Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,560,509 | T→A | 8.6% | L143Q (CTG→CAG) | PP_2243 → | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,560,509 | 0 | T | A | 8.6% | 206.8 / 9.1 | 70 | L143Q (CTG→CAG) | PP_2243 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/31); new base A (3/3); total (36/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.77e-01 |
CGACCTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCG > NC_002947/2560363‑2560658 | cGACCTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCtggctggc < 2:894185/150‑1 (MQ=255) gACCTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCGGGCTggcg > 1:958694/1‑150 (MQ=255) ttGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCt > 1:1720256/1‑150 (MQ=255) ttGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCAGCCAGGCGGCCt < 2:1404074/150‑1 (MQ=255) gCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGa > 2:1726847/1‑150 (MQ=255) ggCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGc < 2:1949868/150‑1 (MQ=255) gCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCctggctgg < 2:1985228/134‑1 (MQ=255) gCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCctggctgg > 1:1985228/1‑134 (MQ=255) tCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATTGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGActgg > 1:959934/1‑150 (MQ=255) tCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCg > 1:1613060/1‑141 (MQ=255) tCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCg < 2:1613060/141‑1 (MQ=255) gTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTGTCGA‑AGGCCgcca < 2:1087814/142‑4 (MQ=255) gTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTGTCGA‑AGGCCgcca > 1:1087814/1‑139 (MQ=255) ttGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGActggctg < 1:157112/150‑1 (MQ=255) aaGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCg > 2:525562/1‑150 (MQ=255) gCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGt > 2:1891811/1‑150 (MQ=255) cAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGt > 1:1324167/1‑135 (MQ=255) cAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGCGAGTCGTTCGCTCCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGt < 2:1324167/135‑1 (MQ=255) aaCTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGa < 1:340546/150‑1 (MQ=255) tACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGa > 2:2116901/1‑133 (MQ=255) tACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGa < 1:2116901/133‑1 (MQ=255) tACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGaccc > 1:2248721/1‑150 (MQ=255) cAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGacccac < 2:2248721/150‑1 (MQ=255) aGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGActg > 2:488207/1‑132 (MQ=255) aGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGActg < 1:488207/132‑1 (MQ=255) gAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATg > 2:93811/1‑150 (MQ=255) gAGCAACAGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATg > 2:2108522/1‑150 (MQ=255) cAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTc < 2:58308/150‑1 (MQ=255) aCCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCAt < 1:1767572/150‑1 (MQ=255) cGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCAAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATgc > 1:1772866/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACACGACGGTCACGCGCGccct > 2:436258/1‑148 (MQ=255) cGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGt < 2:2142881/150‑1 (MQ=255) tGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAg < 2:958694/150‑1 (MQ=255) tGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAg < 1:1726847/150‑1 (MQ=255) tGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCAGCCAGGCGGCCtg > 1:2073594/1‑81 (MQ=38) tGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCAGCCAGGCGGCCtg < 2:2073594/82‑2 (MQ=38) ggATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGa < 1:1401191/116‑1 (MQ=255) ggATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGa > 2:1401191/1‑116 (MQ=255) ggATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTgg < 1:615234/150‑1 (MQ=255) ggATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTgg < 1:93811/150‑1 (MQ=255) ggATCCGGCCAGTGCCGTGAATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCCGGTACAGGTGCTTgg < 2:1661136/150‑1 (MQ=255) aTCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTgggg > 2:1288238/1‑149 (MQ=255) aTCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGgt > 2:2084869/1‑150 (MQ=255) aTCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGgt < 2:1294452/150‑1 (MQ=255) tCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGgtg > 2:249017/1‑150 (MQ=255) ggCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGGGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTcc < 2:470310/150‑1 (MQ=255) cAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGAt > 2:1607470/1‑150 (MQ=255) gTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCAGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGcc > 1:901367/1‑150 (MQ=255) tGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCg > 2:977922/1‑150 (MQ=255) aTGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCAAGGCCGCCAGCCAGGCGGCCtggc > 1:2327547/1‑57 (MQ=18) aTGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCAAGGCCGCCAGCCAGGCGGCCtggc < 2:2327547/60‑4 (MQ=18) ggtggtGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAg < 1:1891811/150‑1 (MQ=255) tggtgAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGt < 2:983048/81‑1 (MQ=255) tggtgAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGt > 1:983048/1‑81 (MQ=255) gAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCAT‑TTGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGAGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATc < 1:436258/150‑1 (MQ=255) aGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTAAAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCa > 1:2426551/1‑142 (MQ=255) aGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTAAAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCa < 2:2426551/142‑1 (MQ=255) tCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGAc < 1:525562/150‑1 (MQ=255) tCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGAc < 1:977922/150‑1 (MQ=255) gTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGt > 1:575960/1‑150 (MQ=255) cTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTGTCGACGtgctgc < 1:2084869/150‑1 (MQ=255) cTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCGTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGtgctgc > 2:1638133/1‑150 (MQ=255) tATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCtt < 2:2156049/104‑1 (MQ=255) tATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCtt > 1:2156049/1‑104 (MQ=255) tATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGt < 1:673289/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCAGGGTAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCAc < 1:1638133/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGt > 1:763400/1‑150 (MQ=255) cAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTTACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGGGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCaa > 1:2210396/1‑150 (MQ=255) aaGGCCGCCAGCCAGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGGCGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCaa > 1:604647/2‑150 (MQ=255) gccgccTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTCCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTg > 2:1219946/1‑150 (MQ=255) ccgccTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGa > 2:1431379/1‑150 (MQ=255) cgccTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAg < 1:1607470/150‑1 (MQ=255) gccTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGc > 1:1340038/1‑150 (MQ=255) ctggctggCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGcct > 2:1027/1‑148 (MQ=255) tggcGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCg < 2:959934/150‑1 (MQ=255) | CGACCTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCG > NC_002947/2560363‑2560658 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |