| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,822,938 | G→C | 14.9% | A156A (GCG→GCC) | curA → | NADPH‑dependent curcumin/dihydrocurcumin reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,822,938 | 0 | G | C | 14.9% | 175.9 / 20.0 | 66 | A156A (GCG→GCC) | curA | NADPH‑dependent curcumin/dihydrocurcumin reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (24/32); new base C (4/6); total (28/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGTCCGATGGAAGCGATCTGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCTAGATCACCGTGCGCC > NC_002947/2822790‑2823084 | tGTCCGATGGAAGCGATCTGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGCTATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGTTGGTggcgg < 2:1007433/150‑1 (MQ=255) tCCGATGGAAGCGATCTGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTggcggcg > 1:49514/1‑150 (MQ=255) gATGGAAGCGATCTGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGcc < 1:1948244/150‑1 (MQ=255) gAAGCGATCTGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCg > 1:559480/1‑150 (MQ=255) aaGCGATCTGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCgg > 1:2321212/1‑150 (MQ=255) cGATCTGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCCGCCGCCAccaccag < 2:1292470/150‑6 (MQ=255) gATCTGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCCACTTCCGGGAT‑CACGGCGTCGCCGCTTATATGGGCTTGCGCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGTAACCCTGGTGGTGGCCGCCGCCAccaccagg < 1:543330/150‑7 (MQ=255) aTCTGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCCTCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGCGGTGGCCGCCGCCAccaccaggg < 1:1114099/150‑8 (MQ=255) aTCTGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGCGGTGGCCGCCGCCAccacca > 2:2023625/1‑143 (MQ=255) aTCTGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGCGGTGGCCGCCGCCAccacca < 1:2023625/147‑5 (MQ=255) tCTGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGc < 1:782096/146‑1 (MQ=255) tCTGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGc > 2:782096/1‑146 (MQ=255) tGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCg < 1:1179015/150‑1 (MQ=255) gTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATCTTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGcgcgcc > 1:492899/1‑148 (MQ=255) gTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGAc < 1:1782044/150‑1 (MQ=255) gggTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACtgt > 1:2100844/1‑150 (MQ=255) gTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTgg < 1:718000/150‑1 (MQ=255) tGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATTTT‑TTTCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTggg < 2:2409403/150‑1 (MQ=255) gTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCCGCCGCCAccac > 2:934135/1‑124 (MQ=255) gTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCCGCCGCCAccac < 1:934135/126‑3 (MQ=255) gCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCACCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGAt < 2:133471/150‑1 (MQ=255) cgatcttCCTTCTTATGCCTTGTGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCgg < 2:2273852/144‑1 (MQ=255) gcgcATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGc < 1:2102119/150‑1 (MQ=255) gcATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCaa < 1:2220473/150‑1 (MQ=255) aTCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGa > 2:1300352/1‑150 (MQ=255) aTCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGa > 1:705016/1‑150 (MQ=255) ccTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATc > 1:2174884/1‑150 (MQ=255) ccTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTAATCTGAGGTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCagatcg > 1:2273852/1‑145 (MQ=255) tcttATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGTGCCGGTCGGCGCGCCTGTGTGGCAGATCGGCCAGATCAAg < 2:499448/150‑1 (MQ=255) tcttATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAg < 2:49514/150‑1 (MQ=255) ttATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACTGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAggg > 1:855412/1‑150 (MQ=255) aTGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGCGGTGGCCGCCGCCAccacca > 1:211767/1‑104 (MQ=255) aTGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGCGGTGGCCGCCGCCAccacca < 2:211767/108‑5 (MQ=255) gCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGc > 2:506689/1‑150 (MQ=255) gCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGc < 2:2174884/150‑1 (MQ=255) ccTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGa > 2:807217/1‑117 (MQ=255) ccTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGa < 1:807217/117‑1 (MQ=255) tGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCAtg < 2:494739/150‑1 (MQ=255) tt‑tGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGgt > 1:211176/1‑150 (MQ=255) cATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGc > 1:2182215/1‑150 (MQ=255) tGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCg > 2:1877446/1‑150 (MQ=255) cGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTg < 1:773556/150‑1 (MQ=255) cACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGa > 1:1997398/1‑150 (MQ=255) ccGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGGCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGaaa > 1:249496/1‑150 (MQ=255) ccGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGaaa > 1:2344524/1‑150 (MQ=255) tataTGGGCTGGCTCGTTATTGGCCGGCTGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGGCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGAGCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGc < 2:993145/150‑1 (MQ=255) tataTCGGCTTGCTCGATATTGCCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGc < 2:1010991/150‑1 (MQ=255) ttGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCg < 1:2342121/150‑1 (MQ=255) cTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGGGAAACCCGCGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGCCGGTCTCGCCGGTGGCGCGGAAAAACGCCGGCATGCGGTc > 2:631525/1‑150 (MQ=255) gATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAg < 1:108850/150‑1 (MQ=255) tatTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGt < 1:115543/150‑1 (MQ=255) gccggccgCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTgg > 1:277897/1‑150 (MQ=255) gccggccgCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTgg < 1:1300352/150‑1 (MQ=255) ggccgCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGtt < 1:1537317/150‑1 (MQ=255) gCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCCAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGa < 1:1352559/150‑1 (MQ=255) gCAGGCGGGTGAAACCCTGGGGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGa < 2:2100844/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGAt < 2:2122270/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATACGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGAt < 2:211176/150‑1 (MQ=255) gTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGGGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTc > 1:2232291/1‑150 (MQ=255) tGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCt < 1:1736475/150‑1 (MQ=255) tGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCt > 2:747765/1‑150 (MQ=255) aaaCCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCTAg < 2:2344524/150‑1 (MQ=255) ccTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCaa < 2:1996673/63‑1 (MQ=255) ccTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCaa > 1:1996673/1‑63 (MQ=255) ccTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGCTTTGATGCCTGTCTAGATCa > 1:1277610/1‑150 (MQ=255) ggcccggtggCCGCCGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCTAGATCAc > 2:2187844/6‑150 (MQ=255) ggtggCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCTAGATCACCGTgc < 1:506689/150‑1 (MQ=255) tggCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCTAGATCACCGTgcgc < 2:2182215/150‑1 (MQ=255) ggcggcggcGACCGGGCCTGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAAGGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCTAGATCACCGTGCGcc < 2:83679/150‑1 (MQ=255) | TGTCCGATGGAAGCGATCTGACCGCGTTGGGTGAGTCGCCGGCGCATCCTTCTTATGCCTTGGGCATCTT‑TGGCATGCCGGGCTTCACCGCTTATATGGGCTTGCTCGATATTGGCCGGCCGCAGGCGGGTGAAACCCTGGTGGTGGCGGCGGCCACCGGGCCGGTCGGCGCGACTGTGGGGCAGATCGGCAAGATCAAGGGCTGCCATGTGGTCGGTGTCGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGGCATGCGGTCGAGGTGCTGGGTTTTGATGCCTGTCTAGATCACCGTGCGCC > NC_002947/2822790‑2823084 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |