| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,100,001 | T→G | 6.6% | intergenic (‑69/‑136) | PP_1875 ← / → PP_1876 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator/AAA family ATP/GTP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,100,001 | 0 | T | G | 6.6% | 259.0 / 7.2 | 91 | intergenic (‑69/‑136) | PP_1875/PP_1876 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator/AAA family ATP/GTP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/43); new base G (3/3); total (45/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.62e-01 | |||||||||||
TTGTATGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGGAGGGGCGCGCAGCGGCCCCCAAAAAACTGAGATTGTTAGGAG > NC_002947/2099856‑2100131 | ttGTATGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCG < 2:216578‑M1/150‑1 (MQ=255)ttGTATGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATCTCCGTATATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCc > 2:895600‑M1/1‑149 (MQ=255) tgTATGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCAATACGTCATTAGCTGTTTGCCTGTTCCTTGCGCTGCGCCCGATCTGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGgcgc < 1:2377258/150‑1 (MQ=255) tGTATGACAGGCGATTGGTGAAGTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGC < 2:205728‑M1/150‑1 (MQ=255) gTATGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCC < 2:886427‑M1/150‑1 (MQ=255) gTATGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCC > 2:2297318‑M1/1‑150 (MQ=255) aTGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCC < 1:2246025‑M1/150‑1 (MQ=255) aGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATATCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCAAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC > 1:756978‑M1/1‑150 (MQ=255) gCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGG > 2:177651‑M1/1‑150 (MQ=255) gATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGC < 1:801362‑M1/150‑1 (MQ=255) tGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCC < 2:1999990‑M1/150‑1 (MQ=255) ttGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTcc > 2:820367/1‑150 (MQ=255) ttGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCAAGCCCGcgga > 1:1249931‑M1/1‑146 (MQ=255) ttGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTGCGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGctcc > 2:1702974‑M1/1‑146 (MQ=255) gATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCca < 1:2325555/150‑1 (MQ=255) atatCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCAAGCCCGcggaggg < 2:1249931‑M1/150‑8 (MQ=255) atatCCACGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCcac > 1:765002/1‑150 (MQ=255) tatCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGTGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCcaca > 2:1229312/1‑150 (MQ=255) atCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAg < 1:790792/150‑1 (MQ=255) ccATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGctcccacaggg > 2:688554‑M1/1‑139 (MQ=255) aTGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTAc > 1:739844/1‑150 (MQ=255) gAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAg > 2:1119137/1‑150 (MQ=255) tCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGAGGGCTTGCCCATTCCTACAGGGACCGcgt > 1:272732/1‑148 (MQ=255) cccGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTa < 2:832232/150‑1 (MQ=255) cccGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTa < 2:739844/150‑1 (MQ=255) ccGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGC > 1:706304‑M1/1‑111 (MQ=255) ccGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGC < 2:706304‑M1/111‑1 (MQ=255) cGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGc < 2:157162/150‑1 (MQ=255) gTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGc > 2:1858944/1‑150 (MQ=255) ttCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGctcccacagggcttgcgttcagcctggggc > 2:1834723‑M1/1‑120 (MQ=255) ccGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCt > 2:1449601/1‑134 (MQ=255) ccGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCt < 1:1449601/134‑1 (MQ=255) ccGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGCTGAAc < 1:1895851/150‑1 (MQ=255) ccGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTGCGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGctcccacagggcttgcgttcagcctggggctaa > 1:865581‑M1/1‑117 (MQ=255) cGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGc > 1:16322/1‑137 (MQ=255) cGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGc < 2:16322/137‑1 (MQ=255) tCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGTGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCaa < 1:1229312/150‑1 (MQ=255) cTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCAAGc < 1:2161876/150‑1 (MQ=255) cTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCAAGc > 1:778923/1‑150 (MQ=255) ttGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTa < 1:2165622/129‑1 (MQ=255) ttGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTa > 2:2165622/1‑129 (MQ=255) ttGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGc > 2:176827/1‑131 (MQ=255) ttGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGc < 1:176827/131‑1 (MQ=255) ttGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCAAGcc > 2:286764/1‑150 (MQ=255) ttGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCAAGcc < 2:765002/150‑1 (MQ=255) gcgctgcgcAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCAAGCCCt < 1:2297318/150‑1 (MQ=255) gctgcgcAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCAAGCCCtgt < 1:820367/150‑1 (MQ=255) ctgcgcAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGctcccccagggcttgcgttcagcctggggctaagctgtacctgtg < 2:1432489‑M1/150‑46 (MQ=255) cgcAAGCATAGCCGAATAGCGCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGctcccacagggcttgcgttcagcctggggctaagctgtacctgtggga > 1:1208768‑M1/1‑102 (MQ=255) cAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGctcccacagggcttgcgttcagcctggggctaagctgtacctgtgggaac < 1:688554‑M1/150‑51 (MQ=255) cAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGctcccacagggcttgcgttcagcctggggctaagctatacctgtgggaac < 2:1984535‑M1/150‑51 (MQ=255) cAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGc > 2:1613071‑M2/1‑149 (MQ=255) cAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGG > 2:1325375‑M1/1‑92 (MQ=255) cAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGG < 1:1325375‑M1/92‑1 (MQ=255) aaGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGctcccacagggcttgcgttcagcctggggctaagctgtacctgtgggaacg < 1:1834723‑M1/150‑52 (MQ=255) aaGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCAAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGcg > 2:756978‑M2/1‑148 (MQ=255) aGCATAGCCGAATAGCGCCGGGTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGctcccacagggcttgcgttcagcctggggctaagctgtacctgtgggaacgg < 2:1208768‑M1/150‑53 (MQ=255) aGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTTCTTGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGctcccacagggcttgcgttcagcctggggctaagctgtacctgtgggaacgg > 1:1639627‑M1/1‑98 (MQ=255) 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2:487738/1‑147 (MQ=255) gtggGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGGAGGGGCGCGCAg < 1:487738/147‑1 (MQ=255) gggTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCAAGCCCTTTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGGAGGGGCGCGCAGCGGcc < 1:895600/150‑1 (MQ=255) tttCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGctcccacagggcttgcgttcagcctggggctaagctgtacctgtgggaacgg > 1:1829104‑M1/1‑54 (MQ=255) tttCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGctcccacagggcttgcgttcagcctggggctaagctgtacctgtgggaacgg < 2:1829104‑M1/106‑53 (MQ=255) gatctggcGCCAAGCGGCCCCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGGAGGGGCGCGCAGCGGCCCCCAAAAAACTGAGATTGt < 1:1317444/143‑1 (MQ=255) gcGCCAAGCGGCCCCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGGAGGGGCGCGCAGCGGCCCCAAAAAAAGCGACATTGTTAgatt > 2:1317444/2‑147 (MQ=255) gCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGctcccacagggcttgcgttcagcctggggctaagctgtacctgtgg < 2:1972956‑M1/88‑47 (MQ=255) gCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGctcccacagggcttgcgttcagcctggggctaagctgtacctgtgg > 1:1972956‑M1/1‑42 (MQ=255) ccAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGCACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGcgggcaa < 2:796584‑M2/97‑8 (MQ=255) ccAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGCACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGcgggcaa > 1:796584‑M2/1‑90 (MQ=255) gCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGGAGGGGCGCGCAGCGGCCCCCAAAAAACTg < 2:2164122/121‑1 (MQ=255) gCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGGAGGGGCGCGCAGCGGCCCCCAAAAAACTg > 1:2164122/1‑121 (MQ=255) | TTGTATGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGCTTGCCCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCAGGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGGAGGGGCGCGCAGCGGCCCCCAAAAAACTGAGATTGTTAGGAG > NC_002947/2099856‑2100131 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |