New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 823176 | 54 (1.250) | 3 (0.080) +GGCACCGGCTCTGCCGGTG |
3/216 | NT | 5.9% | coding (1431/1431 nt) | PP_0708 | betaine‑aldehyde dehydrogenase |
? | NC_002947 | 1456002 = | 59 (1.360) | intergenic (+74/+175) | PP_1273/PP_1274 | multidrug MFS transporter outer membrane protein/short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
TGACGAGTCGATGTAGGCATCGGGGGGCAGTCCAGCTGGTAGGAGCGGGGGTGGACACACACCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGTGCCCCCCCAGGACGTTTCGACGAACACCGCCTGCACCGAGTTGATCCACACATGGCCAAC > NC_002947/823029‑823325 | tGACGAGTCGATGTAGGCATCGGGGGGCAGTCCAGCTGGTAGGAGCGGGGGTGGACACACACCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCa < 2:652282/150‑1 (MQ=255) aGGCATCGGGGGGCAGTCCAGCTGGTAGGAGCGGGGGTGGACACACACCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCggg > 1:959145/1‑150 (MQ=255) ggggggCAGTCCAGCTGGTAGGAGCGGGGGTGGACACACACCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATg < 2:959145/150‑1 (MQ=255) gggggCAGTCCAGCTGGTAGGAGCGGGGGTGGACACACACCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGc < 1:776602/150‑1 (MQ=255) tgggCAGTCCAGCTGGTAGGAGCGGGGGTGGACACACACCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCt < 2:779992/149‑1 (MQ=255) gCAGCCCAGCTGGTAGGAGCGGGGGTGGACACACACCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGa < 2:280002/150‑1 (MQ=255) cAGTCCAGCTGGTAGGAGCGGGGGTGGACACACACCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGAt > 2:602653/1‑150 (MQ=255) gTCCAGCTGGTAGGAGCGGGGGTGGACACACACCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCtt < 2:382768/145‑1 (MQ=255) gTCCAGCTGGTAGGAGCGGGGGTGGACACACACCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCtt > 1:382768/1‑145 (MQ=255) ccAGCTGGTAGGAGCGGGGGTGGACACACACCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGAc < 2:1007000/150‑1 (MQ=255) cAGCTGGTAGGAGCGGGGGTGGACACACACCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACt > 2:171436/1‑150 (MQ=255) cTGGTAGGAGCGGGGGTGGACACACACCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGAcatca < 1:111966/150‑5 (MQ=255) cTGGTAGGAGCGGGGGTGGACACACACCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGAt < 2:1089897/150‑1 (MQ=255) aGGAGCGGGGGTGGACACACACCGGAGTTTGGACAGAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGcc < 2:783802/150‑1 (MQ=255) cGGGGGTGGACACACACCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACaa < 1:1063596/150‑1 (MQ=255) ggACACACACCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCaa < 2:1068829/150‑1 (MQ=255) gACACACACCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAg < 1:492380/150‑1 (MQ=255) acacacacCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGCTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAgg > 1:900301/1‑150 (MQ=255) cacacCGGAGTTTGGACACTCTCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGccc < 1:335675/150‑1 (MQ=255) acacCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGcccc > 2:633751/1‑150 (MQ=255) acCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCTAGACAGCGGGTTACATGCtt < 2:1066581/114‑1 (MQ=255) acCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCTAGACAGCGGGTTACATGCtt > 1:1066581/1‑114 (MQ=255) cGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCt > 1:189466/1‑150 (MQ=255) ggAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTc > 2:1002059/1‑150 (MQ=255) aGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGATAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACg < 1:193725/140‑1 (MQ=255) aGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGATAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACg > 2:193725/1‑140 (MQ=255) aGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGcc > 1:758340/1‑114 (MQ=255) aGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGcc < 2:758340/114‑1 (MQ=255) cgcgGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAAcccc < 1:540970/119‑1 (MQ=255) cGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAAcccc > 2:540970/1‑119 (MQ=255) tGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCt > 2:707392/1‑150 (MQ=255) ggAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGt > 1:659137/1‑150 (MQ=255) ggAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGt < 2:522116/150‑1 (MQ=255) gAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAgg > 2:1090149/1‑100 (MQ=255) gAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAgg < 1:1090149/100‑1 (MQ=255) gAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGTg > 1:521494/1‑150 (MQ=255) aCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCtt < 2:1042729/84‑1 (MQ=255) aCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCtt < 2:468480/84‑1 (MQ=255) aCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCtt > 1:1042729/1‑84 (MQ=255) aCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCtt > 1:468480/1‑84 (MQ=255) gggTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGTGcccc < 2:189466/150‑1 (MQ=255) ttACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGTGCCCCCCCa < 2:521494/150‑1 (MQ=255) ttACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGTGCCCCCCCa < 1:633751/150‑1 (MQ=255) tACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGTGCCCCCCCAg < 2:373669/150‑1 (MQ=255) cgAACACCGTCAGAGCCTGTGCCATAACGCCACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCTACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGTGCCCCCCCAGGACGtt < 2:222079/150‑1 (MQ=255) cGGCAGAGCAGGTGGCATAAGGTGACCCCTTGCGATATCCGCCCAGCCGGAAGAGGACATTGTGGATAGACTGATAGGCCGACAACCTCCAACTCCCCGGCTCACGGCCCATTCAGATGCCCTTGGTGCCCCCCCAGGACGTCTcgacga > 2:542109/1‑150 (MQ=255) ggCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGTGCCCCCCCAGGACGTTTCGACGaa > 1:614425/1‑150 (MQ=255) ggCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGTGCCCCCCCAGGACGTTTCGACGaa > 1:1102871/1‑150 (MQ=255) cGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATggcaccggctctgccggtgttcgcgggtaaacccgttcctacagcggcctgtgtccaaactccggtgtgtgtcc < 1:316680‑M1/103‑75 (MQ=255) cGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATggcaccggctctgccggtgttcgcgggtaaacccgttcctacagcggcctgtgtccaaactccggtgtgtgtcc > 2:316680‑M1/1‑29 (MQ=255) cATAACGCGACCCCTTGCGATATggcaccggctctgccggtgttcgcgggtaaacccgttcctacagcggcctgtgtccaaactccgg > 2:505597‑M1/1‑23 (MQ=255) aTAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTAACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGTGCCCCCCCAGGACGTTTCGACGAACACCGCCTGCACCGa > 1:780405/1‑150 (MQ=255) aCGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGTGCCCCCCCAGGACGTTTCGACGAACACCGCCTGCACCGCGtt > 2:58597/1‑150 (MQ=255) gcgACCCCTTGCGATATCAGCCCAGCCAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGTGCCCTCCCAGGACGTTTCGACGAACACCGCCTGCACCGAGTTGa < 2:265292/150‑1 (MQ=255) gACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGTGCCCCCCCAGGACGTTTCGACGAACACCGCCTGCACCGAGTTGATc > 2:979906/1‑150 (MQ=255) ccccTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGTGCCCCCCCAGGACGTTTCGACGAACACCGCCTGCACCGAGTTGATCca < 1:171436/150‑1 (MQ=255) ccTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGTGCCCCCCCAGGACGTTTCGACGAACACCGCCTGCACCGAGTTGATCcaca > 2:809835/1‑150 (MQ=255) cTTGCGAGATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCTACACCCTCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGTGCCCCCCCAGGACGTTTCGACGAACACCGCCTGCACCGAGTTGATCcacac < 1:185379/150‑1 (MQ=255) tCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGTGCCCCCCCAGGACGTTTCGACGAACACCGCCTGCACCGAGTTGATCCACACATgagatcg > 1:966401/1‑144 (MQ=255) | TGACGAGTCGATGTAGGCATCGGGGGGCAGTCCAGCTGGTAGGAGCGGGGGTGGACACACACCGGAGTTTGGACACAGGCCGCTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATAACGCGACCCCTTGCGATATCAGCCCAGACAGCGGGTTACATGCTTGATCGACTGATAGGCCGACAACCCCCAAGGCCCCAGCTCACGGCCGATCCCGCTGCCCTTGGTGCCCCCCCAGGACGTTTCGACGAACACCGCCTGCACCGAGTTGATCCACACATGGCCAAC > NC_002947/823029‑823325 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |