| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,051,108 | T→A | 6.9% | intergenic (‑63/+23) | PP_1825 ← / ← PP_1826 | hypothetical protein/isochorismatase family hydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,051,108 | 0 | T | A | 6.9% | 209.6 / 3.8 | 70 | intergenic (‑63/+23) | PP_1825/PP_1826 | hypothetical protein/isochorismatase family hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/33); new base A (2/3); total (34/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCCGGCCGCCAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCG > NC_002947/2050965‑2051252 | gccggccgCCAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCggg > 1:70358/1‑150 (MQ=255)gccggccgCCAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCcgg < 2:1677364/150‑1 (MQ=255)gccggccgCCAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCAGCCggg < 1:224404/150‑1 (MQ=255) gccAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCt > 1:1959495/1‑150 (MQ=255) gccAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCCCGGCAGCTCGGATTAATGCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCt < 2:211597/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGc < 2:1594258/150‑1 (MQ=255) ggcgggcgCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCaa < 1:1673818/150‑1 (MQ=255) gcgggcgCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGCCCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAg > 1:2407062/1‑150 (MQ=255) gcgggcgCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAg < 1:104364/150‑1 (MQ=255) cgcCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCt < 1:2078957/150‑1 (MQ=255) gcCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTc > 1:2297887/1‑150 (MQ=255) cAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGAt > 1:1963796/1‑150 (MQ=255) cAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGAt > 1:2389646/1‑150 (MQ=255) ttACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAg < 2:2389646/150‑1 (MQ=255) ttCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCgg > 1:1674029/1‑150 (MQ=255) gggCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCACAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGc > 2:2005597/1‑150 (MQ=255) aGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCa > 1:204613/1‑150 (MQ=255) gcgcTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAg < 2:2113297/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAg > 1:1150104/1‑150 (MQ=255) ttGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGaa < 2:599241/150‑1 (MQ=255) gCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGtt < 1:299325/150‑1 (MQ=255) tCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTc < 1:552373/150‑1 (MQ=255) cTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCAt > 2:2315621/1‑150 (MQ=255) gCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCa > 1:1069535/1‑150 (MQ=255) gCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCa > 2:2272066/1‑150 (MQ=255) gCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCa > 1:554623/1‑150 (MQ=255) tttAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCgg < 2:1026106/80‑1 (MQ=255) tttAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCgg > 1:1026106/1‑80 (MQ=255) tttAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGcctgatcag > 1:1097353/1‑143 (MQ=255) gCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACg > 2:1674293/1‑144 (MQ=255) gCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACg < 1:1674293/144‑1 (MQ=255) cTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGCGCGCCAACCCAGGGAAATAGCCAGCCGCCACGGctcttt > 2:1096774/1‑145 (MQ=255) ttCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTc < 2:1412497/150‑1 (MQ=255) gtgcttCCGCTCTCCGGGGTGGGTAGCCCGAAGTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCCGTGGGGGCCACGCACGCGCAGTTGTAAGCCATCACGGCCATTTc < 2:228365/146‑1 (MQ=255) ccGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTg < 1:1096774/150‑1 (MQ=255) gCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCt > 1:2311286/1‑73 (MQ=255) gCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCt < 2:2311286/73‑1 (MQ=255) gCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGt > 1:207319/1‑150 (MQ=255) gCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGt < 2:70358/150‑1 (MQ=255) gCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGAAAGCCGCTCAGATCATTCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGt < 1:884940/150‑1 (MQ=255) ctcgCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGGTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTg < 2:691448/150‑1 (MQ=255) ctcctcGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGaa > 2:1254223/1‑150 (MQ=255) cctcGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTc > 2:861867/1‑137 (MQ=255) cctcGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTc < 1:861867/137‑1 (MQ=255) ctcGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGc > 2:1565014/1‑91 (MQ=255) ctcGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGc < 1:1565014/91‑1 (MQ=255) ctcGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTggg > 1:1267727/1‑97 (MQ=255) ctcGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTggg < 2:1267727/97‑1 (MQ=255) ctcGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCt > 1:1395732/1‑150 (MQ=255) cGGTGGATATCAGGAATTCGCCCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCACGCGAAGTTGTCAGCCATCACGACCATTTCGCACTGGTGAATCTgc < 1:110649/150‑1 (MQ=255) tGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGcgcg < 2:2297887/150‑1 (MQ=255) tatCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCg > 2:1080048/1‑150 (MQ=255) tCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGa > 1:961021/1‑150 (MQ=255) cGNAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGNGTTCCGCCCGGCNGCCGGGNGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGaaa > 1:2449462/1‑149 (MQ=255) aaTTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGTGGCCGGAATGAc < 2:2042518/150‑1 (MQ=255) ttCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGc < 2:87944/150‑1 (MQ=255) ttCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGc < 1:389343/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTc < 2:207319/150‑1 (MQ=255) tgcCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGc > 2:668942/1‑150 (MQ=255) aTCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCACAAATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGt > 1:1136305/1‑150 (MQ=255) gTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACgg < 1:1254223/150‑1 (MQ=255) ccgaccgaCAGCCGCGCGGTCCTACAACCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTg < 2:1959495/150‑1 (MQ=255) ccGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTg < 2:1150104/150‑1 (MQ=255) ccGCCCGGCAGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGa > 2:312381/1‑133 (MQ=255) ccGCCCGGCAGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGa < 1:312381/133‑1 (MQ=255) ccGCCCGGCAGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTg > 1:705738/1‑150 (MQ=255) gCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGt > 1:2151454/1‑71 (MQ=255) gCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGt < 2:2151454/71‑1 (MQ=255) cccGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGtt < 1:842013/68‑1 (MQ=255) cccGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGtt > 2:842013/1‑68 (MQ=255) ccGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCg > 2:836128/1‑150 (MQ=255) | GCCGGCCGCCAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCG > NC_002947/2050965‑2051252 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |