Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,125,918 | G→C | 6.1% | L219L (CTG→CTC) | PP_5374 → | choline/carnitine/betaine transporter family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,125,918 | 0 | G | C | 6.1% | 360.7 / 10.7 | 115 | L219L (CTG→CTC) | PP_5374 | choline/carnitine/betaine transporter family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (63/45); new base C (3/4); total (66/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.57e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.37e-01 |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
CATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGAAGCGCCTTTCGGAATGGAATATGCTGTTGTCGG > NC_002947/6125774‑6126060 | cATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCa > 1:1897709/1‑150 (MQ=255) tGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAgg > 1:1586714/1‑150 (MQ=255) gcgcTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCTGGCTCAGCCCGgt < 2:1747236/150‑1 (MQ=255) gcTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCTGACATGTGGTGGACATCCTTGACGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGACAGgtg‑t > 2:1225954/1‑150 (MQ=255) tCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATAAGTGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑ttt > 1:1144547/1‑150 (MQ=255) taTCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATAGGCAACATGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGa > 1:1133034/2‑150 (MQ=255) gATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGa > 2:1361186/1‑150 (MQ=255) aTCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGAc > 1:1984766/1‑150 (MQ=255) tCCTTTGCCCTCTGATTGGTGAGCCCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTCGCCGGGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCTGGCTCAGCCCGGTG‑ttcattt < 1:635729/150‑6 (MQ=255) tCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑ttt > 1:296223/1‑146 (MQ=255) tCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑ttt < 2:296223/146‑1 (MQ=255) ccTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCt < 1:369532/150‑1 (MQ=255) cTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTg > 2:1681805/1‑150 (MQ=255) tttACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGc < 2:1042248/150‑1 (MQ=255) tttACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGc > 2:1006833/1‑150 (MQ=255) tttACCCGATGATTGGATCGCTGATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCTTTCGGTGTATCCGAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGc < 2:1133034/150‑1 (MQ=255) cccGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑tt < 1:470774/138‑1 (MQ=255) ccGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATc > 1:750189/1‑150 (MQ=255) ccGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATc > 2:596603/1‑150 (MQ=255) ccGATGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGAAATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCACAGTAGCTGGGACTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCAAGGAG‑TTTGACCTGcaaatc > 2:2334743/1‑145 (MQ=255) cGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCa < 2:219549/150‑1 (MQ=255) cGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCa > 2:509538/1‑150 (MQ=255) ttGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTgg < 1:312690/150‑1 (MQ=255) tGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTggg < 1:1361186/150‑1 (MQ=255) ggTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTgggg < 2:1873319/150‑1 (MQ=255) tGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGt < 2:2330584/150‑1 (MQ=255) aGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGgtg‑t > 2:1331930/1‑123 (MQ=255) gcgcATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCa < 1:279057/150‑1 (MQ=255) cgcATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCTGGCTCAGCCCGGTG‑ttca > 1:306344/1‑122 (MQ=255) cgcATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCTGGCTCAGCCCGGTG‑ttca < 2:306344/124‑3 (MQ=255) gcATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGa > 2:2082773/1‑150 (MQ=255) gcATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAAGGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGa < 2:365565/150‑1 (MQ=255) aTCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGa > 1:504427/1‑122 (MQ=255) aTCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGa > 1:504753/1‑122 (MQ=255) aTCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGa < 2:504427/122‑1 (MQ=255) aTCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGa < 2:504753/122‑1 (MQ=255) aTCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATc > 1:1629358/1‑150 (MQ=255) aTCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGGGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCCTCAGCCTGGGGGTGCAGATc > 2:840471/1‑150 (MQ=255) tATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCAcc < 1:1681805/150‑1 (MQ=255) gCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCa > 1:1599980/1‑125 (MQ=255) ccATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTgggg < 1:662152/131‑1 (MQ=255) ccATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTgggg > 2:662152/1‑131 (MQ=255) cATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCTATTGAACACCGGGCTGGGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGt > 2:566085/1‑150 (MQ=255) ataggACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGCGAATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTg > 2:1530942/4‑150 (MQ=255) gACATGTTGTGGACATCCTTGCCGTGATGATTACCGCTTTCTGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGGAGTGCAACTGAACACCGGTCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTACAGAACACCTTGATCGTGCTCa > 2:1069978/1‑150 (MQ=255) gtggtgGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTAcc < 2:750189/150‑1 (MQ=255) gtggACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTc < 2:238467/150‑1 (MQ=255) tggACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCg > 2:2004039/1‑150 (MQ=255) tggACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCAATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCg > 1:136036/1‑150 (MQ=255) ggACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGt > 2:1969009/1‑150 (MQ=255) gACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCTGGCTCAGCCCGgt > 2:1251940/1‑89 (MQ=255) gACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCTGGCTCAGCCCGgt < 1:1251940/89‑1 (MQ=255) 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tgtATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATg > 1:417149/1‑136 (MQ=255) tgtATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATg < 2:417149/136‑1 (MQ=255) gtATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTCTCGGTGAt < 2:530891/134‑1 (MQ=255) aTCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTgg > 1:2187831/1‑150 (MQ=255) tCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCAc < 1:2398413/89‑1 (MQ=255) tCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGc < 1:509538/150‑1 (MQ=255) cccAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCGGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCTGGCGTGTCGCGTGGCa > 2:1020570/1‑150 (MQ=255) ccAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGgtg‑t < 2:1614615/53‑1 (MQ=255) ccAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGgtg‑t > 1:1614615/1‑53 (MQ=255) ccAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCAt > 2:2306203/1‑150 (MQ=255) cAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGt < 1:790804/125‑1 (MQ=255) cAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGt > 2:790804/1‑125 (MQ=255) cAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATg > 2:362402/1‑150 (MQ=255) aGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGa > 2:731151/1‑150 (MQ=255) gCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGAAgcg > 2:2393263/1‑150 (MQ=255) gCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGAAgcg > 2:1287066/1‑150 (MQ=255) gCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGAAgcg > 1:1623019/1‑150 (MQ=255) tgggccggggcGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCGCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGAAGCGcc < 1:1141745/150‑1 (MQ=255) gcctgggcGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCGCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGAAGCGCCttt < 1:1153845/150‑1 (MQ=255) cctgggcGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGAAGCGCCTTTc < 1:993997/150‑1 (MQ=255) gggcGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATg > 1:1287373/1‑115 (MQ=255) tggtgCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGAAGCGCCTTTCggaatgga < 2:1031759/150‑1 (MQ=255) tgCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGAAGCGCCTTTCGGAATGGAata > 2:1876410/1‑150 (MQ=255) gCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGAAGCGCCTTTCGGAATGGAatat > 1:2412731/1‑150 (MQ=255) aaaTGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCTTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTTGCAGGAAGCGCCTTACATAATGGAATATga > 1:491785/1‑149 (MQ=255) aaTGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGAAGCGCCTTTCGGAATGGAATATGCt < 2:139849/150‑1 (MQ=255) tGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTCACTAACGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGAAGCGCCTTTCGGCATGGAATATGCtgt < 2:1862734/150‑1 (MQ=255) gAACACCGTGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGAAGCGCCTTTCGGAATGGAATATGCtgtt < 2:1312785/150‑1 (MQ=255) cacCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGAAGCGCCTTTCGGAATGGAATATGCTGTTGTc > 2:1630516/1‑150 (MQ=255) acCTGGCTCAGCCCGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGAAGCGCCTTTCGGAATGGAATATGCTGTTGTCg > 2:2178398/1‑150 (MQ=255) ccGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGAAGCGCCTTTCGGAATGGAATATGCTGTTGTCgg > 2:2204688/1‑150 (MQ=255) ccGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGAAGCGCCTTTCGGAATGGAATATGCTGTTGTCgg < 2:1984766/150‑1 (MQ=255) | CATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGCCAGGTG‑TTTGACCTGCCCATCAGCCTGGGGGTGCAGATCACCTTGATCGTGCTCATTACCCTCGTTACTACCGTATCGGTGATGGCCGGCGTGTCGCGTGGCATGAAGCGCCTTTCGGAATGGAATATGCTGTTGTCGG > NC_002947/6125774‑6126060 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |