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Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
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gTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTcgcg < 1:1741418/150‑1 (MQ=255) ttGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCgg < 2:3849410/150‑1 (MQ=255) ttGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCgg > 2:352233/1‑150 (MQ=255) ggACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCGGGTAAAc > 1:2256055/1‑150 (MQ=255) ggACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCGGGTAAAc > 1:3334718/1‑150 (MQ=255) ggACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCGGGTAAAc < 2:1223354/150‑1 (MQ=255) gACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACCGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCGGGTAAAcc < 2:2635237/150‑1 (MQ=255) gCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:2094903/150‑1 (MQ=255) gCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCGGGTAAACCCGc < 2:453727/150‑1 (MQ=255) gCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCGGGTAAACCCGc > 2:358487/1‑150 (MQ=255) ttACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCGGGTAAACCCGCtt > 1:4372652/1‑150 (MQ=255) ttACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCGGGTAAACCCGCtg > 1:4047558/1‑149 (MQ=255) | CGCGTATGAATGGGCATGATCCGTATGCCTATCTCAAAGATGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTA > NC_002947/3971546‑3971841 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |