| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,013,917 | C→T | 10.1% | intergenic (+66/+44) | xpt → / ← PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,013,917 | 0 | C | T | 10.1% | 186.9 / 10.0 | 69 | intergenic (+66/+44) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/24); new base T (2/5); total (40/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.71e-01 | |||||||||||
GAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCC > NC_002947/6013768‑6014066 | gAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGcc < 2:1825671/150‑1 (MQ=255) cTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAAGAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTa > 2:918354‑M2/1‑149 (MQ=255) tGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTac > 2:1550089‑M2/1‑148 (MQ=255) tGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTac < 2:2120426‑M2/150‑3 (MQ=255) gACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacct > 1:2120426‑M2/1‑146 (MQ=255) gACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacct > 1:2211844‑M2/1‑146 (MQ=255) cAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacttgt > 1:2446103‑M2/1‑144 (MQ=255) cAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgt > 2:1444833‑M2/1‑144 (MQ=255) gCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgg > 1:297086‑M2/1‑142 (MQ=255) gCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgg > 1:1908115‑M2/1‑142 (MQ=255) tACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggc > 1:826152‑M2/1‑134 (MQ=255) cccgCGTTGAATCGCTCGCACGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcg > 2:2397840‑M2/2‑133 (MQ=255) ccGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgt > 2:966232‑M2/1‑132 (MQ=255) cgTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcc > 2:519058‑M2/1‑129 (MQ=255) gCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCtt > 1:2350260/1‑98 (MQ=255) gCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCtt < 2:2350260/98‑1 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAgcgc > 1:1297621/1‑126 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑CTCTCGA‑ACGCTGTTCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAgcgc < 2:1297621/126‑1 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcgcgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcga > 1:469351‑M2/1‑43 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcgcgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcga < 2:469351‑M2/119‑77 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGc > 2:1122540/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGc > 1:374237/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGAC‑CTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGc > 1:1174828/1‑150 (MQ=18) gCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccacct > 1:2222965‑M2/1‑40 (MQ=255) gCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccacct < 2:2222965‑M2/108‑69 (MQ=255) gCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAACGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTg > 1:369390/1‑150 (MQ=255) tCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaa < 2:2117253‑M2/145‑108 (MQ=255) tCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaa > 1:2117253‑M2/1‑38 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggc < 1:27384‑M2/150‑115 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatg < 2:512109‑M2/86‑51 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatg > 1:512109‑M2/1‑36 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcccc > 2:1835340/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcccc > 1:19852/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTCTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGACAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcccc > 1:755720/1‑150 (MQ=255) cacaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGTCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAACCTGTGCGTTACGCCCCTGCGGCTGCCCCa > 1:1386/1‑150 (MQ=39) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCTGCacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctg < 2:168587‑M2/150‑117 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctg < 1:1130320‑M2/150‑117 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctg < 2:297885‑M2/150‑117 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcgg > 1:451836‑M2/1‑34 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcgg < 2:451836‑M2/138‑105 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaa > 1:347867‑M2/1‑34 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaa < 2:347867‑M2/86‑53 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAg < 1:865526/109‑1 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGACCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAg > 2:865526/1‑109 (MQ=255) acaGGTGCAGCAAAG‑GTCTCGA‑ACGCGGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctg < 1:2265062‑M2/150‑117 (MQ=255) aGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggc > 1:2020176‑M2/1‑32 (MQ=255) aGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggc < 2:2020176‑M2/120‑89 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgac > 2:809184‑M2/1‑30 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgac < 1:809184‑M2/107‑78 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttc > 2:1056344/1‑119 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttc < 1:1056344/119‑1 (MQ=255) tGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcga > 1:1595168‑M2/1‑29 (MQ=255) tGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcga < 2:1595168‑M2/123‑95 (MQ=255) gcagcaCAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCTGCacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtccagt < 1:1939695‑M2/150‑123 (MQ=255) gcagcaCAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCTGCacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtccagt < 1:2071788‑M2/150‑123 (MQ=255) gcagcaCAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccatggctgtccagt < 1:1565742‑M2/150‑123 (MQ=255) gcaCAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCTGCacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtccagttcg > 2:2071788‑M2/1‑25 (MQ=255) gcaCAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCTGCacctgcgggcgcgttcccggacgcgagccaggggtcgcgtttattcgctgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtccagttcg < 1:895039‑M2/150‑126 (MQ=255) tctcGA‑ACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtccagttcggcacggc > 2:27384‑M2/1‑18 (MQ=255) ctcGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATc < 2:1990467/140‑1 (MQ=255) ctcGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATc > 1:1990467/1‑140 (MQ=255) gA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCTAATTGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGc < 1:1113995/150‑1 (MQ=255) gA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGc > 2:1113995/1‑150 (MQ=255) cTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCa < 2:610792/150‑1 (MQ=255) tgtgCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCGACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcc > 2:1599406/1‑120 (MQ=255) tgtgCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcc < 1:1599406/120‑1 (MQ=255) tgCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc > 1:1873029/1‑150 (MQ=255) tgCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc < 2:374237/150‑1 (MQ=255) gCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctgg < 2:1101437‑M2/118‑114 (MQ=255) gCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctgg > 1:1101437‑M2/1‑5 (MQ=255) ccGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAccc > 1:262291/1‑150 (MQ=255) cGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCGGCCCCAGGGGGCTTTCATAcccc > 2:1136517/1‑150 (MQ=255) | GAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGA‑ACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCC > NC_002947/6013768‑6014066 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |