Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,609,045 | G→C | 5.9% | R202G (CGC→GGC) | waaA ← | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic acid transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,609,045 | 0 | G | C | 5.9% | 366.2 / 12.3 | 118 | R202G (CGC→GGC) | waaA | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic acid transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (52/59); new base C (4/3); total (56/62) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.07e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.59e-01 |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
GATCAAGGCATCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTGGCCA > NC_002947/5608896‑5609194 | gATCAAGGCATCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCAcgcg > 2:488951/1‑150 (MQ=255) aaGGCATCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCa > 2:2213085/1‑150 (MQ=255) aGGCATCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAg > 2:893157/1‑150 (MQ=255) ggCATCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTT‑TTCGTAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAgg < 1:64076/150‑1 (MQ=255) gCATCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAggg > 2:409253/1‑150 (MQ=255) gCATCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTACCCGCGCttgggg > 2:662666/1‑145 (MQ=255) cATCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGc < 2:777358/150‑1 (MQ=255) tCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGt < 2:946933/150‑1 (MQ=255) tCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGt < 1:2360547/150‑1 (MQ=255) cTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTg > 1:1826626/1‑150 (MQ=255) ccGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCCCTGAGCGCGTGCaagt < 2:1385651/150‑4 (MQ=255) gtcgtGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAg < 1:1236981/150‑1 (MQ=255) gtcgtGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAg < 2:424223/150‑1 (MQ=255) gggTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCAc < 2:1424144/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACg < 2:139660/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAgc > 1:833049/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAgc > 1:801334/1‑150 (MQ=255) gcggcAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAgcgc > 2:2031485/1‑150 (MQ=255) gcggcAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTAAATGGTCAG‑GTAAAACCCGATCG‑AGCCTGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAgcgc < 1:1488110/150‑1 (MQ=255) ggcAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTg > 2:910025/1‑150 (MQ=255) aTCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGcc > 1:1063428/1‑150 (MQ=255) aTCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGGGGCAGCAGCTGTTCGTCGGTGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCCAGGAGACGGTGGGcc > 1:1993889/1‑150 (MQ=255) cacacaGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑TTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCt > 2:1657254/1‑148 (MQ=255) cacacaGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCt < 1:1657254/148‑1 (MQ=255) acacaGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGTTCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAGGCGCCGGGACTggg > 1:992199/1‑150 (MQ=255) acacaGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTg < 2:245590/142‑1 (MQ=255) acacaGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCgg > 1:970004/1‑150 (MQ=255) acacaGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCgg > 2:2307838/1‑150 (MQ=255) acaGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTgg > 2:581423/1‑141 (MQ=255) acaGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGtt > 1:125333/1‑150 (MQ=255) acaGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGtt < 2:125333/150‑1 (MQ=255) gggCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGTGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCg < 1:1145558/150‑1 (MQ=255) gggCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCg < 1:1647005/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGt < 2:2270660/150‑1 (MQ=255) gcTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCt < 2:1219711/150‑1 (MQ=255) gcTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGCCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCt > 2:1598445/1‑150 (MQ=255) tGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGc > 2:1733827/1‑150 (MQ=255) tGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGAAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGc > 1:1674906/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCa > 1:828345/1‑150 (MQ=255) cgccCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCCGCTGTTCGCCGATGGTCAG‑TTCGAACTTGATCT‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCGCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACgg > 2:1073653/1‑150 (MQ=255) cgccCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACgg < 1:2213085/150‑1 (MQ=255) gccCCCCACCTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGc < 1:184937/150‑1 (MQ=255) ccccccAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACGTGCACGCCCTGAGCGCGTGCaag > 2:1768638/1‑105 (MQ=255) cccccAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGa < 2:1826626/150‑1 (MQ=255) cccccAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGa < 2:208272/150‑1 (MQ=255) ccccAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGAt < 1:357032/150‑1 (MQ=255) ccccAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGAt > 1:1477548/1‑150 (MQ=255) aaCTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCTCCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAgg < 1:662666/150‑1 (MQ=255) aaCTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAgg < 1:1733827/150‑1 (MQ=255) aaCTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAgg < 1:2307838/150‑1 (MQ=255) gTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCa > 1:1158537/1‑150 (MQ=255) gTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCa > 2:1476788/1‑150 (MQ=255) ttCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCAt > 1:717866/1‑150 (MQ=255) ttCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCAt > 1:2267500/1‑150 (MQ=255) tCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCCCTGAGCGCGTGCaa < 2:252786/94‑2 (MQ=255) tCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCCCTGAGCGCGTGCaa > 1:252786/1‑93 (MQ=255) cACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTAGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCAtct < 1:1106434/150‑1 (MQ=255) cACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCCCAGATGCCGGGAGGGGAAGTCG‑GGG‑GCTCGGGGACGGGCGCGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTGCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCAtct > 1:647042/1‑150 (MQ=255) aCGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGaa > 1:923894/1‑105 (MQ=255) aCGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTc > 2:1929957/1‑117 (MQ=255) aCGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTc < 1:1929957/117‑1 (MQ=255) gCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCgg < 2:1776608/150‑1 (MQ=255) tGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGTTTTCg > 1:1947970/1‑118 (MQ=255) tGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCg < 2:1947970/118‑1 (MQ=255) ccTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCCG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCCCATCTCGGCCAGCAt < 1:1716177/150‑1 (MQ=255) tCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAg < 2:1447275/85‑1 (MQ=255) tCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAg > 1:1447275/1‑85 (MQ=255) tCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCgg < 1:974564/141‑1 (MQ=255) tCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCgg > 2:974564/1‑141 (MQ=255) cgTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCgg < 2:2422115/150‑1 (MQ=255) ggCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCCCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTc < 1:1077064/150‑1 (MQ=255) agcTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTg < 1:1476788/150‑1 (MQ=255) gcTGTTCGGCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTgg > 2:90965/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGcca > 2:15909/1‑148 (MQ=255) cgtcgATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAgc < 2:970004/150‑1 (MQ=255) gtcgATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCgg > 1:395896/1‑133 (MQ=255) cgATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGcc < 2:833049/150‑1 (MQ=255) gATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGccc > 1:134557/1‑150 (MQ=255) gTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCCATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAg < 1:661961/150‑1 (MQ=255) gTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACg > 2:1968564/1‑150 (MQ=255) gTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACg > 1:330265/1‑150 (MQ=255) gTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACg > 1:836314/1‑150 (MQ=255) cTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCg > 2:472520/1‑114 (MQ=255) cTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCg < 1:472520/114‑1 (MQ=255) cTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAACGCGCCCATAGCCACGGGCCGa < 2:956562/150‑1 (MQ=255) cTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGa < 2:2267500/150‑1 (MQ=255) ttGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAg < 1:915693/150‑1 (MQ=255) gATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAgcg < 2:1063428/150‑1 (MQ=255) aTCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAgcgc > 1:1579031/1‑150 (MQ=255) aTCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAgcgc < 2:647042/150‑1 (MQ=255) cG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTc < 2:828345/150‑1 (MQ=255) g‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCACGCTGACCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCa < 1:1520440/150‑1 (MQ=255) g‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCa < 2:717866/150‑1 (MQ=255) ctgggtGCACGCCCTGAGCGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAgc > 2:1153857/6‑150 (MQ=255) ttGCACGCGCGCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTGCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAgcgcgc > 2:1675695/1‑150 (MQ=255) cACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCTCGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCAtt > 2:728276/1‑150 (MQ=255) aCGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTg < 2:1993889/150‑1 (MQ=255) aCGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTg > 1:1342150/1‑150 (MQ=255) gcgcTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTGGc > 2:1588797/1‑150 (MQ=255) gcTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTGGCCa > 2:2385958/1‑150 (MQ=255) | GATCAAGGCATCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAG‑GTCGAACTTGATCG‑AGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCTGCACGGCGATCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTGGCCA > NC_002947/5608896‑5609194 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |