| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 5,338,086 | A→G | 5.9% | intergenic (+45/‑239) | PP_4696 → / → PP_mr53 | nitrogen regulation protein NR(I)/CrcZ ncRNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,338,086 | 0 | A | G | 5.9% | 257.4 / 3.4 | 85 | intergenic (+45/‑239) | PP_4696/PP_mr53 | nitrogen regulation protein NR(I)/CrcZ ncRNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/42); new base G (3/2); total (40/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 | |||||||||||
GAGACCGAACTGGCACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACG > NC_002947/5337937‑5338224 | gagaccgaACTGGCACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTgaga < 2:2037675/150‑1 (MQ=255) accgaACTGGCACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCg > 2:1934996/1‑150 (MQ=255) gaACTGGCACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAgc < 2:1820914/150‑1 (MQ=255) aCTGGCACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAgcgc < 2:1537983/150‑1 (MQ=255) cTGGCACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGcgcc < 2:1744822/150‑1 (MQ=255) aaGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCcgcgcg > 2:448091/1‑150 (MQ=255) tCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGgcgc > 2:2249931/1‑150 (MQ=255) tCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGgcgc > 1:1494202/1‑150 (MQ=255) gCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCgcggc > 2:1636645/1‑139 (MQ=255) gCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCgcggc < 1:1636645/139‑1 (MQ=255) gCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTca < 2:777852/150‑1 (MQ=255) cGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTcaca < 2:1792476/150‑1 (MQ=255) gTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCCCGGCACAAGAGTAACGCGACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGgcgc > 1:1004502/1‑150 (MQ=255) tGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAg > 2:203717/1‑116 (MQ=255) tGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAg < 1:203717/116‑1 (MQ=255) tgtgGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTGACAGGCGCTCAAc > 1:1939646/1‑150 (MQ=255) gtgGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCGAATCGCGGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCTGCCAGAGCGGCGCTCTGTCTCACAGGCGCTGAACg > 1:644181/1‑150 (MQ=255) gtgGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACg > 1:2033781/1‑150 (MQ=255) tgGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACgt < 1:171194/150‑1 (MQ=255) tgGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACgt < 2:1615170/150‑1 (MQ=255) ggAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACgtgt < 2:1108639/150‑1 (MQ=255) ggAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACgtgt > 1:2446779/1‑150 (MQ=255) gAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTc < 1:2249931/150‑1 (MQ=255) gccgccAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCacga < 2:950221/150‑1 (MQ=255) ccgccAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCacgac < 2:2446779/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAac > 1:2089069/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAac < 1:2032723/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACAcccc < 2:2109770/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACAcccc < 1:206779/150‑1 (MQ=255) gggCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAgg < 1:770575/150‑1 (MQ=255) ggCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGt > 2:1599045/1‑150 (MQ=255) acccccCGGCGCAAGCGCAACGCTAGCAGCGAATCACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTAGGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAac < 2:858798/148‑1 (MQ=39) tCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAaca < 1:1823438/150‑1 (MQ=255) cccACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAacac > 2:754586/1‑150 (MQ=255) 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< 1:2290736/150‑1 (MQ=255) aaCGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTaaaa > 1:1290613/1‑150 (MQ=255) aCGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTaaaaa > 1:1894671/1‑150 (MQ=255) tACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTg > 2:1020662/1‑150 (MQ=255) cAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGgcgc < 1:1688262/93‑1 (MQ=255) cAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGgcgc > 2:1688262/1‑93 (MQ=255) cAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCGGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCt < 1:1412756/146‑1 (MQ=255) cAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCGGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCt > 2:1412756/1‑146 (MQ=255) gCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTAcc > 2:491456/1‑150 (MQ=255) aTAACCCCCCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAg < 2:455110/150‑1 (MQ=255) cccACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACgtgt > 1:337990/1‑92 (MQ=255) cccACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACgtgt < 2:337990/92‑1 (MQ=255) aCCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATc < 1:2225081/132‑1 (MQ=255) aCCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATc > 2:2225081/1‑132 (MQ=255) aCCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTAc > 1:418244/1‑138 (MQ=255) aCCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTAc < 2:418244/138‑1 (MQ=255) aCCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTccg > 1:2452575/1‑150 (MQ=255) cTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTccgcc < 2:1004502/150‑1 (MQ=255) cTACGCACCGCACGCCGCAGCCTACGGGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTccgcc > 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ccgcAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGa < 1:1883120/150‑1 (MQ=255) cgcAGCTGAGGCGGCTTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAg < 2:2089069/150‑1 (MQ=255) ccTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTa < 2:2118794/150‑1 (MQ=255) tATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACg > 1:842485/1‑150 (MQ=255) tGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGACGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTaa < 1:1069626/84‑1 (MQ=255) tGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGACGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTaa > 2:1069626/1‑84 (MQ=255) ggcgTCGGTGAGCCCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCGCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAAc < 2:2360491/150‑1 (MQ=255) gcgcctgTGAGGCCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGGTCTCGCCGACGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACg > 1:1869001/7‑150 (MQ=37) tCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGt > 2:1166603/1‑102 (MQ=255) tCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGt < 1:1166603/102‑1 (MQ=255) cctgTGAGGCCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGGTCTCACCGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCt < 2:2221774/97‑1 (MQ=21) cctgTGAGGCCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGGTCTCACCGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCt > 1:2221774/4‑100 (MQ=21) ctgTGAGGCCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGGTCTCACCGACGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTAc > 2:218859/3‑104 (MQ=21) ctgTGAGGCCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGGTCTCACCGACGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTAc < 1:218859/102‑1 (MQ=21) ggTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACacctcacctc < 1:1772939/86‑1 (MQ=255) ggTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACacctcacctc > 2:1772939/1‑86 (MQ=255) gTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCaa > 1:1619567/1‑106 (MQ=255) gTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCaa < 2:1619567/106‑1 (MQ=255) | GAGACCGAACTGGCACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACG > NC_002947/5337937‑5338224 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |