| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,790,109 | T→A | 7.5% | Q61L (CAG→CTG) | PP_2442 ← | DUF480 domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,790,109 | 0 | T | A | 7.5% | 232.5 / 9.8 | 82 | Q61L (CAG→CTG) | PP_2442 | DUF480 domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/39); new base A (4/2); total (40/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.26e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.75e-01 | |||||||||||
CCCGCAGGAACATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGAGCCGAGAACGCGGATCTCGATGCTGTTGAA > NC_002947/2789960‑2790257 | cccGCAGGAACATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCt > 2:823714/1‑150 (MQ=255) aaCATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGCCCCCGGAGGGCGCGCAAGGCCAGGTCGGCCAGGCCTTgc < 1:789251/150‑2 (MQ=255) aaCATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTgg < 1:109933/150‑1 (MQ=255) aaCATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTgg < 2:1286009/150‑1 (MQ=255) aaCATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTgg < 2:1785006/150‑1 (MQ=255) aCATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTggg < 1:2225624/150‑1 (MQ=255) aTCAGGCCCATAAGCACCAAATGCGGTGGCACCAACTCCAGTGCCTTGGGTACCCGGTGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCCGCAGGTGCGTCATGCTCGGACGAGCGTGGTCTCGGAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTg > 2:521490/1‑150 (MQ=255) aGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAgg > 2:828402/1‑150 (MQ=255) aGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAgg < 2:334702/150‑1 (MQ=255) aGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAgg < 2:1762026/150‑1 (MQ=255) aGGCCCATCAGCACCAACTGCGATAGCGTTAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAgg > 1:1638204/1‑150 (MQ=255) gCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGtt < 1:2207757/150‑1 (MQ=255) cccATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTtc < 1:865606/150‑1 (MQ=255) ccATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTtca > 2:1035839/1‑150 (MQ=255) ccATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTtca > 1:1194353/1‑150 (MQ=255) ggCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGtc < 1:1035839/150‑1 (MQ=255) aCCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCCTCATCGGCTCGCGGCTGGtcttc > 2:552507/1‑150 (MQ=255) aCCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGtcttc > 2:930270/1‑150 (MQ=255) ccAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGtcttct < 1:619357/150‑1 (MQ=255) cTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGtt > 2:1615697/1‑150 (MQ=255) cAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCa < 2:2066440/150‑1 (MQ=255) cAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCa > 2:1099502/1‑150 (MQ=255) gTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAgg > 2:2403604/1‑150 (MQ=255) ttccTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGc < 1:2325682/148‑1 (MQ=255) ccTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCa < 2:178574/150‑1 (MQ=255) ccTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCa < 1:939826/150‑1 (MQ=255) ccTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCa > 1:911963/1‑150 (MQ=255) ccTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCa > 2:939826/1‑150 (MQ=255) cTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAg > 2:1025566/1‑150 (MQ=255) cTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCCGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAg > 1:160623/1‑150 (MQ=255) cTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCCGCTGGGGCGTGTTTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAg < 2:1401860/150‑1 (MQ=255) tGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGa < 1:657464/150‑1 (MQ=255) tACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAg < 1:408333/150‑1 (MQ=255) tACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAg > 1:1778422/1‑150 (MQ=255) aCCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAgg < 1:2220645/150‑1 (MQ=255) ccGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAgg > 1:707950/1‑142 (MQ=255) ccGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAgg < 2:707950/142‑1 (MQ=255) ccGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGc > 1:1538955/1‑150 (MQ=255) gATGTTCCCAGCGGTCGGCACGTCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCAt < 2:1194353/150‑1 (MQ=255) aTGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAg > 1:321097/1‑96 (MQ=255) aTGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAg < 2:321097/96‑1 (MQ=255) gTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGa > 2:358562/1‑150 (MQ=255) ccccAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAgg < 2:651895/149‑1 (MQ=255) ccAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGc > 2:527763/1‑129 (MQ=255) ccAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGc < 1:527763/129‑1 (MQ=255) cAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTc > 1:141470/1‑150 (MQ=255) ggTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCg < 1:930270/150‑1 (MQ=255) gTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCgg < 1:1162286/150‑1 (MQ=255) tCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCggg < 1:673280/150‑1 (MQ=255) cGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGCCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGt < 1:521490/150‑1 (MQ=255) gCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATGACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACTAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAg > 2:1212892/1‑150 (MQ=255) cTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCTGCTCTGGCCTTGGGTTAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTcc < 1:283011/150‑1 (MQ=255) cATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCt > 2:2234814/1‑150 (MQ=255) aTCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCg < 1:2061578/79‑1 (MQ=255) aTCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCg > 2:2061578/1‑79 (MQ=255) tCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCtgg < 1:1104498/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCtggtg > 1:365265/1‑150 (MQ=255) cAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGc < 2:407089/150‑1 (MQ=255) cGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGc < 1:828402/150‑1 (MQ=255) cGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGc < 1:325702/150‑1 (MQ=255) gTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCttt < 1:1099502/150‑1 (MQ=255) tCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCCCAAGGCCAGGTCGGCCAGGCCTTgc > 2:170577/1‑49 (MQ=2) tCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCCCAAGGCCAGGTCGGCCAGGCCTTgc < 1:170577/50‑2 (MQ=2) aTGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAgg < 1:714857/111‑1 (MQ=255) aTGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAgg > 2:714857/1‑111 (MQ=255) gCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGt < 2:1046849/119‑1 (MQ=255) gCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGt > 1:1046849/1‑119 (MQ=255) ccTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGTCCAGGGCATTGGGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCa > 2:267156/1‑150 (MQ=255) gAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGAGCCgag > 2:36013/1‑150 (MQ=255) aGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGAGCCgaga > 2:2074344/1‑150 (MQ=255) gggCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGAGCCGAGaa > 1:782940/1‑150 (MQ=255) gggCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGAGCCGAGaa > 1:1030683/1‑150 (MQ=255) 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cAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGAGCCGAGAACGCGGAt < 1:2403604/150‑1 (MQ=255) cAAGGCCAGGTCGGCCAGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGCGCTGAGTACGCGGAt > 2:1317551/1‑150 (MQ=255) ccGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGAGCCGAGAACGCGGATCTCGATGCTg > 2:218668/1‑150 (MQ=255) cTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCa > 2:2253186/1‑56 (MQ=255) cTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCa < 1:2253186/56‑1 (MQ=255) cTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGAGCCGAGAACGCGGATCTCGATGCTGTTGaa > 1:218821/1‑150 (MQ=255) | CCCGCAGGAACATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGAGCCGAGAACGCGGATCTCGATGCTGTTGAA > NC_002947/2789960‑2790257 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |