| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,045,268 | T→C | 12.6% | intergenic (+38/+68) | PP_0905 → / ← PP_0906 | hypothetical protein/RND family multidrug transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,045,268 | 0 | T | C | 12.6% | 218.9 / 19.8 | 87 | intergenic (+38/+68) | PP_0905/PP_0906 | hypothetical protein/RND family multidrug transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/38); new base C (5/6); total (43/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.69e-01 | |||||||||||
CGCGTTGCCGCGGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAGGTAAA > NC_002947/1045122‑1045413 | cgcgTTGCCGCGGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCg < 1:1960257/150‑1 (MQ=255) gcgTTGCCGCGGGATCCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGAGTCCAGGGTTGCGGTCGCCGAGGTGAACCGTGCGGTAGCTGTAATAGTCAGAGGCCTCGCTATTGCgg < 2:1843668/150‑1 (MQ=255) gTTGCCGCGGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGTGATGAACGCTGGGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCgggg > 2:2099296/1‑150 (MQ=255) gTTGCCGCGGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCgggg > 1:587327/1‑150 (MQ=255) gTTGCCGCGGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCgggg < 1:892883/150‑1 (MQ=255) gcgGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCCCGCAATCGCGAGGCCTCTg < 1:402245/150‑1 (MQ=255) gcgGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGGCACAGGGATGAAGCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTg < 2:269486/150‑1 (MQ=255) gggATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGt > 2:1871779/1‑150 (MQ=255) ggATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGtt < 1:1528808/150‑1 (MQ=255) gATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGttt < 1:315877/150‑1 (MQ=255) aTGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGtttt < 1:2216316/150‑1 (MQ=255) gCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGtttttt < 2:1711722/150‑1 (MQ=255) aaaaCCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGc < 1:367256/150‑1 (MQ=255) aaaaCCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTGCCGGTTTGGCCTGCGGCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATCAACCGTGCGTTAGCTGGAAAGGCCAGAGGCCTCGCGCTTGCCGGGCCTTTGGTTTTTTGc > 2:966958/1‑150 (MQ=255) gcagcagcaGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGc > 2:250377/1‑150 (MQ=255) gcagGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGcc > 1:818354/1‑150 (MQ=255) agGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGGTGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCgg > 1:1834917/1‑150 (MQ=255) gCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAAAGGCCCCGCAATCGCGAGGCCtctg > 2:2093627/1‑122 (MQ=38) gCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAAAGGCCCCGCAATCGCGAGGCCTCTgg > 1:35457/1‑126 (MQ=38) gCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAAAGGCCCCGCAATCGCGAGGCCTCTgg < 2:35457/126‑1 (MQ=38) gCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAAAGGCCCCGCAATCGCGAGGCCTCTg < 1:2093627/125‑1 (MQ=255) gcgtgcCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTcgc < 1:1603226/150‑1 (MQ=255) cgagcCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTcgcg < 2:800525/150‑1 (MQ=255) cAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGTGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAgcccgc > 1:64488/1‑150 (MQ=255) aGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAgcccgcc < 2:1981903/150‑1 (MQ=255) ggACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAgcccgccc < 2:818354/150‑1 (MQ=255) tGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCg < 1:2099296/150‑1 (MQ=255) tGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCg < 2:889332/150‑1 (MQ=255) ttCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCa > 2:1964548/1‑150 (MQ=255) ttCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAAAGGCCCCGCAATCGCGAGGCCtc < 2:846492/90‑2 (MQ=37) ttCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAAAGGCCCCGCAATCGCGAGGCCtc > 1:846492/1‑89 (MQ=37) tCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGCGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTGCaa > 2:994185/1‑150 (MQ=255) ccTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTg < 1:787472/90‑1 (MQ=255) ccTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTg > 2:787472/1‑90 (MQ=255) tttGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGAt > 2:192906/1‑150 (MQ=255) ttGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGAtt < 1:2054823/150‑1 (MQ=255) gCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCa > 1:1940162/1‑119 (MQ=255) gCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCa < 2:1940162/119‑1 (MQ=255) ccTGCGTCAAGGGTTGTGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCATAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAg < 2:64488/150‑1 (MQ=255) ccTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTg > 2:247195/1‑147 (MQ=255) ccTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTg < 1:247195/147‑1 (MQ=255) cGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGc < 2:1834917/150‑1 (MQ=255) gTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAg < 2:2304358/125‑1 (MQ=255) gTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAg > 1:2304358/1‑125 (MQ=255) aaGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCggg < 1:980679/66‑1 (MQ=255) aaGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCggg > 2:980679/1‑66 (MQ=255) aaGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTg > 1:142439/1‑150 (MQ=255) gTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGgcgc > 2:425103/1‑150 (MQ=255) acaGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGCCTTATCCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTtgt > 2:575710/1‑150 (MQ=255) aGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGGCGGCCTG‑CTCGCGGGCAGCCCGCGCCAATGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTgc > 1:88799/1‑150 (MQ=255) aGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTgc > 2:396414/1‑150 (MQ=255) gggATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTgcg > 1:2421974/1‑150 (MQ=255) aTGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCca > 2:1146610/1‑150 (MQ=255) aaCCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCcagca > 2:764113/1‑150 (MQ=255) aaCCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCcagca < 1:1140418/150‑1 (MQ=255) aaCCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCcagca > 1:332000/1‑150 (MQ=255) cccTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAgg < 1:966958/150‑1 (MQ=255) cccTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAgg > 1:631444/1‑150 (MQ=255) cccTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAgg < 1:1146610/150‑1 (MQ=255) cccTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCAATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTTCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGACTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTCCGCcagcaga > 2:716022/1‑149 (MQ=255) ccTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAggg < 1:192906/150‑1 (MQ=255) cTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGATCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGgt < 1:1871779/150‑1 (MQ=255) ttAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCTTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGa < 1:1882521/150‑1 (MQ=255) tAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCTGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGCCCTCGCTTGC‑GGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGAt < 1:1860753/150‑1 (MQ=255) gCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGt > 1:1093297/1‑90 (MQ=255) gCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGt < 2:1093297/90‑1 (MQ=255) tGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCAc > 2:2149232/1‑150 (MQ=255) tGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCAc > 1:2052606/1‑150 (MQ=255) aaaaGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGc < 2:631444/150‑1 (MQ=255) aGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAac < 1:425103/150‑1 (MQ=255) aGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAac > 2:1447329/1‑150 (MQ=255) ccaaagGCCCCGCAATCGCGAGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAgg < 2:1374161/126‑1 (MQ=255) ccAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCgg > 1:1836003/1‑63 (MQ=255) ccAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCgg < 2:1836003/63‑1 (MQ=255) ccAAAGGCCCCGCAATCGCGAGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAgg > 1:1374161/1‑130 (MQ=255) caaagGCCCCGCAATCGCGAGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGc < 2:1209495/136‑1 (MQ=255) caaagGCCCCGCAATCGCGAGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGc > 1:1209495/4‑139 (MQ=255) agagGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACacaa > 1:60754/1‑150 (MQ=255) gagGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACacaaa > 1:185186/1‑150 (MQ=255) gagGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACacaaa > 1:807359/1‑150 (MQ=255) gCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGTGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTg < 2:1557432/100‑1 (MQ=255) gCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGTGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTg > 1:1557432/1‑100 (MQ=255) gCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACacaaacaa < 2:2396560/150‑1 (MQ=255) ccTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAg < 1:250377/150‑1 (MQ=255) cTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAgg > 1:1497657/1‑150 (MQ=255) cTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAgg > 1:1777709/1‑150 (MQ=255) cgATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAGGTaaa < 1:396414/150‑1 (MQ=255) | CGCGTTGCCGCGGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTC‑TTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAGGTAAA > NC_002947/1045122‑1045413 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |