| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 287,068 | G→C | 6.1% | P19R (CCG→CGG) ‡ | tauB‑II ← | taurine ABC transporter ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 287,068 | 0 | G | C | 6.1% | 362.4 / 11.2 | 115 | P19R (CCG→CGG) ‡ | tauB‑II | taurine ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (52/56); new base C (4/3); total (56/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.93e-01 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
GGCACACCATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGAGGAA > NC_002947/286921‑287217 | ggCACACCATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCggg < 1:1543931/150‑1 (MQ=255) cccATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCTACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCGGGTCGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCt < 1:668533/149‑1 (MQ=255) acCATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCt < 1:2183603/150‑1 (MQ=255) aTCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCCCGGTGCTGgc < 2:1942220/150‑1 (MQ=255) tCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTCGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCggg < 1:261014/141‑1 (MQ=255) tCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTCGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCggg > 2:261014/1‑141 (MQ=255) tCGAGGGTGATGTAACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGgcg > 2:811661/1‑150 (MQ=255) ggggTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCt < 2:1471182/149‑1 (MQ=255) gggTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTg < 2:229476/150‑1 (MQ=255) ggTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTgg > 2:1846048/1‑150 (MQ=255) aTGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTAc < 1:2298860/150‑1 (MQ=255) tgtnACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACt > 2:1514203/1‑150 (MQ=255) tgtgACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACt < 2:139476/150‑1 (MQ=255) tgtgACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCCCGGTGCTGgccga > 2:1910555/1‑139 (MQ=255) tgtgACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCCCGGTGCTGgccga < 1:1910555/142‑4 (MQ=255) aCCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCACCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTgc < 2:1305136/150‑1 (MQ=255) gCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCt > 2:1009270/1‑150 (MQ=255) cACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGGGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGa < 1:1628338/150‑1 (MQ=255) cACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGa > 1:1164056/1‑150 (MQ=255) tGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATgc > 2:207131/1‑150 (MQ=255) cgaAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCt < 1:410865/150‑1 (MQ=255) aGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGa < 1:1009270/150‑1 (MQ=255) gCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAg < 2:1705123/150‑1 (MQ=255) cGATGAGGTTGAGCAGTGAGGGCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAgg < 2:953686/150‑1 (MQ=255) gATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGc > 1:1573817/1‑150 (MQ=255) aTGAGGTTGAGCAGTGAGATCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGcc > 2:965895/1‑150 (MQ=255) tGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCa > 1:2076419/1‑150 (MQ=255) gTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGAc > 2:532480/1‑150 (MQ=255) gAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTCAAATCGGCCAGCACCGGAGGGCGTGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACggg < 1:291083/150‑1 (MQ=255) gCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAg > 2:152075/1‑137 (MQ=255) gCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAg < 1:152075/137‑1 (MQ=255) aGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTcc > 2:1087239/1‑150 (MQ=255) gTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCa > 2:1298245/1‑150 (MQ=255) gTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCa > 1:2395352/1‑150 (MQ=255) tCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCt < 2:1738181/120‑1 (MQ=255) ttGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGtt > 2:1295242/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGtt < 1:1095295/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATgcgc < 2:1012869/106‑1 (MQ=255) gCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATgcgc > 1:1012869/1‑106 (MQ=255) gCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACgg > 2:2182887/1‑131 (MQ=255) gCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACgg < 1:2182887/131‑1 (MQ=255) gCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTggaa < 1:548574/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTg > 1:1482234/1‑147 (MQ=255) gCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTg < 2:1482234/147‑1 (MQ=255) gCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCCCCGGATCAGTTTggaa < 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ccccAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCGGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCCCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCCGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGACGGAACTTGgcgc > 2:420122/1‑150 (MQ=255) cccAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCt > 1:1214723/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTg > 2:965430/1‑150 (MQ=255) gCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACAGGGGTGCTGGCGACTGGGTAGTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTAGGCGCTGACGTa > 2:1327665/1‑150 (MQ=255) accaGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACgg < 1:811661/150‑1 (MQ=255) accaGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACgg > 2:1485049/1‑150 (MQ=255) accaGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGAGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACgg > 1:158099/1‑150 (MQ=255) cagcagTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCg > 2:213639/1‑150 (MQ=255) cagcagTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCg > 2:945452/1‑150 (MQ=255) gcagTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACt < 2:2043371/130‑1 (MQ=255) gcagTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACt > 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tGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTg < 2:784315/150‑1 (MQ=255) tatCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCGAGGCCAGGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGTCGAGTAGTACGGCAGCACTGCTTGGACTTTGCCt > 2:1785245/1‑150 (MQ=255) tatCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTAGGTACTTTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGTAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGCCTTTGCCt > 1:2279253/1‑150 (MQ=255) tCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGa > 2:2050599/1‑81 (MQ=255) tCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGa < 1:2050599/81‑1 (MQ=255) gcgCCAGCACCCCGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGgc > 1:577289/3‑126 (MQ=255) gcgCCAGCACCCCGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGgc < 2:577289/124‑1 (MQ=255) cGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTtgc < 1:1087239/150‑1 (MQ=255) gCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGGAGCACTGCTTCGACTTTGCCTtgctg > 1:605792/1‑150 (MQ=255) gCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTtgctg > 2:437304/1‑150 (MQ=255) gCCAGCACCCCGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTtgctg > 2:2150182/1‑150 (MQ=255) gCCAGCACCCCGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTtgctg > 2:1157170/1‑150 (MQ=255) ccAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTtgctgc < 1:207131/150‑1 (MQ=255) cAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTgctgct > 2:1647907/1‑150 (MQ=255) cACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGa < 1:1846048/150‑1 (MQ=255) cACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGa < 2:307601/150‑1 (MQ=255) cACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGa < 1:1647907/150‑1 (MQ=255) cACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGAGCGTTCTTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGa < 1:1357338/150‑1 (MQ=255) aCCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGa < 1:1260246/108‑1 (MQ=255) aCCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGa > 2:1260246/1‑108 (MQ=255) aCCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGAg > 1:2041142/1‑150 (MQ=255) aCCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCGGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGCTCAGTTTGGAAGAAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGAg > 2:1042868/1‑150 (MQ=255) ggggTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGCGTTATGGGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGAGGaa < 2:1902561/150‑1 (MQ=255) ggggTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGAGGaa > 1:1265643/1‑150 (MQ=255) | GGCACACCATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGAGGAA > NC_002947/286921‑287217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |