Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 1,521,033 | 0 | T | A | 5.4% | 342.5 / 7.9 | 111 | L83* (TTG→TAG) ‡ | murD | UDP‑N‑acetylmuramoylalanine‑‑D‑glutamate ligase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (57/48); new base A (4/2); total (61/50) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.88e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.68e-01 |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TGCCTTTGCGGTCGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGAAATG > NC_002947/1520884‑1521181 | tGCCTTTGCGGTCGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCtt < 2:2171025/150‑1 (MQ=255) gCCTTTGCGGTCGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGCAGTTCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTg < 1:1345397/150‑1 (MQ=255) gCCTTTGCGGTCGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGCCTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTg < 1:53641/150‑1 (MQ=255) 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2:2372719/1‑150 (MQ=255) tACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCTATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTc > 2:1458514/1‑150 (MQ=255) cGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGc > 2:1050397/1‑73 (MQ=255) cGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGc < 1:1050397/73‑1 (MQ=255) tgcaaggccGGCGTGGCCAAGGCCAGGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGAGATATAGCGGTGTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCacg > 1:290007/8‑150 (MQ=255) tGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCacga < 1:831835/150‑1 (MQ=255) ggccGGCGTGGCCAAGGCCAGGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTc < 2:136254/84‑1 (MQ=37) ggccGGCGTGGCCAAGGCCAGGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTc > 1:136254/3‑86 (MQ=37) ggccGGCGTGGCCAAGGCCAGGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCt > 2:1036930/3‑150 (MQ=255) ccccGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCt > 2:2184572/1‑150 (MQ=255) ccccGGCATGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGAGACACGGTGTCTGGCGACGATCTTCTGTTTGCTCTCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACACCAAGAGCACCGTCACGACGCt > 1:290983/1‑150 (MQ=255) cccGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTg < 2:1603342/150‑1 (MQ=255) tggcctTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTAATACGGCCTATGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTg > 1:746429/1‑150 (MQ=255) cctTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGaaa < 2:1459053/150‑1 (MQ=255) cctTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGaaa < 2:690659/150‑1 (MQ=255) ctTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGAAAt < 1:1315547/150‑1 (MQ=255) attGGCCACGACGAACTTGCAGCAAGCTACCGCACGTGGCGTTAATCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGACCGTTGCGAAGAGCGTCGCGAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGAAAt > 2:2366342/2‑150 (MQ=255) ttGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGAAATg < 2:415064/150‑1 (MQ=255) ttGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGAAATg < 1:2372719/150‑1 (MQ=255) | TGCCTTTGCGGTCGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGAAATG > NC_002947/1520884‑1521181 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |