| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,265,717 | G→T | 5.2% | R245L (CGC→CTC) | folC → | bifunctional folypolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,265,717 | 0 | G | T | 5.2% | 370.1 / 5.5 | 114 | R245L (CGC→CTC) | folC | bifunctional folypolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (53/55); new base T (3/3); total (56/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.29e-01 | |||||||||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
CTGGATCCGCCCGGGCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGTCTCGACCTCCGTAATGT > NC_002947/2265572‑2265864 | cTGGATCCGCCCGGGCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGAc > 1:1650928/1‑150 (MQ=255) ggATCCGCCCGGGCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCt > 1:1218474/1‑150 (MQ=255) gATCCGCCCGGGCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTg > 1:1556500/1‑150 (MQ=255) ccGCCCGGGCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCt < 1:2126841/150‑1 (MQ=255) cccGGGCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTg < 2:904400/150‑1 (MQ=255) cccGGGCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTg > 1:1248277/1‑150 (MQ=255) ccGGGCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGcgcacca < 1:2426749/150‑7 (MQ=255) ccGGGCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGc < 2:1529395/150‑1 (MQ=255) cGGGCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCt < 1:1300090/150‑1 (MQ=255) ggggCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGTCGAAGGCTGCTGAAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCACGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTg < 2:54367/150‑1 (MQ=255) gggCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGCCCTGCCTTTGCTg < 2:593098/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCt < 1:1844665/150‑1 (MQ=255) gCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGcc > 1:1402268/1‑150 (MQ=255) tGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCa > 1:1578522/1‑150 (MQ=255) gACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATg > 2:2377934/1‑150 (MQ=255) gACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTCTGCTGGACCTGCCCATg > 2:14214/1‑150 (MQ=255) aGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGaaa < 2:1218474/150‑1 (MQ=255) ccgccgAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACg < 1:1056536/150‑1 (MQ=255) cgccgAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGc > 1:2132994/1‑150 (MQ=255) ccgAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCa < 2:1608910/150‑1 (MQ=255) cTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTg < 2:1578522/150‑1 (MQ=255) tGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTgg > 2:422069/1‑150 (MQ=255) tGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTgg > 2:422238/1‑150 (MQ=255) gCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGcc > 1:2383509/1‑150 (MQ=255) accGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCtt < 1:154157/114‑1 (MQ=255) accGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCtt > 2:154157/2‑115 (MQ=255) cgcgCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCtt > 1:1129364/1‑150 (MQ=255) gcgcCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGAc < 2:37700/105‑1 (MQ=255) gcgcCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGAc > 1:37700/1‑105 (MQ=255) cgcCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGGCCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGc < 2:2025080/150‑1 (MQ=255) ccACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAg < 2:1794763/150‑1 (MQ=255) ccACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTCGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAg > 2:1237737/1‑150 (MQ=255) cACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGCGCAGCTCGACCt > 2:339872/1‑103 (MQ=255) cACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGCGCAGCTCGACCt < 1:339872/103‑1 (MQ=255) aCTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGc > 1:1393589/1‑150 (MQ=255) 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gcgGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGa < 1:828045/150‑1 (MQ=255) cgGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGCCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTATGGCGGGTCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGAt < 1:1357668/150‑1 (MQ=255) ggTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATg < 2:1556500/150‑1 (MQ=255) ggTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATg < 1:39096/150‑1 (MQ=255) tCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGc < 2:1525083/104‑1 (MQ=255) tCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGc > 1:1525083/1‑104 (MQ=255) tCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATgg > 1:661933/1‑149 (MQ=255) gggAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGc < 1:792380/150‑1 (MQ=255) ggCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAAcgc < 1:2281183/150‑1 (MQ=255) ggCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAAcgc > 1:1447481/1‑150 (MQ=255) gCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAAcgcg < 2:533169/150‑1 (MQ=255) gCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAAcgcg < 2:1393589/150‑1 (MQ=255) cAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGc > 2:336430/1‑77 (MQ=255) cAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACgcggc > 1:812253/1‑150 (MQ=255) aGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGAt < 2:1291466/128‑1 (MQ=255) aGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGAt > 1:1291466/1‑128 (MQ=255) gTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTgg < 2:317645/105‑1 (MQ=255) 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cGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCAc > 2:267631/1‑150 (MQ=255) gCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTg > 2:834896/1‑69 (MQ=255) gCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTg < 1:834896/69‑1 (MQ=255) gCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACt < 2:1974014/150‑1 (MQ=255) gCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACt > 2:2118168/1‑150 (MQ=255) gCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACt > 1:1173664/1‑150 (MQ=255) cTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTg > 2:728252/1‑150 (MQ=255) cTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGCAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTg < 1:780767/150‑1 (MQ=255) tGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTgg < 1:1237737/150‑1 (MQ=255) tGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTgg < 2:1248277/150‑1 (MQ=255) tGATGGTGCGCAGGTCGAACTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTgg < 1:121839/150‑1 (MQ=255) ggTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGt > 2:2346413/1‑150 (MQ=255) ggcAGGTCGCGCAGCTCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCctgc > 2:490328/2‑78 (MQ=38) ggcAGGTCGCGCAGCTCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCctgc < 1:490328/77‑1 (MQ=38) ggcAGGTCGCGCAGCTCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGtctc < 1:1432399/148‑1 (MQ=255) ggcAGGTCGCGCAGCTCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGtctc > 2:1432399/2‑149 (MQ=255) ggTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGTCTCGACCt > 2:1012841/1‑150 (MQ=255) gTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAAcgcg > 2:1949928/1‑96 (MQ=255) gTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAAcgcg < 1:1949928/96‑1 (MQ=255) gTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGTCTCGACCTc > 1:245767/1‑150 (MQ=255) tCGTGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGTCTCGACCTcc < 1:222397/150‑1 (MQ=255) tCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGTCTCGACCTcc < 2:812253/150‑1 (MQ=255) gAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGaaaa > 2:421266/1‑41 (MQ=255) gAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGaaaa < 1:421266/41‑1 (MQ=255) cTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGTCTCGACCTCCGTAAt < 2:827277/150‑1 (MQ=255) gcgcGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGTCTCGACCTCCGTAAtgt < 1:340388/150‑1 (MQ=255) | CTGGATCCGCCCGGGCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTTTCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGTCTCGACCTCCGTAATGT > NC_002947/2265572‑2265864 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |