| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,576,798 | G→C | 5.9% | intergenic (‑276/+37) | galP‑II ← / ← ttgC | porin‑like protein/efflux pump outer membrane protein TtgC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,576,798 | 0 | G | C | 5.9% | 295.7 / 7.3 | 96 | intergenic (‑276/+37) | galP‑II/ttgC | porin‑like protein/efflux pump outer membrane protein TtgC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (51/39); new base C (3/3); total (54/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 | |||||||||||
GGCAATTCGCCGCAAACGGAACGGGGCGATAATCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGACCTCGCTGGTCAGCTGCGACA > NC_002947/1576650‑1576944 | ggCAATTCGCCGCAAACGGAACGGGGCGATAATCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGa > 2:503869/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGCAAACGGAACGGGGCGATAATCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAgg > 1:848227/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGCAAACGGAACGGGGCGATAATCGAACGGAATGTGCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAgg < 2:440803/150‑1 (MQ=255) gcAAACGGAACGGGGCGATAATCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGc < 1:703708/150‑1 (MQ=255) gcAAACGGAACGGGGCGATAATCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGc > 1:2087950/1‑150 (MQ=255) cAAACGGAACGGGGCGATAATCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCt > 1:1562068/1‑150 (MQ=255) acggaacggGGCGATAATCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTc < 2:60227/150‑1 (MQ=255) cggaacggGGCGATAATCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCt > 1:1061956/1‑150 (MQ=255) cggaacggGGCGATAATCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCt < 2:1949165/150‑1 (MQ=255) cggaacggGGCGATAATCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGAGAAGGGTGGGCTTTCt > 1:1061969/1‑150 (MQ=255) cggaacggGGCGATAATCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCCTTATCGGTGGGCtttgt < 2:1918665/150‑3 (MQ=38) ggaacggGGCGATAATCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCCTTATCGGTGGGCtttgtt < 2:1050026/150‑4 (MQ=38) gaacggGGCGATAATCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGAGGAAACAGCCGCGGCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGc > 2:2300894/1‑150 (MQ=255) acggGGCGATAATCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCtt > 2:1456951/1‑150 (MQ=255) cggGGCGATAATCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCttt < 1:1043152/150‑1 (MQ=255) gggCGATAATCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCCCAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTg > 1:950696/1‑150 (MQ=255) gggCGATAATCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTg < 2:1470226/150‑1 (MQ=255) gATAATCGAACGGAATATACCGGTTGGAAAAGCACCCTTCTGGCACGGCCTCTGCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGCTTGCGCCCAGCCGCCACCGCCCGTAAAAAAAAAGCCCACCCAAAAAGGTCCGCTTTCTGCCTTTCcaac > 2:251221/1‑150 (MQ=255) tCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGcaacaa > 2:1827/1‑147 (MQ=255) tCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGcaacaa < 1:1827/147‑1 (MQ=255) tCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGc > 2:932574/1‑150 (MQ=255) aaCGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTc < 1:1887001/130‑1 (MQ=255) aaCGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTc > 2:1887001/1‑130 (MQ=255) tGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCt > 2:916208/1‑150 (MQ=255) ccGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCg < 1:1233408/150‑1 (MQ=255) ggttggttAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGgt < 1:1526156/150‑1 (MQ=255) gttggttAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGt < 1:2260049/108‑1 (MQ=255) gttggttAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGt > 2:2260049/1‑108 (MQ=255) gttggttAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAg > 2:1699955/1‑140 (MQ=255) gttggttAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAg < 1:1699955/140‑1 (MQ=255) gttggttAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGgtg > 1:2175822/1‑150 (MQ=255) gttAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTc < 1:932574/150‑1 (MQ=255) ttAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCtttt > 2:802367/1‑118 (MQ=255) ttAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCtttt < 1:802367/118‑1 (MQ=255) ttAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTcc > 1:2050291/1‑150 (MQ=255) ttAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTcc > 1:433224/1‑150 (MQ=255) aataaCTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCAc > 1:48995/1‑150 (MQ=255) taaCTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCt > 1:2436361/1‑108 (MQ=255) taaCTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCt > 1:2444075/1‑108 (MQ=255) taaCTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCt < 2:2436361/108‑1 (MQ=255) taaCTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCt < 2:2444075/108‑1 (MQ=255) tcttctGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGc < 2:1061956/150‑1 (MQ=255) tcttctGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTGTCCAACGATGc < 2:1061969/150‑1 (MQ=255) ttctGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTc < 2:1985960/131‑1 (MQ=255) ttctGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTc > 1:1985960/1‑131 (MQ=255) ggggCGGCCTTTTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCGGTAAAAACAAAGCCCCCCGCTAAGGGTGGGCTCCCTGCTTTTGCAATTCGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCctgctg < 1:1354563/150‑1 (MQ=255) gggCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAg > 1:575015/1‑111 (MQ=255) gggCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAg < 2:575015/111‑1 (MQ=255) ggcCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAGGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTgg < 1:1704750/150‑1 (MQ=255) gcCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTg < 2:1127758/148‑1 (MQ=255) gcCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTg > 1:1127758/1‑148 (MQ=255) gcCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGATTAAGCAAACCGGAAAGTTGTAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGc > 1:1616856/1‑150 (MQ=255) gcCTCGTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGc > 2:1174070/1‑150 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCATCCTTTCGGTGTTTCAACCGATGTCTGCTGGTTggtgt > 1:111994/1‑147 (MQ=255) gagcgGGTTTACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCCCCGATGCGTGCTGGTGGGCCTGccc > 2:1097141/3‑150 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCgg > 2:293229/1‑150 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTc < 2:433224/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGt < 1:503869/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTATCATTTTCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTa > 1:24161/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTAc < 1:1456951/150‑1 (MQ=255) ccTACGACGGCTTGCGCCTAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGc < 2:506757/150‑1 (MQ=255) cTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGcc > 1:1667513/1‑150 (MQ=255) tACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCCTTATCGGTGGGCttt < 1:197805/65‑1 (MQ=25) tACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCCTTATCGGTGGGCttt > 2:197805/1‑65 (MQ=25) 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ttGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAgc < 1:916208/150‑1 (MQ=255) ttGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAgc > 2:1939048/1‑150 (MQ=255) cccAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCtt < 2:617310/150‑1 (MQ=255) cccAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCtt > 2:368983/1‑150 (MQ=255) ccAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTg > 1:507296/1‑150 (MQ=255) aGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCgg > 1:2321301/1‑81 (MQ=255) aGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCgg < 2:2321301/81‑1 (MQ=255) aGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTa > 2:113043/1‑150 (MQ=255) aGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTa < 1:2300894/150‑1 (MQ=255) acaGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTg > 1:2026258/1‑150 (MQ=255) aGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGAc < 2:48995/150‑1 (MQ=255) gCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCACGCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGACCt > 2:2406844/1‑150 (MQ=255) gCAGTAAAAACAAAGCACACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGACCt > 2:2041841/1‑150 (MQ=255) tAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGACCTCGCt > 1:1708436/1‑150 (MQ=255) tAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGACCTCGCt < 2:848227/150‑1 (MQ=255) tAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGACCTCGCt > 1:676132/1‑150 (MQ=255) aaagaCAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAATGCTGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTTGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGACCTCGCTg < 2:950696/150‑1 (MQ=255) aaaaaCAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGACCTCGCTg > 2:2298075/1‑150 (MQ=255) aaaaaCAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGACCTCGCTg < 2:2175822/150‑1 (MQ=255) gaaaGCCCACCCTTATCGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATACCGGGGGGTTGGCATACCACCTATAATAGCGCCAGTTAGGGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGACCTCGCTGGTCAg > 1:1116639/2‑150 (MQ=255) tctcACCGATAAGGGTGGGTTTTCGGAGCGCAGCACGAGCCCGAGCAGCCGTTCGGGGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGACCTCGCTGGTCAGCTGc < 2:259337/147‑1 (MQ=255) gCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGACCTCGCTGGTCAGCTGc > 2:431931/1‑150 (MQ=255) gCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGACAAATCAGCCTTTCGGTGTTGCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGACCTCGCTGGTCAGCTGc > 2:1466959/1‑150 (MQ=255) aCCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGACCTCGCTGGTCAGCTGCGaga > 1:259337/1‑148 (MQ=255) aCCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTATCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGACCTCGCTGGTCAGCTGCGACa > 2:1230304/1‑150 (MQ=255) cGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGAc < 1:1981112/128‑1 (MQ=255) cGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGAc > 2:1981112/1‑128 (MQ=255) | GGCAATTCGCCGCAAACGGAACGGGGCGATAATCGAACGGAATGTTCCGGTTGGTTAATAACTCTTCTGGGGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCTTGCGCCCAGCCGGCACAGGCAGTAAAAACAAAGCCCACCGATAAGGGTGGGCTTTCTGCTTTTGCAACAAGGCCGATCAGCCTTTCGGTGTTTCCACCGATGCCTGCTGGTTGGCCTGCCCGGTCTGCTCGTACCAGCCACCGCCAAGCGCCTTGTACAGGTTGACCTCGCTGGTCAGCTGCGACA > NC_002947/1576650‑1576944 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |