Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,525,527 | T→C | 10.2% | R89R (CGT→CGC) | PP_4858 → | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,525,527 | 0 | T | C | 10.2% | 160.1 / 4.3 | 74 | R89R (CGT→CGC) | PP_4858 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/35); new base C (2/6); total (33/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.52e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AGCCGCTGAACACCGTAGCTGAAGGCGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCGGATCGTCTGATCGAACAAGCTGGCCGTGTTGCCGAAGGCGG > NC_002947/5525379‑5525676 | aGCCGCTGAACACCGTAGCTGAAGGCGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGCTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGGTCGAACGTTCTGGCCgtg > 2:1828328/1‑150 (MQ=255) ccTGACCACCGTAGCTGGAGGCGGCTCCGATCGACTGATCGAACGTTCTGTCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGACGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGc < 2:1047391/149‑1 (MQ=14) gAACACCGTAGCTGAAGGCGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGa > 1:953333/1‑150 (MQ=255) aaCACCGTAGCTGAAGGCGGCTCCGCTGGCCTGGTCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGaa < 2:1934826/150‑1 (MQ=255) aaCACCGTAGCTGAAGGCGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGaa > 1:1588696/1‑150 (MQ=255) acacCGTAGCTGAAGGCGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAg < 2:1588696/150‑1 (MQ=255) cacCGTAGCTGAATGCGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAgg < 2:1875160/150‑1 (MQ=255) acCGTAGCTGAAGGCGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGt < 2:2142067/150‑1 (MQ=255) cGTAGCTGGAGGCGGCGCGGCGCGGCTGGTCGAACGGTCGGGCAGCGTAGCGGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTgg < 2:364436/150‑1 (MQ=14) cGTAGCTGAAGGCGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTgg < 1:2074858/150‑1 (MQ=255) aGCTGAAGGCGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTc < 1:1644836/150‑1 (MQ=255) aaGGCGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCCGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTGCTGGCCGTGTTGCAGAAGGCGGCTCCggat > 2:1219599/1‑147 (MQ=11) aGGCGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGCCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCg > 1:220071/1‑150 (MQ=255) gcggcTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGTCGCGTTGCTGAAGGTGTCTCCGTTCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTc < 1:293379/150‑1 (MQ=255) gcggcTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGCTCGTc > 2:1554785/1‑150 (MQ=38) gcTCCGATCGCATGATCGAACGTGCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGa < 1:1075904/150‑1 (MQ=255) tGATCCAACCTCCGGGCCGCGTTGCGGAAGGCGGCTCCGATCGCCTGATCGAGCGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTg < 2:1432683/150‑1 (MQ=11) ccgccGAACGTCCGGGCCCCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTg < 2:1351129/146‑1 (MQ=255) gagcGTTCGGGCGGCGTCGCTGACGGTGGCGCCGACGGCCTGATCGAACGTTCGGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCcgc < 2:2196990/147‑1 (MQ=11) aaCGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATc < 1:1689315/126‑1 (MQ=40) aaCGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATc > 2:1689315/1‑126 (MQ=39) ggCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGt < 1:1436098/108‑1 (MQ=255) ggCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGt > 2:1436098/1‑108 (MQ=40) gCCGCGTTGGTGAAGGTGGCTCCGATCGCCGGGTCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGGTGAAGGTGGCGCCGATCGTCTGCGCGAACGTTGGGGCCGGGTTGCTGAAg > 2:1970472/1‑150 (MQ=11) gCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATGGCTTGCTCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAg > 1:1992389/1‑150 (MQ=255) ccGCGTTTCTGAAGGTGGCGCCGAGGGCCCGCTCGCACGTTCTGGCAGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAgg < 2:953333/150‑1 (MQ=14) ccGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTGTGGCCGGGTGGcgggggg > 2:1742307/1‑144 (MQ=11) tGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATTGAACGTTCTGGTGGGGTTGCTGAAGGTTGCTCCGATCGTCTCATTTCTTATACTGGCCGTGTTGCTGACGGTGGCCCCgc > 1:1438478/1‑149 (MQ=11) tGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCGGAGGGTGGCTCCgg > 2:2020040/1‑149 (MQ=255) ggcggCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTg < 2:328373/118‑1 (MQ=21) ggTGGCTCTGATCGACTGGTCGAACGTTCTGGCAGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGt < 2:954824/150‑1 (MQ=11) ggCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTg > 2:1703546/1‑150 (MQ=14) gCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGGGTTGCCGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACACTCTGGCCGCGTTGCGGGAGGCGGCTCGGATCGTCTGa > 2:377981/1‑150 (MQ=11) cTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAg > 2:1979494/1‑86 (MQ=35) cTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAg < 1:1979494/86‑1 (MQ=35) tCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTg < 2:1948748/82‑1 (MQ=35) tCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTg > 1:1948748/1‑82 (MQ=35) tCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGt < 1:1026374/87‑1 (MQ=35) tCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGt > 2:1026374/1‑87 (MQ=33) tCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGACCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTGGTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCtagaa > 2:13380/1‑146 (MQ=11) gCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGtt < 1:1703546/150‑1 (MQ=17) cTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGACTGGTCGAACGTTCTGGCCGCGTGGCCGGGGGGGGCTCCGATCGTCTGATAGATCGGTCTGGCCGCGTGGCGGGAGGGAGCTCAGATGGTCGGatcgatcgcggt > 2:2104680/1‑146 (MQ=2) tCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGcc > 1:1431036/1‑150 (MQ=38) cGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCg > 1:1103905/1‑150 (MQ=38) gAACGTTCTGGCCGCGCTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGa < 1:2241318/88‑1 (MQ=255) gAACGTTCTGGCCGCGCTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGa > 2:2241318/1‑88 (MQ=255) ttCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATc > 1:2110763/1‑77 (MQ=35) ttCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATc < 2:2110763/77‑1 (MQ=35) ggCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGaa < 1:2281709/84‑1 (MQ=39) cgcgTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGt < 1:2412138/150‑1 (MQ=255) cTGAAGGTGGCTCCGGTCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCCGAAGGTGGCTCCGATCGTCAGCTCGAACGTGCCGGCCGTGTTGCCGAAGGAGGCTccg > 2:223893/1‑148 (MQ=11) cTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCgg < 1:442524/150‑1 (MQ=255) tGAAGGCGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCGGa < 2:340651/150‑1 (MQ=21) ggTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCCGAAGGTGGCTCGGATCGt < 2:1625872/150‑1 (MQ=255) gTGGCTCCTATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTGCGTGCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCGGATCGTc < 1:1970472/150‑1 (MQ=255) ggCTCTGATGGCGTGATCGAACGTTCTGTGAGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCGGATCGTCTg < 2:2357907/150‑1 (MQ=14) ccgcagATCGCCTGATCGAACGTGCTGGCAGTGTTGATGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCGGATCGTCTGa < 1:2104680/145‑1 (MQ=255) tCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCGGATCGTCTGATCGAACGCTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCGGATCGCCTGATc > 2:451713/1‑150 (MQ=255) tCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGt < 1:577643/87‑1 (MQ=40) tCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGt > 2:577643/1‑87 (MQ=39) cGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTc < 1:2379754/90‑1 (MQ=40) tCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGATTCCACAGATTCACGGATCGGTTTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCGGATCGTCTGATCGAACa < 1:1742307/150‑1 (MQ=11) ccTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATc > 2:837316/1‑52 (MQ=255) ccTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCGGATCGTCTGATCGAACAAGc > 1:1277441/1‑150 (MQ=255) ccTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCGGATCGTCTGATCGAACAAGc > 1:1423979/1‑150 (MQ=255) cTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCt < 1:2203019/105‑1 (MQ=17) gATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCGGATCGTCTGATCGAACAAGCTgg < 1:2020040/150‑1 (MQ=255) gAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTTGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCGGATc < 2:1254166/127‑1 (MQ=255) gAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCGGATc > 1:1254166/1‑127 (MQ=255) cctccgggCCCTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCGGATCGTCTGATCGAACAAGCTGGCCGTGtt < 2:2280358/144‑1 (MQ=255) gTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGaa > 2:246795/1‑110 (MQ=255) gTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGaa < 1:246795/110‑1 (MQ=255) ggCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTg < 2:298495/109‑1 (MQ=255) ggCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTg > 1:298495/1‑109 (MQ=255) cGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACACAATGACCGCGTTGCTGAAGGTGGCCCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCGGATCGTCTGATCGAACAAGCTGGCCGTGTTGCCGAAggc > 2:1902102/1‑150 (MQ=17) tgtTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCGGATCGTCTGATCGAACaa > 1:1617529/1‑127 (MQ=255) tgtTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCGGATCGTCTGATCGAACaa < 2:1617529/127‑1 (MQ=255) tgtTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCGGATCGTCTGATCGAACAAGCTGGCCGTGTTGCCGAAggcgg < 1:1554785/150‑1 (MQ=255) | AGCCGCTGAACACCGTAGCTGAAGGCGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGCCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGCGTTGCTGAAGGTGGCTCCGATCGTCTGATCGAACGTTCTGGCCGTGTTGCCGAAGGTGGCTCGGATCGTCTGATCGAACAAGCTGGCCGTGTTGCCGAAGGCGG > NC_002947/5525379‑5525676 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |