Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,366,334 | G→A | 5.5% | V90V (GTC→GTT) | ftsH ← | integral membrane ATP‑dependent zinc metallopeptidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,366,334 | 0 | G | A | 5.5% | 261.6 / 2.5 | 90 | V90V (GTC→GTT) | ftsH | integral membrane ATP‑dependent zinc metallopeptidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (42/42); new base A (2/3); total (44/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.67e-01 |
CATCGGCCCGCCCTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGACCTTGCCATCCTTGACCTGCT > NC_002947/5366193‑5366482 | cATCGGCCCGCCCTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGCATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTg < 1:622310/150‑1 (MQ=255) aTCGGCCCGCCCTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAAGCTGACGCCGGAATTGCTCCGCCGGCTGGTGATTGTCGCCTCCGGCATCTTCGCCCATAGGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTgg < 2:1464276/150‑1 (MQ=255) aTCGGCCCGCCCTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTgg > 2:1767760/1‑150 (MQ=255) tCGNCCCGCCCTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGt > 2:1515607/1‑150 (MQ=255) tCGGCCCGCCCTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGt < 2:106547/150‑1 (MQ=255) cGGCCCGCCCTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGtt < 1:2084617/150‑1 (MQ=255) cccgcccTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTc < 1:908408/150‑1 (MQ=255) ccgcccTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGGCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTACGACGACCACGGGGTTGTCg > 2:45548/1‑150 (MQ=255) cccTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGAcc < 1:1314228/150‑1 (MQ=255) cccTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACAACCACGTGGTCGTCGaag < 1:810861/150‑3 (MQ=255) ccTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGt < 2:978165/144‑1 (MQ=255) ccTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGt > 1:978165/1‑144 (MQ=255) ccTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCa > 1:2179214/1‑150 (MQ=255) tGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGAt < 1:525993/150‑1 (MQ=255) gcccgcGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACAACCACGTGGTCGTCGaag < 2:2127080/142‑3 (MQ=255) gcccgcGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACAACCACGTGGTCGTCGaag > 1:2127080/1‑140 (MQ=255) ccgcGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACCTGCCCCCGACAAAGATCGCCAGGATCGGGAAGCTCGCCCAAGGCTACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGa < 1:1115851/150‑1 (MQ=255) ttGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCAtt > 2:1693072/1‑150 (MQ=255) gCATCTGGCGCAGGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATAGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGt > 2:1058637/1‑150 (MQ=255) cATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTc > 1:2111281/1‑150 (MQ=255) aggtGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCg < 1:2408700/147‑1 (MQ=255) aTCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGc < 2:2063915/133‑1 (MQ=255) aTCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGc > 1:2063915/1‑133 (MQ=255) aTCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCg < 2:125417/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCATGAAGAACATGATCACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGt < 1:1767760/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGt < 2:2179214/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGt < 2:1528376/150‑1 (MQ=255) gcgcATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCCGGAGCGGTAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGAt < 2:2016965/150‑1 (MQ=255) cgcATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATg < 2:430466/150‑1 (MQ=255) cgcATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATg < 2:1823257/150‑1 (MQ=255) aTGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGcc > 2:2281803/1‑150 (MQ=255) gaagaaCATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCgg < 1:918047/150‑1 (MQ=255) aagaaCATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGa > 1:15009/1‑117 (MQ=255) aagaaCATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGa < 2:15009/117‑1 (MQ=255) aagaaCATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGGGCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCggg > 2:2409807/1‑150 (MQ=255) agaaCATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGgc < 1:1274437/150‑1 (MQ=255) cATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTTCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGcac > 1:302857/1‑150 (MQ=255) cATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGcac > 1:1275160/1‑150 (MQ=255) aTGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGcaca < 2:725848/150‑1 (MQ=255) tGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGtt > 1:2190281/1‑100 (MQ=255) tGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGtt < 2:2190281/100‑1 (MQ=255) gAACACGGCAATGATCGCCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCACCGGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCCTCGACCACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCCATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGt < 2:415813/150‑1 (MQ=255) aaCACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTc > 1:1781678/1‑150 (MQ=255) aaCACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACAACCACGTGGTCGTCGaag < 1:100897/105‑3 (MQ=255) aaCACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACAACCACGTGGTCGTCGaag > 2:100897/1‑103 (MQ=255) gCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGTGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAg < 1:1592641/150‑1 (MQ=255) gCAATGATCACCAGGATCCGGAAGCTCGCCACCAGCAACCGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAg < 1:959296/150‑1 (MQ=255) cAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGt > 1:783540/1‑150 (MQ=255) aaTGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGaa < 1:2059571/147‑1 (MQ=255) aaTGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGaa > 2:2059571/1‑147 (MQ=255) gATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTc < 2:531682/150‑1 (MQ=255) gATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTc < 1:1515607/150‑1 (MQ=255) aTCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATAAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCg > 1:2355703/1‑150 (MQ=255) ccAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGCTGGCTACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCAt > 1:148198/1‑150 (MQ=255) cAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATc > 2:1361043/1‑150 (MQ=255) cAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATc > 2:1907419/1‑150 (MQ=255) 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caGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGaa > 1:2301854/1‑117 (MQ=255) caGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGaa < 2:2301854/117‑1 (MQ=255) caGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCtt < 1:2166757/138‑1 (MQ=255) caGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCtt > 2:2166757/1‑138 (MQ=255) aGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAatgatg < 2:1826688/150‑1 (MQ=255) gCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGgtgt < 2:2450305/150‑1 (MQ=255) 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gTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCt > 2:1377144/1‑150 (MQ=255) cTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTc > 2:501090/1‑96 (MQ=255) cTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTc < 1:501090/96‑1 (MQ=255) cTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGAc > 1:2294028/1‑150 (MQ=255) cTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGAc < 2:1548337/150‑1 (MQ=255) tCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTgc < 1:1405529/106‑1 (MQ=255) tCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGATGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTgc > 2:1405529/1‑106 (MQ=255) aGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCa > 2:2077140/1‑97 (MQ=255) aGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCa < 1:2077140/97‑1 (MQ=255) ggCTGCTCGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGACATTGCCGGTGATACCCGTTCTCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTTCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGACCTTg < 1:542495/150‑1 (MQ=255) gctgctTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGAc > 1:1899216/1‑145 (MQ=255) gctgctTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGAc < 2:1899216/145‑1 (MQ=255) ctTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGACCTTGCCATc > 2:2012397/1‑150 (MQ=255) ttGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGACCTTGCCATcc > 2:2052781/1‑150 (MQ=255) ttGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGACCTTGCCATcc < 2:2294028/150‑1 (MQ=255) ttCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCTAGTAATTATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGACCTTGCCATCCTTGAc > 1:1344371/1‑150 (MQ=255) ttCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGACCTTGCCATCCTTGAc > 2:362807/1‑150 (MQ=255) acgacCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGGAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGACCTTGCCATCCTTGACctgc > 2:730597/1‑150 (MQ=255) cgacCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGACCTTGCCATCCTTGACctgct < 2:2273359/150‑1 (MQ=255) | CATCGGCCCGCCCTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGACCTTGCCATCCTTGACCTGCT > NC_002947/5366193‑5366482 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |