New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5299581 = | 47 (1.080) | 4 (0.100) | 4/238 | NT | 8.1% | coding (569/2076 nt) | recD | multifunctional ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease/ssDNA endonuclease |
? | NC_002947 | 5299642 = | 47 (1.160) | coding (508/2076 nt) | recD | multifunctional ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease/ssDNA endonuclease |
CTGCAGCAACGCCAGCAGGCGCACCACGGTGGTCGTCTTGCCAGTACCGGGGCCGCCAGTGATGATGCTGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAGGTAAAGGCGCTCGCCACTGCGTACAAGCGGCCGCGCTTGCTGG > NC_002947/5299433‑5299727 | ttaaatgcctggcttcagcgcatcagcgccagcccgctggtggccgcaggtgatacgcctggccagcaagcgcggccgcttgtacgcagtggcgagcgcctttacctgcgccgttactggagttacgagcggcgcatcgaccaggcccTg < 2:947533‑M1/2‑1 (MQ=255) taaatgccgggcttgagcgcatcagcgccaccccgctggtgggcgctggtgatacgcctggctagcaagcgcggccgcttgtacgcagtggcgagcgcctttacctgcgccgttactgtagttacgagcggcgcatccagcaggaccTgc > 2:229907‑M1/148‑150 (MQ=255) gcagcaACGCCAGCAGGCGCACCACGGTGGTCGTCTTGCCAGTACCGGGGCCGCCAGTGATGATGCTGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTgcg > 2:224809/1‑150 (MQ=255) aaatgcctggcttcagcgcatcagcgccagcccgctggtggccgcaggtgatacgcctggccagcaagcgcggccgcttgtacgcagtggcgagcgcctttacctgcgccgttactggagttacgagcggcgcatcggccaggcccTgcg < 1:520980‑M1/4‑1 (MQ=255) cagcaACGCCAGCAGGCGCACCACGGTGGTCGTCTTGCCAGTACCGGGGCCGCCAGTGATGATGCTGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTgcgc > 1:501995/1‑150 (MQ=255) gCCAGCAGGCGCACCACGGTGGTCGTCTTGCCAGTACCGGGGCCGCCAGTGATGATGCTGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGc > 2:472775/1‑150 (MQ=255) cagcagGCGCACCACGGTGGTCGTCTTGCCAGTACCGGGGCCGCCAGTGATGATGCTGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGctc < 1:719642/150‑1 (MQ=255) agcagGCGCACCACGGTGGTCGTCTTGCCAGTACCGGGGCCGCCAGTGATGATGCTGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGctct > 1:173843/1‑150 (MQ=255) gcagGCGCACCACGGTGGTCGTCTTGCCAGTACCGGGGCCGCCAGTGATGATGCTGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTg > 2:534971/1‑150 (MQ=255) gcgcACCACGGTGGTCGTCTTGCCAGTACCGGGGCCGCCAGTGATGATGCTGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAg < 2:249411/150‑1 (MQ=255) gcgcACCACGGTGGTCGTCTTGCCAGTACCGGGGCCGCCAGTGATGATGCTGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAg < 2:189573/150‑1 (MQ=255) gcACCACGGTGGTCGTCTTGCCAGTACCGGGGCCGCCAGTGATGATGCTGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGt < 1:760912/150‑1 (MQ=255) tggtCGTCTTGCCAGTACCGGGGCCGCCAGTGATGATGCTGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCg < 1:1130066/150‑1 (MQ=255) tcTTGCCAGTACCGGGGCCGCCAGTGATGATGCTGAAACCGGCACGGGTGG‑CAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCAGTGCTTc > 2:569684/1‑150 (MQ=255) ttGCCAGTACCGGGGCCGCCAGTGATGATGCTGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCg < 1:349702/150‑1 (MQ=255) ttGCCAGTACCGGGGCCGCCAGTGATGATGCTGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCg < 1:534971/150‑1 (MQ=255) cAGTACCGGGGCCGCCAGTGATGATGCTGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCt > 2:1120312/1‑150 (MQ=255) caaCCGGGGCAGCCAGGGATGATGTTGAAACCGGCACTGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGa < 2:341940/148‑1 (MQ=255) gggCCGCCAGTGATGATGCTGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAgg > 1:484347/1‑150 (MQ=255) acgcctggccagcaagcgcggccggttgtacgcagtggcgagcgcctttacctgcgccgttactggagttacgagcggcgcatcgaccaggcccTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTg > 2:378240‑M1/95‑150 (MQ=255) tggccagcaagcgcggccgcttgtacgcagtggcgagcgcctttacctgcgccgttactggagttacgagcggcgcatcgaccaggcccTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCa > 1:581838‑M1/90‑150 (MQ=255) atgatgCTGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAgg < 1:94178/150‑1 (MQ=255) gCTGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTg < 1:444531/150‑1 (MQ=255) tGAAACCTGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGt > 2:381330/1‑150 (MQ=255) tGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGctct < 1:1076167/95‑1 (MQ=255) tGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGctct > 2:1076167/1‑95 (MQ=255) aaaCCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTg > 2:856234/1‑146 (MQ=255) aaaCCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTg < 1:856234/146‑1 (MQ=255) aCCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGAt > 1:360203/1‑150 (MQ=255) ttgtacgcagtggcgagcgcctttacctgcgccgttactggagttacgagcggcgcatcgaccaggcccTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAg > 1:1053779‑M1/70‑131 (MQ=255) ttgtacgcagtggcgagcgcctttacctgcgccgttactggagttacgagcggcgcatcgaccaggcccTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAg < 2:1053779‑M1/62‑1 (MQ=255) aGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGgcgc < 1:775350/150‑1 (MQ=255) cTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAg < 1:224809/150‑1 (MQ=255) cTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGc < 2:35382/73‑1 (MQ=255) cTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGc > 1:35382/1‑73 (MQ=255) tGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAGGTaa > 2:748901/1‑150 (MQ=255) gCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAGGTaaa > 1:688102/1‑150 (MQ=255) ccAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAGGTAAAg < 2:282014/150‑1 (MQ=255) gTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCt < 2:461375/80‑1 (MQ=255) gTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCt > 1:461375/1‑80 (MQ=255) cACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGACAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAGGTAAAGGCGCTc < 2:404878/150‑1 (MQ=255) tggcttcAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAGGTAAAGGCGCTCGc > 2:294079/7‑150 (MQ=255) cTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAg < 1:233889/124‑1 (MQ=255) cTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAg > 2:233889/1‑124 (MQ=255) cTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAGGTAAAGGCGCTCGcc > 2:973755/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAAACAGATGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTACCGGTGCTGGGCAAGGCGCGCGCCAc > 1:515734/1‑150 (MQ=255) gCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCCGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAGGTAAAGGCGCTCGCCACt < 2:501995/150‑1 (MQ=255) cgcgcCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAGGTAAAGGCGCTCGCCACTGCGTACAAg < 1:728916/150‑1 (MQ=255) gccgccCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAGGTAAAGGCGCTCGCCACTGCGTACAAGCgg > 1:14878/1‑150 (MQ=255) cccTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAg > 2:516854/1‑62 (MQ=255) cccTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAg < 1:516854/62‑1 (MQ=255) ccTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGTGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAGGTAAAGGCGCTCGCCACTGCGTACAAGCGGCcgcg > 2:774912/1‑150 (MQ=255) ccTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTgg < 1:954407/68‑1 (MQ=255) ccTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTgg > 2:954407/1‑68 (MQ=255) cTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAGGTAAGGGCGCTCGCCACTGCGTACAAGCGGCCgcgc > 2:390975/1‑150 (MQ=255) cTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAGGTAAAGGCGCTCGCCACTGCGTACAAGCGGCCgcgc > 1:216972/1‑150 (MQ=255) cAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAGGTAAAGGCGCTCGCCACTGCGTACAAGCGGCCGCGCTTGCTg < 2:180682/150‑1 (MQ=255) cAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAGGTAAAGGCGCTCGCCACTGCGTACAAGCGGCCGCGCTTGCTg < 1:960977/150‑1 (MQ=255) cAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAGGTAAAGGCGCTCGCCACTGCGTACAAGCGGCCGCGCTTGCTg < 1:958241/150‑1 (MQ=255) aGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAGGTAAAGGCGCTCGCCACTGCGTACAAGCGGCCGCGCTTGCTgg > 1:494399/1‑150 (MQ=255) | CTGCAGCAACGCCAGCAGGCGCACCACGGTGGTCGTCTTGCCAGTACCGGGGCCGCCAGTGATGATGCTGAAACCGGCACGGGTGGCCAAGGCACAGGCGAGCTTCTGCCAGTCCACCTGGCCAGCTGGCGCGCCGCCCTCGAACAGTTGCGCCAGACGCTCTGGCAGGTCCGCAGGCGGTGCTTCGGCCTGACTCAGGCGCTGGCGCAGGGCCTGGTCGATGCGCCGCTCGTAACTCCAGTAACGGCGCAGGTAAAGGCGCTCGCCACTGCGTACAAGCGGCCGCGCTTGCTGG > NC_002947/5299433‑5299727 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |