New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 170160 = | 46 (1.060) | 4 (0.100) | 4/246 | NT | 9.8% | coding (562/1221 nt) | PP_0159 | family III CoA‑transferase |
? | NC_002947 | 170220 = | 29 (0.690) | coding (622/1221 nt) | PP_0159 | family III CoA‑transferase |
TATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAAT > NC_002947/170013‑170309 | aatgaaatcgccatctgccgtcggaaagtcctggtaagggactatattaggatgcgcattacccagccgacggggaggggtgcccgtggtcaggtagttcatcgcctggttcgccagacaggccacctgcacatcaagcaatgccatGTc < 1:944378‑M1/3‑1 (MQ=255) atgaaatcgccatctgccgtcggaaagtcctggtaagggactatattaggatgcgcattacccagccgacggggaggggtgcccgtggtcaggtagttcatcgcctggttcgccagacaggccacctgcacatcaagcaatgccatGTCg < 1:707151‑M1/4‑1 (MQ=255) ccAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCa < 2:1020574/150‑1 (MQ=255) cAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGAAGGGCAGGTCAGGGTGGGTAAGCAGCATACAGGAAGTGTGGCCGTGTTGTATTCCGCGTTCGCCAt < 2:12008/150‑1 (MQ=255) cTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATgctggctg > 2:839612/1‑150 (MQ=255) ggCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGcc < 1:931712/150‑1 (MQ=255) gCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGccc > 1:439202/1‑150 (MQ=255) cTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCa < 1:839612/150‑1 (MQ=255) ttCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCAt > 1:772412/1‑150 (MQ=255) cATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCg < 1:952094/150‑1 (MQ=255) gATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGa < 2:1023168/150‑1 (MQ=255) gATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGa < 1:732905/150‑1 (MQ=255) aTCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTAAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGAt < 1:422507/150‑1 (MQ=255) ttGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAggg < 2:439202/150‑1 (MQ=255) tgggCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGCATTCCGCGGTCGCCCTGCGGGGTGCCCTCGCCCATCGGGATCCGACAGGGGTCgg > 2:820515/1‑150 (MQ=255) tgatgaGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGc < 2:409924/150‑1 (MQ=255) atgaGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATc < 2:1119418/124‑1 (MQ=255) atgaGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATc > 1:1119418/1‑124 (MQ=255) atgaGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCAt > 1:839715/1‑150 (MQ=255) atgaGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCAt < 2:755016/150‑1 (MQ=255) cgcattacccagccgacggggaggggtgcccgtggtcaggtagttcatcgcctggttcgccagacaggccacctgcacatcaagcaatgccatGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTc > 2:944378‑M1/94‑150 (MQ=255) tacccagccgacggggaggggtgcccgtggtcaggtagttcatcgcctggttcgccagacaggccacctgcacatcaagcaatgccatGTCGACATGCTG‑‑‑‑CCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCa > 1:464574‑M1/89‑150 (MQ=255) gACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCggg > 2:476153/1‑119 (MQ=255) gACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCggg < 1:476153/119‑1 (MQ=255) gTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCAt < 2:720290/107‑1 (MQ=255) gTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCAt > 1:720290/1‑107 (MQ=255) ccGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCtt < 2:611120/150‑1 (MQ=255) gAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGCTATTCTGATCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGAt < 2:820581/150‑1 (MQ=255) gAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGTGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGAt < 1:819674/150‑1 (MQ=255) gAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGAt < 1:852920/150‑1 (MQ=255) gTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGAGACTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGc < 1:901001/150‑1 (MQ=255) agaagGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGt < 2:839715/150‑1 (MQ=255) gcAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGt < 2:742843/116‑1 (MQ=255) gcAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGt > 1:742843/1‑116 (MQ=255) aaGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAgg > 2:274376/1‑89 (MQ=255) aaGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAgg < 1:274376/89‑1 (MQ=255) aGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAgg < 2:146589/150‑1 (MQ=255) tgggtgTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAAGCgg > 1:439257/1‑149 (MQ=255) ggtgTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACCGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATg < 2:772412/150‑1 (MQ=255) ccTTACCGATATTCTGACCGGGTTGCATTCCGCGGCCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGCCAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATTAACTACCt > 2:388932/2‑150 (MQ=255) agacaggccacctgcacatcaagcaatgccatGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGa < 1:441918‑M1/59‑1 (MQ=255) agacaggccacctgcacatcaagcaatgccatGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGa > 2:441918‑M1/33‑91 (MQ=255) aCCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGAGCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGAcc < 1:820515/150‑1 (MQ=255) cGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCAc > 2:979722/1‑150 (MQ=255) aCCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCt > 1:573260/1‑150 (MQ=255) cGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTcc < 2:980610/150‑1 (MQ=255) cGGGTTGTATTCCACGGACGCCATGCTTGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTcc > 2:346775/1‑150 (MQ=255) tATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACg > 2:903066/1‑132 (MQ=255) tATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACg < 1:903066/132‑1 (MQ=255) aTTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGc > 1:329284/1‑150 (MQ=255) ttCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATgg < 1:93312/71‑1 (MQ=255) ttCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATgg > 2:93312/1‑71 (MQ=255) ccGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTATGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTgg < 1:201849/150‑1 (MQ=255) cgcgGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTggg > 2:379746/1‑150 (MQ=255) GTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAAt > 1:979722‑M1/1‑150 (MQ=255) | TATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAAT > NC_002947/170013‑170309 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |