| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,060,067 | C→G | 11.1% | A10G (GCC→GGC) | exaE → | transcriptional regulator ExaE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,060,067 | 0 | C | G | 11.1% | 294.3 / 25.7 | 99 | A10G (GCC→GGC) | exaE | transcriptional regulator ExaE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (52/36); new base G (5/6); total (57/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.20e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.28e-01 | |||||||||||
AGGGGTAGGCCTGCACTCGATGGCCGAGCGCGCCCGCAGCCTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATGGACTTTGGCCTGCCCGGT > NC_002947/3059922‑3060212 | gggggTAGGCCTGCACTCGATGGCCGAGCGCGCCCGCAGCCTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTg < 2:1425551/149‑1 (MQ=255)aGGGGTAGGCCTGCACTCGATGGCCGAGCGCGCCCGCAGCCTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTg < 2:2075029/150‑1 (MQ=255) gCCTGCACTCGATGGCCGAGCGCGCCCGCAGCCTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGCGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCa > 1:2133872/1‑150 (MQ=255) ccTGCACTCGATGGCCGAGCGCGCCCGCAGCCTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGGCGTGGTcatcgcc < 2:991946/150‑7 (MQ=255) ccTGCACTCGATGGCCGAGCGCGCCCGCAGCCTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAg > 1:1689507/1‑150 (MQ=255) cTGCACTCGATGGCCGAGCGCGCCCGCAGCCTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAgg > 1:881523/1‑150 (MQ=255) cTCGATGGCCGAGCGCGCCCGCAGCCTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTAc > 2:2316323/1‑150 (MQ=255) tCGATGGCCGAGCGCGCCCGCAGCCTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACg > 2:464220/1‑150 (MQ=255) tCGATGGCCGAGCGCGCCCGCAGCCTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACg > 2:314634/1‑150 (MQ=255) gATGGCCGAGCGCGCCCGCAGCCTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGcc > 1:2369588/1‑150 (MQ=255) ggCCGAGCGCGCCCGCAGCCTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGc < 2:825672/150‑1 (MQ=255) cGAGCGCGCCCGCAGCCTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTtg > 2:1015578/1‑150 (MQ=255) gAGCGCGCCCGCAGCCTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGCCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTggc > 2:2370698/1‑150 (MQ=255) gAGCGCGCCCGCAGCCTTGGGGGGGAGTTAAGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCAAGGGCGACGCCAGCTtgg > 2:588047/1‑149 (MQ=255) aGCGCGCCCGCAGCCTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTtgct < 1:314634/150‑1 (MQ=255) gcCCGCAGCCTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTgcggg < 2:229657/150‑1 (MQ=255) ccGCAGCCTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTgcgggcg < 1:690204/150‑1 (MQ=255) ccTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTGAAAATACCCCATGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGtgctg > 1:648366/1‑150 (MQ=255) cTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGGCGTGGTcat > 2:1626546/1‑113 (MQ=255) cTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGGCGTGGTcat < 1:1626546/115‑3 (MQ=255) gggggAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTg > 2:1372504/1‑150 (MQ=255) gggggAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTg < 1:2371739/150‑1 (MQ=255) gAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGc < 2:2198576/150‑1 (MQ=255) gTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAg < 1:1015578/150‑1 (MQ=255) 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cAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGgcc > 2:2044137/1‑150 (MQ=255) aGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGgccg > 2:1145243/1‑150 (MQ=255) aGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGAGCGTGAGgccg > 1:911087/1‑150 (MQ=255) ccTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAgtg > 2:968674/1‑150 (MQ=255) tGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAgtggt < 2:2291006/150‑1 (MQ=255) 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tGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATACCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAg < 2:1689507/150‑1 (MQ=255) gCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTCTGTGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAggg < 1:1841015/150‑1 (MQ=255) ttAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGgc < 2:503973/135‑1 (MQ=255) ttAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGgc > 1:503973/1‑135 (MQ=255) ttAACATTACCACGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACTACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACa > 2:2435321/1‑150 (MQ=255) tAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGt < 1:1580660/101‑1 (MQ=255) tAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGt > 2:1580660/1‑101 (MQ=255) aTTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGc > 2:386337/1‑150 (MQ=255) ttCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGGGTTTGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCa > 2:1971051/1‑150 (MQ=255) tCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAg < 2:387727/150‑1 (MQ=255) tCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAg < 1:1372504/150‑1 (MQ=255) tCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAg < 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atCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTgcggg < 2:575182/58‑1 (MQ=255) cGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATGGa < 1:568085/150‑1 (MQ=255) tgtTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATGGACt > 2:1386003/1‑150 (MQ=255) gtTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATGGACtt > 1:1471899/1‑150 (MQ=255) tGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATGGACTTTg < 2:384803/150‑1 (MQ=255) ggTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATTGACTTTgg > 2:396144/1‑150 (MQ=255) ggTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATTGACTTTgg > 2:396469/1‑150 (MQ=255) gTCGATGACTACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATGGACTTTGGc < 1:2435321/150‑1 (MQ=255) gTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATGGACTTTGGc > 2:40431/1‑150 (MQ=255) tggcggACCACGGCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGt < 2:2015325/128‑1 (MQ=255) tggcggACCACGGCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGt > 1:2015325/6‑133 (MQ=255) tCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCCTGGACTTTGGcc > 2:781921/1‑150 (MQ=255) gcggACCACGGCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGc > 2:827263/4‑121 (MQ=255) gcggACCACGGCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGc < 1:827263/118‑1 (MQ=255) gATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGc > 1:1423556/1‑115 (MQ=255) gATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGc < 2:1423556/115‑1 (MQ=255) gATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATGGACTTTGGCCTg > 1:1531042/1‑150 (MQ=255) tGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATGGACTTTGGCCTGcc < 2:234913/150‑1 (MQ=255) tGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATGGACTTTGGCCTGcc > 2:1026905/1‑150 (MQ=255) ggACCACGGCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAg > 2:1995075/2‑102 (MQ=255) ggACCACGGCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGcc > 1:94963/2‑120 (MQ=255) ggACCACGGCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGcc < 2:94963/119‑1 (MQ=255) ggACCACGGCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCAGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAg < 1:1995075/101‑1 (MQ=255) cACGCCGTGGTCCGCCAGGTCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATGGACTTTGGCCTGCCCGGt > 2:2408661/1‑150 (MQ=255) cACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATGGACTTTGGCCTGCCCGGt > 2:1069279/1‑150 (MQ=255) cACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATGGACTTTGGCCTGCCCGGt > 2:1299592/1‑150 (MQ=255) cACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATGGACTTTGGCCTGCCCGGt > 1:1858521/1‑150 (MQ=255) cACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATGGACTTTGGCCTGCCCGGt > 2:953762/1‑150 (MQ=255) cGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATGGACTTTGGc > 2:437118/1‑139 (MQ=255) cGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATGGACTTTGGc < 1:437118/139‑1 (MQ=255) | AGGGGTAGGCCTGCACTCGATGGCCGAGCGCGCCCGCAGCCTTGGGGGGGAGTTACGCATTTTCAGCCGCCCTGGAGGCGGCTGGGCGCTGGCCCTTAACATTCCCCAGGAGGTGTGATGAATATCGTGTTGGTCGATGACCACGCCGTGGTCCGCCAGGGCTACGCCAGCTTGCTGCGGGCGGTGCTGCCATTGGTGCAGGTGCGTGAGGCCGCCAGTGGTGAAGAGGCGCTGGTCAGGGTACAGGAGCAGGTGCCCAACCTGGTGATCATGGACTTTGGCCTGCCCGGT > NC_002947/3059922‑3060212 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |