| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 743,453 | T→C | 13.3% | intergenic (+129/+145) | PP_0635 → / ← PP_0636 | group II intron‑encoding maturase/cold shock DNA‑binding domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 743,453 | 0 | T | C | 13.3% | 332.8 / 33.2 | 128 | intergenic (+129/+145) | PP_0635/PP_0636 | group II intron‑encoding maturase/cold shock DNA‑binding domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (57/53); new base C (10/7); total (68/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.14e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.56e-01 | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
CGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCTAAGCCGAGTGAGGCATTCGATCCTGCTAG > NC_002947/743304‑743601 | cGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGtt > 2:569233/1‑150 (MQ=255)cGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGAACTG‑AAAGGGTGTCTCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGtt > 2:2411004/1‑150 (MQ=17) ggCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTa > 2:1765454/1‑150 (MQ=255) ttAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACAt > 1:1457270/1‑150 (MQ=255) gcgTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGa > 2:41913/1‑150 (MQ=255) gcgTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGa > 1:206796/1‑150 (MQ=255) cgTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑TCCGCTATGTAACGCAACCGAAGGTTGCTTCACATAGCgggc < 2:879339/150‑3 (MQ=17) tGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑TCCGCTATGTAACGCAACCGAAGGTTGCTTCACATAGCGGGcacacaa < 1:508314/149‑2 (MQ=18) tGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑TCCGCTATGTAACGCAACCGAAGGTTGCTTCACATAGCGGGcacacaa > 2:508314/1‑148 (MQ=18) tGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGa < 2:867761/142‑1 (MQ=255) tGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGa > 1:867761/1‑142 (MQ=255) tGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGc < 2:1756315/150‑1 (MQ=255) cgccgTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGcgtcgt > 2:2109485/1‑150 (MQ=255) ccgTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGa > 1:1561983/1‑150 (MQ=255) cGGAACCGTACGCACGGTGGCGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCg > 1:53015/1‑150 (MQ=255) cGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGaaa > 2:1311332/1‑150 (MQ=255) gtgtGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑cgcg > 2:312960/1‑150 (MQ=255) gtgtGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑cgcg > 2:595326/1‑150 (MQ=255) agagGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCgtg > 1:2008735/1‑150 (MQ=255) agagGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCgtg > 2:1590696/1‑150 (MQ=255) ggACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTgg < 1:1801689/150‑1 (MQ=255) ggcggGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCa > 1:679659/1‑150 (MQ=255) cggGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCaga < 1:595326/150‑1 (MQ=255) cggGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCaga < 1:1590696/150‑1 (MQ=255) cggGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCaga < 1:1416135/150‑1 (MQ=255) gggTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCagag > 1:2297564/1‑150 (MQ=255) tgtgAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTAACGCAACCGAAGGTTGCTTCACATAGCgg > 1:41414/1‑90 (MQ=18) tgAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGt < 2:2008735/150‑1 (MQ=255) gAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAac > 2:1044243/1‑117 (MQ=255) gAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAac < 1:1044243/117‑1 (MQ=255) gAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTa < 2:53015/150‑1 (MQ=255) aTCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAg < 2:2315278/149‑1 (MQ=255) tCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGCGCAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAggg > 1:1842517/1‑150 (MQ=255) ccGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCaga < 1:2400109/139‑1 (MQ=255) ccGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCaga > 2:2400109/1‑139 (MQ=255) gCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACt > 2:1828000/1‑141 (MQ=255) gCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAg > 2:2030093/1‑150 (MQ=255) cctACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGtt < 2:2297564/150‑1 (MQ=255) cctACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGtt < 2:1457270/150‑1 (MQ=255) cctACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGtt > 1:1366428/1‑150 (MQ=255) ccgtcTCGATTGCGCGAAATCACACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGCGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGTGGAGCGtt < 2:614999/146‑1 (MQ=255) tACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCTGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGa > 1:766518/1‑150 (MQ=255) tACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGa > 2:1158226/1‑150 (MQ=255) aCTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGAc < 1:843297/150‑1 (MQ=255) tCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAg > 1:2451832/1‑150 (MQ=255) gATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAggg > 1:1390940/1‑136 (MQ=255) gATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAggg < 2:1390940/136‑1 (MQ=255) gATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAgg > 1:2321320/1‑135 (MQ=255) gATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAgg < 2:2321320/135‑1 (MQ=255) gcgAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGtt > 2:351979/1‑150 (MQ=255) gcgAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGtt > 2:1468249/1‑150 (MQ=255) gcgAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGtt > 1:1451783/1‑150 (MQ=255) gcgAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGtt < 1:1888560/150‑1 (MQ=255) gAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAg < 2:1307323/126‑1 (MQ=255) gAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTc > 2:1802917/1‑150 (MQ=255) gAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGAAGCAGAGACTGTAg > 1:1307323/1‑126 (MQ=255) aaTCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCaa < 1:41913/150‑1 (MQ=255) aaTCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCaa < 1:2338650/150‑1 (MQ=255) aaTCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCaa < 2:766518/150‑1 (MQ=255) aaTCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCaa < 1:2105185/150‑1 (MQ=255) aGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAagcta < 2:2217549/150‑1 (MQ=255) gACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCaga > 1:218868/1‑111 (MQ=255) gACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCaga < 2:218868/111‑1 (MQ=255) cTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAagctag < 2:197696/147‑1 (MQ=255) cTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCtt > 1:2331655/1‑150 (MQ=255) gCCTGGTGTG‑CCCCCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTgg < 2:772491/150‑1 (MQ=255) ccTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTGGGGGAGCGGTGACGGTGGAGGTTTCGAGCTGGCTTGGc > 2:391300/1‑150 (MQ=255) tgtgtg‑TCCGCTATGTAACGCAACCGAAGGTTGCTTCACATAGCGGGCACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAg < 2:1397014/110‑1 (MQ=17) tg‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCg < 2:1267383/125‑1 (MQ=255) tg‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCg > 1:1267383/1‑125 (MQ=255) gtccGCTATGTAACGCAACCGAAGGTTGCTTCACATAGCGGGCACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCg < 1:1631049/122‑1 (MQ=21) gtccGCTATGTAACGCAACCGAAGGTTGCTTCACATAGCGGGCACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCg < 1:1629478/122‑1 (MQ=21) gtccGCTATGTAACGCAACCGAAGGTTGCTTCACATAGCGGGCACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCg > 2:1631049/3‑124 (MQ=21) tccGCTATGTAACGCAACCGAAGGTTGCTTCACATAGCGGGCACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCt > 1:1038455/2‑150 (MQ=37) tccGCTATGTAACGCAACCGAAGGTTGCTTCACATAGCGGGCACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCt > 1:1798895/2‑150 (MQ=37) tccGCTATGTAACGCAACCGAAGGTTGCTTCACATAGCGGGCACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCt > 1:1798987/2‑150 (MQ=37) tccGCTATGTAACGCAACCGAAGGTTGCTTCACATAGCGGGCACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCt > 1:2062479/2‑150 (MQ=37) ccGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAagctag < 1:566977/134‑1 (MQ=255) ccGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCTa > 2:1782017/1‑150 (MQ=255) cGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCTaa < 2:2451832/150‑1 (MQ=255) cGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCTaa < 1:1876463/150‑1 (MQ=255) tATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCTAAGcc < 2:1366428/150‑1 (MQ=255) aacgCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCTAAGCCGAGTg > 1:705520/4‑150 (MQ=255) aaGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGc > 1:1494386/1‑130 (MQ=255) aaGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGc < 1:1236262/138‑1 (MQ=255) aaGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGc > 2:1236262/1‑138 (MQ=255) aaGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCTAAGCCGAGTGa > 2:103763/1‑150 (MQ=255) aaGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCTAAGCCGAGTGa > 2:1142423/1‑150 (MQ=255) aGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCGAGCTAGCTTGGCGGTCACGCTAAGCCGAGTGAg < 1:2411004/150‑1 (MQ=255) aGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCTAAGCCGAGTGAg > 1:1113734/1‑150 (MQ=255) aGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCTAAGCCGAGTGAg < 2:1561983/150‑1 (MQ=255) cgaaggTTGCTTCACATAGCGGGCACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAACCTACGTCATAAATNGCATTT‑GTGCAGAGACTGTAGGGTAGCGTTGACAGTGNCGGTTTNAAGCTAGCTTNGCGGTCACGCTAAGCCGAGTGAGGCANTc < 1:1751831/146‑1 (MQ=255) cTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTTGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCg > 1:1354061/1‑124 (MQ=255) ttCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGtt > 2:1023980/1‑94 (MQ=255) ttCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTCTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGtt < 1:1023980/94‑1 (MQ=255) tCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCTAAGCCGAGTGAGGCATTCGa < 1:312960/150‑1 (MQ=255) cGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCTAAGCCGAGTGAGGCATTCGAt < 2:705520/150‑1 (MQ=255) tGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCAGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTCGCTTGGCGGTCACGCTAAGCCGAGTGAGGCCTTCGATCCTg < 2:794785/150‑1 (MQ=255) gTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCTAAGCCGAGTGAGGCATTCGATCCTGCTa > 2:1615152/1‑150 (MQ=255) ttACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCTAAGCCGAGTGAGGCATTCGATCCTGCTAg < 2:1451783/150‑1 (MQ=255) | CGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTGCGCGAAATCAGACCTGCCTTGTGTG‑CCCGCTATGTGAAGCAACCTTCGGTTGCGTTACATAGCGGACACACAGCGTCGTGACTTGCCGGGGAAACTACTTGGT‑CGCGGCGTGTGGAGCAGAGACTGTAGGGGAGCGTTGACAGTGGCGGTTTCAAGCTAGCTTGGCGGTCACGCTAAGCCGAGTGAGGCATTCGATCCTGCTAG > NC_002947/743304‑743601 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |