Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,871,462 | C→T | 5.4% | Q232* (CAG→TAG) | cobC → | adenosylcobinamide‑phosphate synthase subunit beta |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,871,462 | 0 | C | T | 5.4% | 317.9 / 5.0 | 109 | Q232* (CAG→TAG) | cobC | adenosylcobinamide‑phosphate synthase subunit beta |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (52/51); new base T (3/3); total (55/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.02e-01 |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CGGGGCTGATCGTGCTGCGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCAGTACGTGCGTAGCGAGCATG > NC_002947/1871313‑1871609 | cGGGGCTGATCGTGCTGCGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGccc < 2:469944/150‑1 (MQ=255) ggggCTGATCGTGCTGCGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTCGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCCCCTGGCCGAGCCGCTCGGCCCCTGGACCGTCCACGGCCCGCCCCGGGTGCTGGcccc > 1:1007304/1‑149 (MQ=255) gggCTGATCGTGCTGCGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAg < 1:1886898/150‑1 (MQ=255) gggCTGATCGTGCTGCGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAg < 1:1481132/150‑1 (MQ=255) aTCGTGCTGCGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGc > 1:634518/1‑150 (MQ=255) aTCGTGCTGCGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGc > 2:2426239/1‑150 (MQ=255) tCGTGCTGCGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCTGGGCCAGca > 1:1596422/1‑149 (MQ=255) cGTGCTGCGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCTGGGCCAGcac < 1:1447341/150‑3 (MQ=255) cGTGCTGCGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCt < 1:1455892/150‑1 (MQ=255) gTGCTGCGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGTACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCTGGGCCAGcccc < 2:1596422/150‑3 (MQ=255) gTGCTGCGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCTGGGCCAGcacc < 1:1778612/150‑4 (MQ=255) gctgcGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGAAGCCGAACACAGCTTGCGTTTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTc > 1:2124833/1‑150 (MQ=255) gctgcGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCGGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTc < 2:418805/150‑1 (MQ=255) tgcGCTCGTTTGACGGTATCTTCGGCTTGGCCGGCGTTCGCCTGGTCTGCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCtg > 1:1263693/1‑150 (MQ=255) gcgcTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCtga < 1:700929/150‑1 (MQ=255) cgcTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCATCTCAACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCtgat < 1:2274344/150‑1 (MQ=255) cTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCtgatga < 1:1071020/150‑1 (MQ=255) cTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCtgatga < 2:673491/150‑1 (MQ=255) cGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGGCTGGGGTTCGTTGCCGCCGAACACTGGTTGCGGCTGTGCCGGGTCGGGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCATCGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATgaga < 2:217528/150‑1 (MQ=255) cGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATgaga < 2:1642929/150‑1 (MQ=255) gTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGAc > 2:2270578/1‑150 (MQ=255) tGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGc > 2:641361/1‑150 (MQ=255) cAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAg < 1:2216712/124‑1 (MQ=255) cAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAg > 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ggCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAg < 2:2047884/150‑1 (MQ=255) gCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGGTTGCCTGCCGCCGCAGCCGGCGAGCTGCTGCGCCTGGCCGCCCTGCTGGCCCCCTAGACCACCACGGGCGCGCCACGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCGGATGACACTGGCCAGTGGGCGCaag > 2:587300/1‑148 (MQ=255) cTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGc > 1:1380870/1‑150 (MQ=255) ttGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCTACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGcc < 2:2377131/150‑1 (MQ=255) ttGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGc > 2:154436/1‑117 (MQ=255) ttGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGc < 1:154436/117‑1 (MQ=255) cGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACg < 2:759633/150‑1 (MQ=255) cGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGACCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACg > 1:55089/1‑150 (MQ=255) tGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCtgtg > 2:730061/1‑150 (MQ=255) gcCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGtgctg < 2:2227969/150‑1 (MQ=255) cTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGtgctgct < 1:2270578/150‑1 (MQ=255) cTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCNGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGtgctgct > 1:420566/1‑150 (MQ=255) gggCTTCGTTGCCTCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCNGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGtgctgctgc < 1:959165/150‑1 (MQ=255) gCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTgcca > 1:1489387/1‑150 (MQ=255) ttCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTgccagc < 1:2426239/150‑1 (MQ=255) ttCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTgcca > 2:1613842/1‑148 (MQ=255) gTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGccagccag > 1:813106/1‑150 (MQ=255) tGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGAACCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCg < 1:1991471/150‑1 (MQ=255) cgAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTgc < 1:239982/150‑1 (MQ=255) cgAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGA‑CCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTgcg < 1:641262/150‑1 (MQ=255) gAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTgcg < 1:641361/150‑1 (MQ=255) 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tCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAgtg > 1:241868/1‑150 (MQ=255) ggCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAgtggt > 1:1400343/1‑150 (MQ=255) gCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAgtggtg < 2:55089/150‑1 (MQ=255) gCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAgtggtg > 1:2403390/1‑150 (MQ=255) ccccTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAGtggtgg > 2:2439168/1‑150 (MQ=255) cccTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCtt < 1:994512/108‑1 (MQ=255) cccTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTg > 2:188049/1‑127 (MQ=255) cccTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTg < 1:188049/127‑1 (MQ=255) gACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGa < 2:1947732/150‑1 (MQ=255) cGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCt > 2:952106/1‑150 (MQ=255) cGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCt > 2:1808692/1‑150 (MQ=255) cGTCAACGGCCCGAACCGGGGGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCCGGCAGCTGTCTTCCAGCAGTTTCCTGCTGCCAGCTAGCGGCTTGTGCATGTGTTGTCTCTCGTGCC‑‑CCTTGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCt < 1:2388886/150‑1 (MQ=255) aaCGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCATTCCAGCCTGTATGATGAGACTGCCCAGCGCGGGCAGGCTCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGGACGTGTTG‑CGC‑AGTGTCGGCCTGGCGCATAGAGTTGGCTGCGACCTGTTc < 2:420566/150‑1 (MQ=255) aaCGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTc < 1:233252/150‑1 (MQ=255) cGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCa < 1:2439168/150‑1 (MQ=255) cccGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGACTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGGCCTGTTCCAGTa > 1:30073/1‑150 (MQ=255) ccGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCAGtcc > 1:402543/1‑148 (MQ=255) ccGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCAGTAc > 2:2003385/1‑150 (MQ=255) cccGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCAGTACGTGc < 1:1271273/150‑1 (MQ=255) ccGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCAGTACGTGCg > 1:2222521/1‑150 (MQ=255) agacaggCTGGCCTGGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCAGTACGTGCg > 1:1110971/7‑150 (MQ=255) cGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCg > 1:335903/1‑106 (MQ=255) tGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCAGTACGTGCGTAGCg < 2:2124833/150‑1 (MQ=255) ggCTGGCCTGGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCAGTACGTGCGTAGCg > 1:1248291/2‑150 (MQ=255) gCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCACACAACGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCAGTACGTGCGTAGCGa < 2:1380870/150‑1 (MQ=255) cccAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTg‑cg > 2:2215354/1‑88 (MQ=255) cccAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTg‑cg < 1:2215354/88‑1 (MQ=255) | CGGGGCTGATCGTGCTGCGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTG‑CGC‑AGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCAGTACGTGCGTAGCGAGCATG > NC_002947/1871313‑1871609 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |