Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 233,833 | C→G | 8.3% | intergenic (+21/+42) | PP_0180 → / ← PP_0181 | cytochrome c family protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 233,833 | 0 | C | G | 8.3% | 262.9 / 12.6 | 84 | intergenic (+21/+42) | PP_0180/PP_0181 | cytochrome c family protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/47); new base G (4/3); total (34/50) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.33e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.81e-01 |
GTTCGACTGGCTGGGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCGGCTGATCGGTCAGCC > NC_002947/233686‑233981 | gTTCGACTGGCTGGGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAg < 2:102372/150‑1 (MQ=255) gTTCGACTGGCTGGGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAg > 1:897437/1‑150 (MQ=255) ttCGACTGGCTGGGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAgg < 1:2046429/150‑1 (MQ=255) ttCGACTGGCTGGGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAgg < 2:1660219/150‑1 (MQ=255) gACTGGCTGGGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGAc < 2:640003/150‑1 (MQ=255) tggctggGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACcgc < 1:40405/150‑1 (MQ=255) tggGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCaa > 1:376895/1‑150 (MQ=255) ggggATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAg < 1:1060974/150‑1 (MQ=255) gggATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAgg > 2:233337/1‑150 (MQ=255) tCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCa < 1:2178512/150‑1 (MQ=255) tCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCa < 2:51961/150‑1 (MQ=255) tGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGAt > 2:2340016/1‑150 (MQ=255) gCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATc < 2:2172324/150‑1 (MQ=255) gATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGTTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGATCTGAGACCTTg < 1:108201/150‑1 (MQ=255) atgtggaCTCGCTGTCGGCGCAACCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGTCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTgc < 2:1160684/144‑1 (MQ=255) tGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTgcg < 1:1786210/150‑1 (MQ=255) cTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCaa > 2:983403/1‑150 (MQ=255) tACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAg > 1:1027574/1‑150 (MQ=255) tCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCt < 1:1665460/150‑1 (MQ=255) cTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGAt < 2:960377/150‑1 (MQ=255) tCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCCAGCCTGagcat < 2:2292609/150‑5 (MQ=255) gcgcAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAg < 2:708269/150‑1 (MQ=255) cgcAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCTAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAgg < 1:1054201/150‑1 (MQ=255) cgcAAGCGGTGCATTTGCGGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAgg < 2:1319434/150‑1 (MQ=255) gcAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAggc > 1:1319434/1‑150 (MQ=255) ggTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCTTGCGCGGTCCCTGTGGGACCGCGCagg > 1:1515732/1‑109 (MQ=38) ggTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCTTGCGCGGTCCCTGTGGGACCGCGCagg < 2:1515732/111‑3 (MQ=38) ggTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGgctggctg > 1:2072304/1‑150 (MQ=255) gTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCTGTGGGACCGCGCa > 1:1062751/1‑108 (MQ=255) gTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCTGTGGGACCGCGCa < 2:1062751/108‑1 (MQ=255) tGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCa < 1:790706/115‑1 (MQ=255) tGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCa > 2:790706/1‑115 (MQ=255) tGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCtgtg < 2:2146657/150‑1 (MQ=255) tGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCtgtg < 2:750735/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGAAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTgg < 1:165018/150‑1 (MQ=255) ttGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGcc > 2:2264565/1‑150 (MQ=255) cTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTg < 2:2072304/150‑1 (MQ=255) ttgCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTga < 1:233337/148‑1 (MQ=255) tGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTga < 2:347672/150‑1 (MQ=255) cATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAAt < 2:1687857/150‑1 (MQ=255) cATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAAt > 2:107036/1‑150 (MQ=255) aTCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATg > 2:106554/1‑150 (MQ=255) cGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGtt < 2:761751/150‑1 (MQ=255) gtTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTg < 2:678401/150‑1 (MQ=255) ttCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGt < 1:107036/150‑1 (MQ=255) tCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTa < 2:2260948/150‑1 (MQ=255) tCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTa < 2:376895/150‑1 (MQ=255) tCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTa < 2:465403/150‑1 (MQ=255) ttACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCaa < 1:2422435/150‑1 (MQ=255) gCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGtc > 1:581287/1‑82 (MQ=255) gCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGtc < 2:581287/82‑1 (MQ=255) 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ctgcGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTgg > 1:111943/1‑150 (MQ=255) tgcGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTTAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGt < 2:2433022/150‑1 (MQ=255) gcGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTAGCACCGGCCTCGATCAAGGCCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCGGAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTc < 1:1115219/150‑1 (MQ=255) ggCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAg < 1:350360/150‑1 (MQ=255) gCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAgg > 1:2437000/1‑150 (MQ=255) aaCTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAggc > 2:1974794/1‑74 (MQ=255) aaCTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAggc < 1:1974794/74‑1 (MQ=255) aaCTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTaa > 2:368624/1‑149 (MQ=255) tgactgGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAgccg > 2:235237/1‑150 (MQ=255) gAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATcc > 1:1089870/1‑150 (MQ=255) gAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATcc > 2:391565/1‑150 (MQ=255) gCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCgg > 2:1846857/1‑150 (MQ=255) gCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCgg > 2:896092/1‑150 (MQ=255) cttGCGCGGTCCCTGTGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTa < 2:2031768/89‑1 (MQ=38) cttGCGCGGTCCCTGTGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTa > 1:2031768/3‑91 (MQ=38) ttGCGCGGTCCCTGTGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTTACAGTGTTCTGTAGCCATTGGACAATCTCAAAGCCTACATGACCCACGCTGGTCAGGTAGCCGCCATGCGGcc > 1:1115002/2‑149 (MQ=255) tGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCa < 1:2167728/142‑1 (MQ=255) tGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCa > 2:2167728/1‑142 (MQ=255) tGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGAGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCGGCTg > 1:1682929/1‑150 (MQ=255) cgGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCGGCTGATCg > 2:2249038/1‑150 (MQ=255) tCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCAt > 2:541864/1‑109 (MQ=255) tCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCAt < 1:541864/109‑1 (MQ=255) tCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCGGCTGATCGGTc < 1:391565/150‑1 (MQ=255) acaGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAAtt < 2:2329596/84‑1 (MQ=255) acaGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAAtt > 1:2329596/1‑84 (MQ=255) acaGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCGGCTGATCGGTCAGcc > 2:591503/1‑150 (MQ=255) acaGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCGGCTGATCGGTCAGcc > 2:1606766/1‑150 (MQ=255) caGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGc < 1:1104100/99‑1 (MQ=255) caGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAAAGGc > 2:1104100/1‑99 (MQ=255) | GTTCGACTGGCTGGGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAAGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCGGCTGATCGGTCAGCC > NC_002947/233686‑233981 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |