| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,783,376 | C→G | 6.3% | H599D (CAC→GAC) | kefA → | intermediate mechanosensitive channel protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,783,376 | 0 | C | G | 6.3% | 400.1 / 14.3 | 127 | H599D (CAC→GAC) | kefA | intermediate mechanosensitive channel protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (58/61); new base G (4/4); total (62/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.06e-01 | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
TTGGCCTGGCGCTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTG > NC_002947/5783227‑5783525 | cTGGCGCTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTc > 1:2188974/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTcc > 2:1375044/1‑150 (MQ=255) cgcTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCt < 1:98932/150‑1 (MQ=255) ttgtgCAGCTATGCCTTGCCGATCGATGCTCGCGGGCAAACCG‑CCAACTTGTGCGCCGCCCTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCCCTTCCGCT‑gg < 2:1013174/149‑1 (MQ=255) cTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑gg < 1:713556/150‑1 (MQ=255) cTGTGCAGCTATGCCTTGCAGAGCGCTGATC‑CGATCATATTGTCCTACCTGGGCGCTGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTC‑GCGTGGCGGAAGTGGACTTCCGccac < 2:1203792/150‑4 (MQ=255) gtgCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGca < 1:510544/150‑1 (MQ=255) aGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGGTGAGGTGCACTTCCGCT‑CCCACaaa > 2:1097902/1‑150 (MQ=255) aGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACaaa > 1:80758/1‑150 (MQ=255) aGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACaaa > 2:2349435/1‑150 (MQ=255) aGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACaaa > 1:547342/1‑150 (MQ=255) cTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGAATAACGTT‑TACACCGCCTACCGTATCCTCGCAGAACATGAACGCGG‑GGAATGCCACTTACGCT‑GGCACAAAcc > 1:2253152/1‑150 (MQ=255) tGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCa < 2:1293027/150‑1 (MQ=255) ccTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAgg > 1:2241986/1‑150 (MQ=255) ccTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAgg < 2:547342/150‑1 (MQ=255) ttGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTc > 2:201126/1‑150 (MQ=255) ttGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTc < 1:579781/150‑1 (MQ=255) ttGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGAT‑GGCACAAACCGCAGGTc > 2:1636833/1‑150 (MQ=255) gATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTg > 2:2424804/1‑150 (MQ=255) gATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTg < 2:219298/150‑1 (MQ=255) aTGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTGGACTTCCGc < 2:1078759/122‑1 (MQ=255) aTGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTGGACTTCCGc < 2:1079640/122‑1 (MQ=255) aTGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTGGACTTCCGc > 1:1078759/1‑122 (MQ=255) tGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTgcg > 1:2170251/1‑150 (MQ=255) tCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCAc < 2:1055715/112‑1 (MQ=255) tCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCAc > 1:1055715/1‑112 (MQ=255) tCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCgg > 2:304471/1‑150 (MQ=255) cgGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CAGGTGTTCTACACCTCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTg < 2:1298101/150‑1 (MQ=255) gCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGt < 1:1097902/150‑1 (MQ=255) gCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGt < 1:2349435/150‑1 (MQ=255) cAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGtt < 2:80758/150‑1 (MQ=255) aaaaCG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTc > 2:1795319/1‑150 (MQ=255) aaCG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTcgc > 1:840190/1‑150 (MQ=255) cAACCTGTGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACCCACTACCGTACGATCTTCTGCGCGGCGGGGTTCGCCGCCt > 2:21992/1‑150 (MQ=255) cAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCt < 2:1369034/150‑1 (MQ=255) aaCCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTCACGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTg < 1:1636833/150‑1 (MQ=255) tGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCa < 1:1874784/150‑1 (MQ=255) gccgcACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACCTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACtgtg > 1:1124101/1‑150 (MQ=255) gcACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACtgtg > 1:2344947/1‑147 (MQ=255) gcACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACtgtg < 2:2344947/147‑1 (MQ=255) gcACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTgtggtg < 2:532986/150‑1 (MQ=255) aCTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCt > 2:2392069/1‑150 (MQ=255) ctctGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTg > 1:2000928/1‑150 (MQ=255) tctGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTgg < 1:1763739/150‑1 (MQ=255) ggCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCAc < 1:1964574/150‑1 (MQ=255) aGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCACGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTgg > 2:346116/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGCAGCAGCAGTACA‑TTGAGTTCCGCACAAACTTCACAGCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGt < 1:1485332/150‑1 (MQ=255) tGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCa > 1:2114442/1‑143 (MQ=255) gCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGc > 1:765619/1‑150 (MQ=255) gCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGc < 2:2120358/150‑1 (MQ=255) gCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGc > 1:1314128/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTGGACTTCCGcca < 1:709853/75‑3 (MQ=255) ccAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTGGACTTCCGcca > 2:709853/1‑73 (MQ=255) ccAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTcgc > 1:2085822/1‑115 (MQ=255) ccAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTcgc < 2:2085822/115‑1 (MQ=255) cAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGACGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCgtg > 1:2218008/1‑150 (MQ=255) ggCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCAc 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tATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCa > 1:1500670/1‑148 (MQ=255) cTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTc > 2:2397887/1‑140 (MQ=255) cTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTc < 1:2397887/140‑1 (MQ=255) tCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGcc > 2:1825500/1‑125 (MQ=255) tCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGcc < 1:1825500/125‑1 (MQ=255) tCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAg > 1:1051876/1‑150 (MQ=255) tCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAg > 2:1665354/1‑150 (MQ=255) gCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAgac < 1:681742/150‑1 (MQ=255) g‑gcgtggcgGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTg < 2:2253152/150‑1 (MQ=255) g‑gcgtggcgGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTg < 2:2170251/150‑1 (MQ=255) g‑gcgtggcgGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGCTTCCCCTCCGGGGCCCTATGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTg < 1:766217/150‑1 (MQ=255) gtggcgGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGc > 1:1963964/1‑150 (MQ=255) ccagcgGAAGTGGACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGc > 1:1375301/4‑150 (MQ=255) gAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGc < 1:1511566/150‑1 (MQ=255) aGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCgt < 1:2271429/150‑1 (MQ=255) gTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTgg > 2:2350825/1‑124 (MQ=255) gTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTgg < 1:2350825/124‑1 (MQ=255) gTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCgtg > 1:1444559/1‑150 (MQ=255) ccACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCg < 2:2390003/115‑1 (MQ=255) ccACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCgtggt > 1:345429/1‑150 (MQ=255) cACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCgtggtg > 2:1461778/1‑150 (MQ=255) cACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCgtggtg < 1:1173090/150‑1 (MQ=255) | TTGGCCTGGCGCTGTGCAGCTATGCCTTGCAGATCGATGCTCGCGGGCAAAACG‑CCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGG‑CTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTG‑GCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCT‑GGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGGCTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTG > NC_002947/5783227‑5783525 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |