATTCCGAAGAACATCATGGa > 2:1051857/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAGCGGGATTCCGAAGAACATCATGGa < 1:1051857/150‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAAAATGGAACACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAGCGGGATTCCGAAGAACATCATGGAc > 1:1002075/1‑150 (MQ=255) cccAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGGGCACACCGTCGACCTGATCGTCTAAGACGAAGGCAGCGGGATTCCGAAGAACATCATGGACCGcc > 2:1946207/1‑150 (MQ=255) | CCACCAGAACAGCGAGGAGCCCGTGTGCCTGGCTGAAGTGGCACAAGATGCCATCGGTCTGCTGGCGTTGAACCGGCGCAATTTCGAAGTACAGTTCTTCAACCTTTGCGACCCGGACCATTGGGCCGAAGGTGACCCGCAGCGCCTGGCCCAGGTGCTGATCAACCTGCTCTCCAACGCCCGCGATGCCTCGCCGCCCGGCAGCGCCGTGCGCGTGCG‑CAGCGAGGTTAACGAGCACACCGTCGACCTGATCGTCGAAGACGAAGGCAGCGGGATTCCGAAGAACATCATGGACCGCC > NC_002947/5336084‑5336382 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |