Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,707,782 | T→C | 6.7% | A490A (GCA→GCG) | cysI ← | sulfite reductase hemoprotein subunit beta |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,707,782 | 0 | T | C | 6.7% | 295.1 / 6.5 | 100 | A490A (GCA→GCG) | cysI | sulfite reductase hemoprotein subunit beta |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/51); new base C (2/5); total (44/56) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.96e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.86e-01 |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GGGTCGATGCCGATACGCTGGTAGGTGTCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGGAGATGTTCAGGTCGATTTCGCCGATGTCGAACAGGTAGTC > NC_002947/2707633‑2707931 | gggTCGATGCCGATACGCTGGTAGGTGTCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGt > 2:86347/1‑150 (MQ=255) gTCGATGCCGATACGCTGGTAGGTGTCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTgc > 2:1585233/1‑150 (MQ=255) gTCGATGCCGATACGCTGGTAGGTGTCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTgc > 2:619998/1‑150 (MQ=255) gATGCCGATACGCTGGTAGGTGTCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTgcggc > 2:1896951/1‑150 (MQ=255) gATGCCGATACGCTGGTAGGTGTCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGAGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTgcggc < 1:1232594/150‑1 (MQ=255) ccGATACGCTGGTAGGTGTCGATGAAACGCTTTTGCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCACgcggcgcaa < 2:1245699/150‑4 (MQ=255) ccGATACGCTGGTAGGTGTCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCACgcggcgcaa < 2:2034831/150‑4 (MQ=255) ccGATACGCTGGTAGGTGTCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCACgcggcgcaa < 2:1565474/150‑4 (MQ=255) cGATACGCTGGTAGGTGTCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCACgcggcgcaa > 2:237062/1‑146 (MQ=255) cGATACGCTGGTAGGTGTCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCACgcggcgcaa < 1:237062/149‑4 (MQ=255) gATACGCTGGTAGGTGTCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACAAGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTgcc > 1:100403/1‑150 (MQ=255) gCTGGTAGGTGTCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCa < 2:1658238/150‑1 (MQ=255) tGGTAGGTGTCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGc < 2:1164414/150‑1 (MQ=255) tGGTAGGTGTCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGc < 1:50752/150‑1 (MQ=255) tGGTAGGTGTCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGc > 1:1164414/1‑150 (MQ=255) tGGTAGGTGTCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTAGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGc < 1:1450266/150‑1 (MQ=255) tgtCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCt > 2:1435646/1‑150 (MQ=255) gtCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTg < 2:1335132/150‑1 (MQ=255) gtCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTg > 2:2384006/1‑150 (MQ=255) tCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTgg > 2:1924769/1‑150 (MQ=255) gATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTa < 1:86347/150‑1 (MQ=255) gATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTa > 1:164673/1‑150 (MQ=255) gATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTAATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTa > 2:1682725/1‑150 (MQ=255) gAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGaa < 1:2384006/150‑1 (MQ=255) aaaCGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAAc > 1:1455194/1‑150 (MQ=255) aCGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCACgcggcgcaagc > 2:2321644/1‑121 (MQ=255) aCGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCACgcggcgcaagc < 1:2321644/126‑6 (MQ=255) tctTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCa < 2:572384/150‑1 (MQ=255) cTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCctt > 2:462714/1‑150 (MQ=255) cTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCctt < 1:1566070/150‑1 (MQ=255) tCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCTATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCcttc < 2:1257916/150‑1 (MQ=255) tCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCcttc < 2:2250749/150‑1 (MQ=255) tCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCcttc < 2:1558825/150‑1 (MQ=255) tCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCcttc < 2:709035/150‑1 (MQ=255) ggTGCGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCcttctt < 1:1602205/150‑1 (MQ=255) ggTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGTATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCcttctt < 2:1775141/150‑1 (MQ=255) ggTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCcttctt < 2:1455194/150‑1 (MQ=255) gTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAg > 2:1788413/1‑115 (MQ=255) gTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAg < 1:1788413/115‑1 (MQ=255) cGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGa < 1:472852/150‑1 (MQ=255) gACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAg > 2:560354/1‑150 (MQ=255) cGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGa < 1:1352660/150‑1 (MQ=255) tACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTCAGCCGCGATTGGTGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGCCCACGCCGAGGATg > 2:1036907/1‑150 (MQ=255) acGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGGTCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCg > 2:84892/1‑150 (MQ=255) acGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCg > 1:1374222/1‑150 (MQ=255) acGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCg > 1:1912776/1‑150 (MQ=255) ggCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCCTGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGCACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGAt < 2:144946/150‑1 (MQ=255) cGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGAtgt < 1:2202394/150‑1 (MQ=255) tCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGCTGTGGc < 2:1912776/150‑1 (MQ=255) tCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGAGGCGTTGCCGCCCa < 1:1809222/93‑1 (MQ=255) tCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGAGGCGTTGCCGCCCa > 2:1809222/1‑93 (MQ=255) tcGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACgtgg < 2:761095/150‑1 (MQ=255) tcGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACgtgg > 2:2343785/1‑150 (MQ=255) gATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACgtggtg < 1:619998/150‑1 (MQ=255) tCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGa < 2:309703/123‑1 (MQ=255) tCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGa > 1:309703/1‑123 (MQ=255) tCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACgtggtggt > 1:221606/1‑150 (MQ=255) cacaTCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACgtggtggtg < 1:462714/150‑1 (MQ=255) cacaTCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACgtggtggtg > 2:629808/1‑150 (MQ=255) acaTCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGtggtggtgg < 2:221606/150‑1 (MQ=255) acaTCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGtggtggtgg < 2:164673/150‑1 (MQ=255) caTCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGacac < 1:2119646/85‑1 (MQ=255) caTCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGacac > 2:2119646/1‑85 (MQ=255) caTCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTgg > 1:590975/1‑89 (MQ=255) caTCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTgg < 2:590975/89‑1 (MQ=255) caTCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGc > 2:670525/1‑150 (MQ=255) aTCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGcc > 1:2134405/1‑150 (MQ=255) tCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGCACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCg > 1:178205/1‑150 (MQ=255) gTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGtt < 1:2343785/150‑1 (MQ=255) tCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGTGACACCTGGTAGAACTCCTCATCATTCTTCTCCACGCCGATGATTCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTc < 2:867288/150‑1 (MQ=255) cATCCTGCGCGAAGGACGGGCCGAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCa > 2:1792282/1‑150 (MQ=255) ccTGCGCGAAGGACGGGCCGAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGc < 1:1792282/150‑1 (MQ=255) ccTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGc < 1:1924769/150‑1 (MQ=255) cTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCa > 2:96141/1‑150 (MQ=255) gAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGga < 2:100403/150‑1 (MQ=255) aGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGgaga < 1:629808/150‑1 (MQ=255) gggCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGGAGATGTTc < 2:1374222/150‑1 (MQ=255) gCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGGAGATGTTCAg > 1:1013891/1‑150 (MQ=255) gCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGGAGATGTTCAg < 1:1585233/150‑1 (MQ=255) cAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCAt > 2:2028911/1‑130 (MQ=255) cAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCAt < 1:2028911/130‑1 (MQ=255) aaGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGGAGATGTTCAGGTc > 1:2336373/1‑150 (MQ=255) ggATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGGAGATGTTCAGGTCGa < 1:1435646/150‑1 (MQ=255) ggATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGGAGATGTTCAGGTCGa < 1:1896951/150‑1 (MQ=255) gCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGGAGATGTTCAGGTCGATTTCGcc > 1:1064393/1‑150 (MQ=255) gCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGGAGATGTTCAGGTCGATTTCGcc < 2:650357/150‑1 (MQ=255) ccAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGccc < 2:1712437/92‑1 (MQ=255) ccAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGccc > 1:1712437/1‑92 (MQ=255) ccAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATg < 1:54496/119‑1 (MQ=255) ccAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATg > 2:54496/1‑119 (MQ=255) ccAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGGAGATGTTCAGGTCGATTTCGCCGa > 2:2414501/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCAAGCCGAGGATGCCGACGTGGCTGACGTGGTGGGGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGGAGATGTTCAGGTCGATTTCGCCGa > 1:2114725/1‑150 (MQ=255) cAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGGAGATGTTCAGGTCGATTTCGCCGAt > 2:214397/1‑150 (MQ=255) ggCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGGAGATGTTCAGGTCGATTTCGCCGATGt < 2:101862/150‑1 (MQ=255) cTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATg > 1:1258652/1‑75 (MQ=255) cTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATg < 2:1258652/75‑1 (MQ=255) cgccgcGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGGAGATGTTCAGGTCGATTTCGCCGATGTCGAACa < 1:962913/150‑1 (MQ=255) cgccgcGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGGAGATGTTCAGGTCGATTTCGCCGATGTCGAACa < 2:1013891/150‑1 (MQ=255) gccgcGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGGAGATGTTCAGGTCGATTTCGCCGATGTCGAACAg < 1:962184/150‑1 (MQ=255) tGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACAACTAGCCCTTCTTGTCCAGGTCGAGGATGCCGATTTGGCCCACGTGGCGGGAACTGCATCTGGTGATGCAGCCGGAGATGTTCAGGTCGATTTCGCCGATGTCGAACAGGTAGTc > 1:543021/1‑150 (MQ=255) | GGGTCGATGCCGATACGCTGGTAGGTGTCGATGAAACGCTCTTCCTCGGTACGTTGCTCGACGTACACGGCGATCAGCTTCTCGATCACATCGGCCATGTCATCCTGCGCGAAGGACGGGCCAAGGATCTTGCCCAGGCTTGCGCCGCGTGCGGCGTTGCCGCCCAGCGACACCTGGTAGAACTCCTCACCCTTCTTGTCCACGCCGAGGATGCCGATGTGGCCCACGTGGTGGTGGCCGCAGGCGTTCATGCAGCCGGAGATGTTCAGGTCGATTTCGCCGATGTCGAACAGGTAGTC > NC_002947/2707633‑2707931 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |