| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 741435 = | 57 (1.320) | 4 (0.100) | 4/242 | NT | 6.9% | intergenic (+32/‑468) | PP_t12/PP_0635 | tRNA‑Thr/group II intron‑encoding maturase |
| ? | NC_002947 | 741486 = | NA (NA) | intergenic (+83/‑417) | PP_t12/PP_0635 | tRNA‑Thr/group II intron‑encoding maturase | |||||
TTTGCGTTACGGGTGTGAGCAGTGGTACGTTGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGT > NC_002947/741288‑741581 | cgggcttccttcagattcgcggtcacccgcgacacccttgcctccggctaacacttccccttgccgggtgtgtagaggactttcacctccaagtcacccacttggccaaatcaaccaagcgggttgcgcttacgcgcaacgcgccatgcc < 1:289871‑M1/2‑1 (MQ=255) gggcttccttcagattcgcggtcacccgcgacacccttgcctccggctaacacttccccttgccgggtgtgtagaggactttcacctccaagtcacccacttggccaccacaaccaagcgggttgcgcttacgcgcaacgcgccatgCCt < 2:1128961‑M1/3‑1 (MQ=255) gggcttccttcagattcgcggtcacccgcgacacccttgcctccggctaacacttccccttgccgggtgtgtagaggactttcacctccaagtcacccacttggccaccacaaccaagcgggttgcgcttacgcgcaacgcgccatgCCt > 2:311379‑M1/148‑150 (MQ=255) ggcttccttcagattcgcggtcacccgcgacacccttgcctccggctaacacttccccttgccgggtgtgtagaggactttcacctccaagtcacccacttggccaccacaaccaagcgggttgcgcttacgcgcaacgcgccatgCCTg > 1:962310‑M1/147‑150 (MQ=255) gcttccttcagattcgcggtcacccgcgacacccttgcctccggctaacacttccccttgccgggtgtgtagaggactttcacctccaagtcacccacttggccaccacaaccaagcgggttgcgcttacgcgcaacgcgccatgCCTgg < 2:1126698‑M1/5‑1 (MQ=255) cttccttcagattcgcggtcacccgcgacacccttgcctccggctaacacttccccttgccgggtgtgtagaggactttcacctccaagtcacccacttggccaccacaaccaagcgggttgcgcttacgcgcaacgcgccatgCCTGGc > 1:1003123‑M1/145‑150 (MQ=255) cttccttcagattcgcggtcacccgcgacaccctaccaggttgctaacacttccccttgccgggtgtgtagaggactttcacctccaagtcacccacttggccaccacaaccaagcgggttgcgcttacgcgcaacgcgccatgCCTGGc > 1:900336‑M1/145‑150 (MQ=255) gTTACGGGTGTGAGCAGTGGTACGTTGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCGCCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCAc < 2:740257/150‑1 (MQ=255) ttACGGGTGTGAGCAGTGGTACGTTGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTTGCAcc > 1:597180/1‑150 (MQ=255) ttACGGGTGTGAGCAGTGGTACGTTGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCAcc > 1:730008/1‑150 (MQ=255) aCGGGTGTGAGCAGTGGTACGTTGCGCTACACGCCGGAGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCaa < 1:790286/150‑1 (MQ=255) cGGGTGTGAGCAGTGGTACGTTGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAAt < 1:106445/150‑1 (MQ=255) gTACGTTGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGGTTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTtgt > 1:481438/1‑150 (MQ=255) ttGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCggg < 2:153553/150‑1 (MQ=255) ttGCGCTACACGCAGGTGTAGCTCAGTCGGTAGTGCGGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCCGGTAC‑TTCCGTCTGCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCggg < 1:192750/150‑1 (MQ=255) acccttgcctccggctaacacttccccttgccgggtgtgtagaggactttcacctccaagtcacccacttggccaccacaaccaagcgggttgcgcttacgcgcaacgcgccatgCCTGGc > 2:568278‑M1/116‑121 (MQ=255) acccttgcctccggctaacacttccccttgccgggtgtgtagaggactttcacctccaagtcacccacttggccaccacaaccaagcgggttgcgcttacgcgcaacgcgccatgCCTGGc < 1:568278‑M1/6‑1 (MQ=255) tACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCttttt > 2:459018/1‑150 (MQ=255) acGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTtgt < 2:730008/150‑1 (MQ=255) acGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTtgt < 1:595118/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTtgtgt > 2:895345/1‑150 (MQ=255) cctccggctaacacttccccttgccgggtgtgtagaggactttcacctccaagtcacccacttggccaccacaaccaagcgggttgcgcttacgcgcaacgcgccatgCCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTtgtg < 1:38089‑M1/42‑1 (MQ=255) cGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCgg > 1:913757/1‑136 (MQ=255) cGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCgg < 2:913757/136‑1 (MQ=255) tgtAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGcc > 2:1028184/1‑150 (MQ=255) taacacttccccttgccgggtgtgtagaggactttcacctccaagtcacccacttggccaccacaaccaagcgggttgcgcttacgcgcaacgcgccatgCCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAg > 2:38089‑M1/101‑150 (MQ=255) gCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGc > 1:917395/1‑116 (MQ=255) gCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGc < 2:917395/116‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCAt > 2:896294/1‑150 (MQ=255) cacttccccttgccgggtgtgtagaggactttcacctccaagtcacccacttggccaccacaaccaagcgggttgcgcttacgcgcaacgcgccatgCCTg < 2:449057‑M1/4‑1 (MQ=255) cacttccccttgccgggtgtgtagaggactttcacctccaagtcacccacttggccaccacaaccaagcgggttgcgcttacgcgcaacgcgccatgCCTg > 1:449057‑M1/98‑101 (MQ=255) ggTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCgg > 2:35965/1‑121 (MQ=255) ggTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCgg < 1:35965/121‑1 (MQ=255) gagCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTgc < 1:311143/150‑1 (MQ=255) gagCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTgc > 2:311143/1‑150 (MQ=255) gagCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTgc > 2:1103307/1‑150 (MQ=255) gcagcGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTgcgc < 1:459018/150‑1 (MQ=255) gcagcGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTgcgc < 2:1001098/150‑1 (MQ=255) aCTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAgcg > 1:1064177/1‑150 (MQ=255) cGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCaa < 1:633994/150‑1 (MQ=255) tAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAAcc > 1:1065122/1‑150 (MQ=255) aggactttcacctccaagtcacccacttggccaccacaaccaagcgggttgcgcttacgcgcaacgcgccatgCCt < 2:564245‑M1/3‑1 (MQ=255) aggactttcacctccaagtcacccacttggccaccacaaccaagcgggttgcgcttacgcgcaacgcgccatgCCt > 1:564245‑M1/74‑76 (MQ=255) cgcgAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGc > 2:298092/1‑150 (MQ=255) ctttcacctccaagtcacccacttggccaccacaaccaagcgggttgcgcttgcgcgcaacgcgccatgCCTg > 2:1073828‑M1/70‑73 (MQ=255) ctttcacctccaagtcacccacttggccaccacaaccaagcgggttgcgcttgcgcgcaacgcgccatgCCTg < 1:1073828‑M1/4‑1 (MQ=255) tCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTtgt < 1:1028184/150‑1 (MQ=255) ccAGATTCGATTCCTGT‑GTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGTATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTgtgg < 2:176897/149‑1 (MQ=255) tCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCATGCCTGgcgcacaca > 2:806459/1‑112 (MQ=255) tCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCATGCCTGgcgcacaca < 1:806459/117‑6 (MQ=255) cccacttggccaccacaaccaagcgggttgcgcttacgcgcaacgcgccatgCCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAgg < 1:1034594‑M1/51‑1 (MQ=255) cccacttggccaccacaaccaagcgggttgcgcttacgcgcaacgcgccatgCCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAgg > 2:1034594‑M1/53‑103 (MQ=255) aTTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCaa > 2:414887/1‑61 (MQ=255) aTTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCaa < 1:414887/61‑1 (MQ=255) aTTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGTGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGt < 2:597180/150‑1 (MQ=255) cTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGt > 2:762691/1‑150 (MQ=255) cTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGt > 1:382610/1‑150 (MQ=255) t‑ctcCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCtttttt > 1:208307/1‑82 (MQ=255) t‑ctcCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCtttttt < 2:208307/82‑1 (MQ=255) tcCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTgtgg < 1:599972/132‑1 (MQ=255) tcCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTgtgg > 2:599972/1‑132 (MQ=255) tcCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACtt < 2:481438/150‑1 (MQ=255) ggCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGa > 2:66387/1‑150 (MQ=255) cAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTaa > 1:176166/1‑103 (MQ=255) cAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTaa < 2:176166/103‑1 (MQ=255) cAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAAcc > 1:379051/1‑111 (MQ=255) cAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAAcc < 2:379051/111‑1 (MQ=255) aGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGaa > 2:861375/1‑150 (MQ=255) attGGTCTATGGTGATTTCTCGCTACCTGGCACGAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGAGCGTAAGAGCACCCTCACTAGTTGTGGTAGCTAAGTGGGTGACTTGGAGGTAAAAGTCctc < 2:291527/149‑1 (MQ=21) cTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCct < 1:490669/143‑1 (MQ=255) cTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCct > 2:490669/1‑143 (MQ=255) ggCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCg < 2:1065122/150‑1 (MQ=255) ggCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCg > 2:347242/1‑150 (MQ=255) cGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGGGAAAGTCCTCTACACACCCGGc > 2:1009707/1‑150 (MQ=255) gATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCa > 2:920410/1‑150 (MQ=255) tcGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTTTTTTTTTTAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGa > 2:81853/1‑150 (MQ=17) gCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAg < 2:1064177/150‑1 (MQ=255) cTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAgt < 1:866548/150‑1 (MQ=255) | TTTGCGTTACGGGTGTGAGCAGTGGTACGTTGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGT‑CTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGT > NC_002947/741288‑741581 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |