| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,212,026 | C→G | 6.0% | Q149H (CAG→CAC) | PP_1060 ← | glutamate synthase large subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,212,026 | 0 | C | G | 6.0% | 425.6 / 14.1 | 133 | Q149H (CAG→CAC) | PP_1060 | glutamate synthase large subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (65/59); new base G (5/3); total (70/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.88e-01 | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
GGGCTGATGCTGCCCTCGCCGGTGTCATGGTGGAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAGGTTTGTCCGAGGCTTCGTTCTTCGCCCGGGCATA > NC_002947/1211883‑1212175 | gggCTGATGCTGCCCTCGCCGGTGTCATGGTGGAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGc > 2:1784753/1‑150 (MQ=255) gCTGATGCTGTCCTCGCCGGTGTCATGGTGGAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGccc > 1:298342/1‑150 (MQ=255) gCTGATGCTGCCCTCGCCGGTGTCATGGTGGAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGccc > 1:1893138/1‑150 (MQ=255) gCTGATGCTGCCCTCGCCGGTGTCATGGTGGAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGccc > 1:1807865/1‑150 (MQ=255) gCTGATGCTGCCCTCGCCGGTGTCATGGTGGAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGccc > 2:2173367/1‑150 (MQ=255) tGATGCTGCCCTCGCCGGTGTCATGGTGGAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCAc > 2:1442129/1‑150 (MQ=255) tGATGCTGCCCTCGCCGGTGTCATGGTGGAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCAc > 2:1163987/1‑150 (MQ=255) tgcCCTCGCCGGTGTCATGGTGGAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACcgacga < 2:527339/150‑1 (MQ=255) ccTCGCCGGTGTCATGGTGGAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGCGTGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGa < 1:1208309/150‑1 (MQ=255) ccTCGCCGGTGTCATGGTGGAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGa < 2:804773/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGTGTCATGGTGGAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGaca < 1:1274782/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGTGTCATGGTGGAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGaca < 2:1556221/150‑1 (MQ=255) cGGTGTCATGGTGGAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGa > 1:1450668/1‑150 (MQ=255) ggTGTCATGGTGGAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCCCAGCCGATGCCACCGaa < 2:1912949/150‑1 (MQ=255) ggTGTCATGGTGGAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGaa < 1:968809/150‑1 (MQ=255) tgtCATGGTGGAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGc < 1:293870/150‑1 (MQ=255) gtggAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGc < 1:193605/118‑1 (MQ=255) gtggAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGc > 2:193605/1‑118 (MQ=255) gtggAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGGCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCgg > 1:1819131/1‑150 (MQ=255) gtggAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCgg > 1:1690045/1‑150 (MQ=255) gtggAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCgg > 2:1771647/1‑150 (MQ=255) tggAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGGGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCggg > 1:777378/1‑150 (MQ=255) gAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTc > 2:200890/1‑150 (MQ=255) aaTTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGa < 1:1650969/129‑1 (MQ=255) aTTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTcagc < 2:385118/150‑1 (MQ=255) aTTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTcagc > 2:1994061/1‑150 (MQ=255) cccAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTg > 1:2435143/1‑135 (MQ=255) ccAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGACACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCg > 2:861266/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCg > 1:717481/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCg < 1:1890390/150‑1 (MQ=255) ccAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCg > 1:862270/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCg > 1:2313222/1‑150 (MQ=255) aGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGACCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGt > 1:639749/1‑150 (MQ=255) cTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGc < 1:2265774/150‑1 (MQ=255) ggCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCgg < 1:1276489/150‑1 (MQ=255) gcCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGgcg > 2:1356770/1‑150 (MQ=255) gcCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGgcg > 1:1473633/1‑150 (MQ=255) cccTGGTTGAGCGCAAGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACGCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGAGGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGgcgc > 2:1103858/1‑150 (MQ=255) ccTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCa > 2:1818644/1‑150 (MQ=255) cTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCAt > 2:698516/1‑150 (MQ=255) gggTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATg < 1:2173367/149‑1 (MQ=255) gTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGGGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGa < 2:777378/150‑1 (MQ=255) gcgcACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGc > 2:1811927/1‑150 (MQ=255) cgcACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATTGTGTGGcc < 2:148009/150‑1 (MQ=255) cACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGa < 2:1737645/150‑1 (MQ=255) gATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATaaa < 1:1895066/150‑1 (MQ=255) gATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATaaa > 2:387376/1‑150 (MQ=255) gATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATaaa < 2:298342/150‑1 (MQ=255) ggCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGCTGACGATAGACGCGGAATACGGCTGGCCGCAAATCGCCTTTCCGACGATGACACGGAAGCTGGGCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTc < 1:534973/150‑1 (MQ=255) aggggCGCTGAGCGAGCCGAACCTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGaa < 2:1078548/147‑1 (MQ=255) aTTNGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGaa > 2:1515349/1‑150 (MQ=255) aTTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACcgacga < 1:618138/86‑1 (MQ=255) aTTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACcgacga > 2:618138/1‑86 (MQ=255) tGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAAc < 2:327401/150‑1 (MQ=255) gcgcTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCg < 2:2371495/150‑1 (MQ=255) gcgagcCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACCCGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCat < 1:1994061/150‑1 (MQ=255) gcgagcCGAAACGCATTGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCat > 2:1603312/1‑150 (MQ=255) agcCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTc > 1:333911/1‑133 (MQ=255) agcCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTc < 2:333911/133‑1 (MQ=255) cGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGt > 1:915755/1‑150 (MQ=255) cGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGt < 1:1811927/150‑1 (MQ=255) gAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCAtata < 1:1188620/146‑1 (MQ=255) gAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCAtata > 2:1188620/1‑146 (MQ=255) gAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTc > 1:236310/1‑150 (MQ=255) aaaCTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCg < 2:617716/150‑1 (MQ=255) aTGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAgg > 2:1232621/1‑150 (MQ=255) aTGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAgg < 1:200890/150‑1 (MQ=255) aTGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAgg > 1:2106637/1‑150 (MQ=255) aTGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAgg < 1:859142/150‑1 (MQ=255) aTGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGCCGATCAgg < 2:1807865/150‑1 (MQ=255) cGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGcc > 2:2005917/1‑150 (MQ=255) cGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGcc > 2:1588264/1‑150 (MQ=255) ttGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCTGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACCTCGATCAGGGTGCCGAAAGGt > 2:280612/1‑150 (MQ=255) ttGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGAt < 2:824023/134‑1 (MQ=255) gAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGTCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCACGGAGCGGCCGATAACCTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAGGttt < 1:1011404/150‑1 (MQ=255) gAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATaaa > 1:642085/1‑105 (MQ=255) gAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATaaa < 2:642085/105‑1 (MQ=255) gAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAGGttt > 1:545153/1‑150 (MQ=255) gAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAGGttt > 2:1867028/1‑150 (MQ=255) gATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAGGTTTTTc < 1:2097760/150‑1 (MQ=255) tCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAGGTTTGTCCg > 2:1037002/1‑150 (MQ=255) gACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAGGTTTGTCCGAg < 1:1013465/150‑1 (MQ=255) aCGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAGGTTTGTCCGAgg > 1:666574/1‑150 (MQ=255) cgcgGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGc < 2:1415466/89‑1 (MQ=255) aTACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTTGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAGGTTTGTCCGAGGCTTCGtt < 1:1534857/150‑1 (MQ=255) tACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGAt < 1:332489/102‑1 (MQ=255) tACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAGGTTTGTCCGAGGCTTCGttc < 1:2068861/150‑1 (MQ=255) tcggtgggCCGCAGTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAg > 2:110254/7‑129 (MQ=255) tcggtgggCCGCAGTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAg < 1:110254/123‑1 (MQ=255) ggtgggCCGCAGTGCGGCCAGCCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAGGTTTGTc < 1:1957516/130‑1 (MQ=255) ggCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAACCCCTACCCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAGGTTTGTCCGAGGCTTCGttcttc < 1:1356770/150‑1 (MQ=255) ggCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAGGt > 2:47665/1‑129 (MQ=255) ggCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAGGt < 1:47665/129‑1 (MQ=255) ggCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAGGTTTGTCCGAGGCTTCGttcttc < 2:2313222/150‑1 (MQ=255) gtgggCCGCAGTGCGGCCAGCCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGAACAACCCGAGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAGGTTTGTCCGAGGCTTCGTTCTTCg > 1:2126729/4‑150 (MQ=255) tgggCCGCAGTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGaaa > 1:57934/3‑124 (MQ=255) tgggCCGCAGTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGaaa < 2:57934/122‑1 (MQ=255) gCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAGGTTTGTCCGAGGCTTCGTTCTTCGCCCg > 1:1445199/1‑150 (MQ=255) gCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGc > 1:1238143/1‑71 (MQ=255) cTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTTCCGAAAGGTTTGTCCGAGGCTTCGTTCTTCGCCCGGGCATa < 2:1484411/150‑1 (MQ=255) | GGGCTGATGCTGCCCTCGCCGGTGTCATGGTGGAAATTGCCCAGCTTGGCGCCCTGGTTGAGCGCACGGATGGCATTGGCGCTGAGCGAGCCGAAACTCATGGCCGAAATGTTGAAGATCGACGCGGAATACGGCTGGCCGCACTGCGGCCCACCGACGATGACACGGAAGCTGGTCGGGTCAGCCAGCGGTGCCGGGCGCATGGAGTGGCCGATAAACTCGAAACCGGATTCATATACGTCGATCAGGGTGCCGAAAGGTTTGTCCGAGGCTTCGTTCTTCGCCCGGGCATA > NC_002947/1211883‑1212175 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |