New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3619529 = | 31 (0.720) | 3 (0.070) | 3/240 | NT | 8.9% | coding (867/948 nt) | PP_3190 | ornithine cyclodeaminase/mu‑crystallin family protein |
? | NC_002947 | 3619568 = | 32 (0.780) | coding (828/948 nt) | PP_3190 | ornithine cyclodeaminase/mu‑crystallin family protein |
AATGGCAAGGTGCTGATGCAGCGCACGCCAGCGCAGGTGCAACGTTTGCGCTGACGCTGTTGTTGCCTCAGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGATGCGGCCACAGCCGAGGGCATGGGCCACTTCGCCGTACTGGCTGCACTGGGCGATGGCGTCGACGATGATGCGGTC > NC_002947/3619381‑3619678 | aaTGGCAAGGTGCTGATGCAGCGCACGCCAGCGCAGGTGCAACGTTTGCGCTGACGCTGTTGTTGCCTCAGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCt > 2:1077846/1‑150 (MQ=255) agcaggaactggacccggcactggtggcaagggcggaccgcatcatcgtcgacgccatcgcccagtgcagccagtacggcgaagtggcccatgccctcggctgtggccgcatcgacgctaaccagctgatcgagctgggtacgctgctgg > 1:146704‑M1/147‑150 (MQ=255) aggaactggacccggcactggtggcaagggcggaccgcatcatcgtcgacgccatcgcccagtgcagccagtacggcgaagtggcccatgccctcggctgtggccgcatcgacgctaaccagctgatcgagctgggtacgctgctggctg > 2:559012‑M1/144‑150 (MQ=255) aggaactggacccggcactggtggcaagggcggaccgcatcatcgtcgacgccatcgcccagtgcagccagtaaggcgaagtggcccatgtcttggggtggggctgcatcgacgctaaccagctgatcgagctgggtacgctgctggctg > 1:982111‑M1/144‑150 (MQ=255) aGGTGCTGATGCAGCGCACGCCAGCGCAGGTGCAACGTTTGCGCTGACGCTGTTGTTGCCTCAGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTc < 1:1077846/150‑1 (MQ=255) tGCTGATGCAGCGCACGCCAGCGCAGGTGCAACGTTTGCGCTGACGCTGTTGTTGCCTCAGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTg < 1:175372/150‑1 (MQ=255) aGCGCACGCCAGCGCAGGTGCAACGTTTGCGCTGACGCTGTTGTTGCCTCAGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGccc > 2:258186/1‑150 (MQ=255) cACGCCAGCGCAGGTGCAACGTTTGCGCTGACGCTGTTGTTGCCTCAGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGGAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTg > 2:933280/1‑150 (MQ=255) cAGCGCAGGTGCAACGTTTGCGCTGACGCTGTTGTTGCCTCAGGTGCACAGGGCGGCCAATGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACg < 2:821273/150‑1 (MQ=255) aGGTGCAACGTTTGCGCTGACGCTGTTGTGGCCGGGGTTGCACAGAGCGGCCCCGGATAGACTTTGCAGCAGATCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGgccagc < 1:569878/150‑1 (MQ=255) cAACGTTTGCGCTGACGCTGTTGTTGCCTCAGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCcagca > 2:1046683/1‑150 (MQ=255) gcatcatcgtcgacgccatcgcccagtgcagccagcacggcgaagtggcccatgccctcggctgtggccgcatcgacgctaaccagctgatcgagctgggtacgctgCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCagcagc > 2:312139‑M1/108‑150 (MQ=255) tGCGCTGACGCTGTTGTTGCCTCAGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTAcc < 1:1028274/150‑1 (MQ=255) gcTGACGCTGTTGTTGCCTCAGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAg > 1:609960/1‑150 (MQ=255) gACGCTGTTGTTGCCTCAGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTgg > 2:677965/1‑100 (MQ=255) gACGCTGTTGTTGCCTCAGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTgg < 1:677965/100‑1 (MQ=255) gccatcgcccagtgcagccagtacggcgaagtggcccatgccctcggctgtggccgcatcgacgctaaccagctgatcgagctgggtacgctgCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGgcca < 1:142187‑M1/34‑1 (MQ=255) gccatcgcccagtgcagccagtacggcgaagtggcccatgccctcggctgtggccgcatcgacgctaaccagctgatcgagctgggtacgctgCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGgcca > 2:142187‑M1/94‑127 (MQ=255) gCTGTTGTTGCCTCAGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCagcagc > 1:352149/1‑136 (MQ=255) gCTGTTGTTGCCTCAGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCagcagc < 2:352149/136‑1 (MQ=255) cTGTTGTTGCCTCAGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGGATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATc < 1:1039128/150‑1 (MQ=255) ttgttgCCTCAGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGc < 1:650784/150‑1 (MQ=255) gCCTCAGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGtt < 2:82681/150‑1 (MQ=255) ccTCAGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTa > 2:142555/1‑150 (MQ=255) aGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGt < 2:609960/150‑1 (MQ=255) tGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGa < 1:142555/150‑1 (MQ=255) gggCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACCTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGATGCGGc > 2:1129971/1‑150 (MQ=255) aaGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCt > 1:32651/1‑68 (MQ=255) aaGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCt < 2:32651/68‑1 (MQ=255) gCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGATGCGGCCACAGCCGAgg > 1:444757/1‑150 (MQ=255) ttGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGATGCGGCCACAGCCGAGGGCATggg > 2:175420/1‑150 (MQ=255) ttGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCAGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGATGCGGCCACAGCCGAGGGCATggg > 2:770246/1‑150 (MQ=255) cGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGATGCGGCCACAGCCGAGGGCATGGGCCa > 1:858009/1‑150 (MQ=255) gACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGATGCGGCCACAGCCGAGGGCATGGGCCAc > 2:622314/1‑150 (MQ=255) gtgCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGATGCGGCCACAGCCGAGGGCATGGGCCACTTCGc < 1:258186/150‑1 (MQ=255) ctgcactgcaACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGATGCGGCCACAGCCGAgg < 1:271468/127‑1 (MQ=255) ctgcactgcaACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTAACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGATGCGGCCACAGCCGAgg > 2:271468/1‑127 (MQ=255) tgcactgcaACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGATGCGGCCACAGCCTAGGGCATGGGCCACTTCGCCGTACTgg > 2:589777/1‑150 (MQ=255) tgcactgcaACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGATGCGGCCACAGCCGAGGGCATGGGCCACTTCGCCGTACTgg > 2:234791/1‑150 (MQ=255) ggTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCAAGTCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGATGCGGCCACAGCCGAGGGCATGGGCCACTTCGCCGTACTGGCTGCACTGGGCGAt < 1:673706/150‑1 (MQ=255) gTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGATGCGGCCACAGCCGAGGGCATGGGCCACTTCGCCGTACTGGCTGCACTGGGCGATGGCGTCGACGatgatg < 1:1129971/150‑1 (MQ=255) gTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGATGCGGCCACAGCCGAGGGCATGGGCCACTTCGCCGTACTGGCTGCACTGGGCGATGGCGTCGACGatgatg < 1:604882/150‑1 (MQ=255) gTAATCTGGCTGGCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGATGCGGCCACAGCCGAGGGCATGGGCCACTTCGCCGTACTGGCTGCACTGGGCGATGGCGTCGACGatgatg < 2:209433/150‑1 (MQ=255) tCTGGCTGTGGTGCGCCCGCCACTGGGCACGGCAAGCCAGCGGCGTCCCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGCTGCGGCCACGGCCGCGGGCATGGGCCACTTCGCCGTACTGGCTGCACTGGGCGATGGCGTCGACGATGATGCGGt < 2:139356/150‑1 (MQ=255) CTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGATGCGGCCACAGCCGAGGGCATGGGCCACTTCGCCGTACTGGCTGCACTGGGCGATGGCGTCGACGATGATGCGGTc > 2:858009‑M1/1‑150 (MQ=255) | AATGGCAAGGTGCTGATGCAGCGCACGCCAGCGCAGGTGCAACGTTTGCGCTGACGCTGTTGTTGCCTCAGGTGCACAGGGCGGCCAAGGCGTGGCTTGCGACTTGTGCATCCTGCACTGCAACACCGGTCAGGTCCGCCAAGGTAATCTGGCTGTCGTGCTCACGCCCCTTGGCACGGCCAGCCAGCAGCGTACCCAGCTCGATCAGCTGGTTAGCGTCGATGCGGCCACAGCCGAGGGCATGGGCCACTTCGCCGTACTGGCTGCACTGGGCGATGGCGTCGACGATGATGCGGTC > NC_002947/3619381‑3619678 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |