Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,237,662 | C→T | 7.1% | L151L (CTG→CTA) ‡ | PP_1078 ← | ABC transporter ATP‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,237,662 | 0 | C | T | 7.1% | 261.4 / 5.4 | 92 | L151L (CTG→CTA) ‡ | PP_1078 | ABC transporter ATP‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/45); new base T (2/5); total (42/50) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.48e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAGGCAATGTT > NC_002947/1237514‑1237811 | aGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCa < 1:1067445/150‑1 (MQ=255) gCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGTTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAgc < 1:61107/150‑1 (MQ=255) ttcCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCg < 1:978384/150‑1 (MQ=255) tcCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGcctgc < 1:2301067/150‑4 (MQ=255) cTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCTGGCGCCCGAGc < 2:1295036/150‑1 (MQ=255) cTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGc < 1:1028529/150‑1 (MQ=255) cTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCCCGGGCGCTGGCGCCCGAGc < 2:633672/150‑1 (MQ=255) tCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAgg > 1:558320/1‑150 (MQ=255) gTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGAATTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGaca > 1:1245960/1‑150 (MQ=255) tGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCCCGGGCGCTGGCGCCCGAGcc > 1:2084221/1‑140 (MQ=255) tGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCCCGGGCGCTGGCGCCCGAGcc < 2:2084221/140‑1 (MQ=255) aCCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGt > 1:1417861/1‑150 (MQ=255) ccAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAAGGGCTCGTCCAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGtt > 2:106387/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTgctgct > 2:803533/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGctgctg < 1:287277/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTgg > 2:2398061/1‑150 (MQ=255) gTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGccgccg < 1:794372/150‑1 (MQ=255) cgcgGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCAACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGGGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACa > 2:2161057/1‑150 (MQ=255) cgGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCTCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGc < 1:253707/150‑1 (MQ=255) cgGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCg > 2:200517/1‑113 (MQ=255) cgGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCg < 1:200517/113‑1 (MQ=255) cgGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCTAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGc > 1:1293515/1‑150 (MQ=255) tGAGGATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGTAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTCCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCg < 2:1191648/150‑1 (MQ=255) gagaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCt < 2:1990813/143‑1 (MQ=255) gagaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCt > 1:1990813/1‑143 (MQ=255) gagaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCgg < 2:976323/150‑1 (MQ=255) gagaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCgg > 2:1245685/1‑150 (MQ=255) gagaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCgg < 1:803533/150‑1 (MQ=255) gagaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCgg > 2:2077692/1‑150 (MQ=255) gagaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCgg < 2:2197530/150‑1 (MQ=255) gagaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCgg < 1:1661861/150‑1 (MQ=255) agaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGtt > 1:1581386/1‑121 (MQ=255) agaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGtt < 2:1581386/121‑1 (MQ=255) agaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCggg > 2:1703090/1‑150 (MQ=255) agaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCggg < 2:1417861/150‑1 (MQ=255) aTGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTTAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTaa < 1:1150273/150‑1 (MQ=255) tCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCg < 2:1674061/98‑1 (MQ=255) tCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCg > 1:1674061/1‑98 (MQ=255) gcgAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAAcgccc > 1:1847166/1‑150 (MQ=255) aaCCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCGCGTCGACGTTGGTGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTCAcgcccgcc < 2:235086/150‑1 (MQ=255) aaCCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAAcgcccgcc < 1:1672156/150‑1 (MQ=255) tCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGc > 2:763037/1‑150 (MQ=255) tCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGa > 1:2331215/1‑150 (MQ=255) gcgcCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGttt < 1:49688/150‑1 (MQ=255) gcAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCt > 2:1890469/1‑150 (MQ=255) gCTCCCCGGCGGGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCa < 1:1285190/150‑1 (MQ=255) 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gCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATAc < 2:1103823/150‑1 (MQ=255) gCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGCGGGTGTTTGGCGATAc > 2:1637033/1‑150 (MQ=255) ggCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTACTGCCGGCAGACGGCAAACTAATGCCGGAATCGCGCGCGGTTTGAG‑TTATTATGTATCGGCGCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCa > 2:866122/1‑150 (MQ=255) gCTCGGGCGCTGGCGCCCGAGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGt > 2:235117/1‑131 (MQ=255) gCTCGGGCGCTGGCGCCCGAGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGt < 1:235117/131‑1 (MQ=255) gCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCaa < 1:1916653/150‑1 (MQ=255) cTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGCTaaaaaa > 2:854616/1‑145 (MQ=255) cTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCaaa < 1:2398061/150‑1 (MQ=255) cTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCaaa < 1:1360044/150‑1 (MQ=255) tCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAg < 1:1454629/150‑1 (MQ=255) cGGGCGCTGGCGCCCGAGCCGGGGCGACACGTTGCTGCTTGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAgg < 1:123564/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAGGCaa < 2:847415/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCCGAGACGGGGCGACACGTTGCTGCTGGCAGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑AACAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAGGCAATGtt > 2:2334286/1‑150 (MQ=255) | AGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAGGCAATGTT > NC_002947/1237514‑1237811 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |