Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,693,727 | C→G | 5.1% | P52A (CCT→GCT) ‡ | PP_1489 → | CheW domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,693,727 | 0 | C | G | 5.1% | 316.3 / 6.9 | 99 | P52A (CCT→GCT) ‡ | PP_1489 | CheW domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (48/45); new base G (2/3); total (50/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.31e-01 |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
GACTTGCAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCC > NC_002947/1693580‑1693874 | gACTTGCAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcct > 1:2045667/1‑150 (MQ=255) ttGCAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcctgcc < 1:1609449/150‑1 (MQ=255) cAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTgg < 2:2122441/150‑1 (MQ=255) ctggaagcACCGCCTGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAGGTGCCTggg < 2:129729/144‑1 (MQ=255) aaCTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcctgcctg > 1:2226492/1‑148 (MQ=255) aaCTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcctgcctg < 2:2226492/148‑1 (MQ=255) gcgcACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTcgc < 2:320727/150‑1 (MQ=255) gcgcACCGCGCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAGGTGCCTgggcgat < 1:1942271/150‑5 (MQ=255) gcACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCgg < 1:1836661/150‑1 (MQ=255) cGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCAt > 1:1919252/1‑150 (MQ=255) cgAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGCGCGCCCCGTTTGGCCCTGAGCTTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATc < 2:1728105/150‑1 (MQ=255) cgAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATAAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATc < 2:967193/150‑1 (MQ=255) acacCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTg < 1:38850/150‑1 (MQ=255) acacCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTg < 2:127551/150‑1 (MQ=255) acCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcctgcctg < 1:2321034/122‑1 (MQ=255) acCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcctgcctg > 2:2321034/1‑122 (MQ=255) acCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGc > 2:643759/1‑150 (MQ=255) ccGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTAGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTGAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGcc > 2:1210678/1‑150 (MQ=255) aGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGc > 1:484098/1‑150 (MQ=255) ggggCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTg > 2:1709811/1‑150 (MQ=255) gTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGc < 1:1676547/126‑1 (MQ=255) gTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGc > 2:1676547/1‑126 (MQ=255) gTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGt > 1:687344/1‑150 (MQ=255) ccTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGAGTGTTCGGGGCCATCTAAGTTTTTCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCAt < 1:1742358/150‑1 (MQ=255) tttCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCtt < 1:715450/150‑1 (MQ=255) tCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTgc < 2:85115/150‑1 (MQ=255) aTCAGAGCGCAGCGGTTTGCGCTGACCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGCCCTTgccgcc > 2:275935/1‑150 (MQ=255) tCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCt > 2:974586/1‑150 (MQ=255) tCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCt < 2:2045667/150‑1 (MQ=255) agagCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTg < 2:687344/150‑1 (MQ=255) agCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAg < 2:1756587/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGc > 1:1030608/1‑150 (MQ=255) cAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCttt > 2:454265/1‑150 (MQ=255) aGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTg > 1:2076797/1‑150 (MQ=255) aGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTg > 1:1529648/1‑150 (MQ=255) aGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTg < 2:1484300/150‑1 (MQ=255) aGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGCGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTg < 1:1249218/150‑1 (MQ=255) ttttGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGccg > 1:2266015/1‑149 (MQ=255) ttttGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCa > 1:329551/1‑150 (MQ=255) ccTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGa > 2:1722274/1‑120 (MQ=255) cTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCcggcg > 2:1086712/1‑150 (MQ=255) tGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCgg > 1:204504/1‑111 (MQ=255) tGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCgg < 2:204504/111‑1 (MQ=255) tGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCcggcgg > 2:1819193/1‑150 (MQ=255) tGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCAGTCGGTGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCcggcgg > 1:1207653/1‑150 (MQ=255) aGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTg > 1:402791/1‑150 (MQ=255) 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gAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCAcc > 1:2340320/1‑150 (MQ=255) gAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCAACTCATCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGATGCAACGCAcc < 1:745328/150‑1 (MQ=255) aGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCa < 2:1529648/150‑1 (MQ=255) ggTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCGTGGGCCATCCGGCGGTGCAACGCACCAg > 2:390129/1‑150 (MQ=255) gTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGc > 1:1523839/1‑150 (MQ=255) 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tCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCa < 1:590831/124‑1 (MQ=255) tCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCa > 2:590831/1‑124 (MQ=255) aaGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGcc > 1:849055/1‑150 (MQ=255) aaGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGcc > 2:570396/1‑150 (MQ=255) gCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGtt < 2:1049705/79‑1 (MQ=255) gCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGtt > 1:1049705/1‑79 (MQ=255) ccGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTgccgcc > 2:1354568/1‑99 (MQ=255) ccGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTgccgcc < 1:1354568/99‑1 (MQ=255) ccGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgctg < 2:2076797/150‑1 (MQ=255) cgcgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgctgg < 2:1030608/150‑1 (MQ=255) cgcgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCAGGcgggtgctgg < 1:1086712/150‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCAc < 1:2430477/128‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCAc > 2:2430477/1‑128 (MQ=255) cgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgctggtg < 2:1919252/150‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCAGGcgggtgctggtg < 1:1373685/150‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCAGGcgggtgctggtg < 1:1381948/150‑1 (MQ=255) aGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCAGGCgggtgctggtgcgtt < 1:390129/150‑4 (MQ=255) gCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGGCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTa > 2:1850453/1‑150 (MQ=255) cTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGCGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGa > 2:453039/1‑150 (MQ=255) aaGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCa > 2:1605803/1‑140 (MQ=255) aaGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCa < 1:1605803/140‑1 (MQ=255) aaGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAggc > 1:1543915/1‑150 (MQ=255) aaGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAggc > 2:500112/1‑150 (MQ=255) aaGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAggc > 1:2358129/1‑150 (MQ=255) aaGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAggc < 2:1523839/150‑1 (MQ=255) aaGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCAGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAggc < 1:1709811/150‑1 (MQ=255) aGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAggcg > 2:967044/1‑150 (MQ=255) gATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCt > 1:1082870/1‑150 (MQ=255) tCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGc > 2:486316/1‑150 (MQ=255) cccAGGCAGGTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTAc < 1:1661071/134‑1 (MQ=255) cccAGGCAGGTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTAc > 2:1661071/1‑134 (MQ=255) ccAGGCAGGTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCGGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCt > 2:1209476/1‑150 (MQ=255) ccAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCt > 1:1536048/1‑150 (MQ=255) ccAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCt > 2:230005/1‑150 (MQ=255) aGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTg < 2:329551/150‑1 (MQ=255) ggCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTgg < 1:1424207/150‑1 (MQ=255) cACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGcc < 1:1819193/150‑1 (MQ=255) cACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCACCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCCAGGCGGCCTGCAGCTTGGcc < 1:1210678/150‑1 (MQ=255) | GACTTGCAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCC > NC_002947/1693580‑1693874 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |