New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 6045574 = | 53 (1.220) | 5 (0.120) | 5/248 | NT | 9.2% | coding (593/768 nt) | PP_5298 | glutamine amidotransferase |
? | NC_002947 | 6045623 = | 47 (1.110) | coding (544/768 nt) | PP_5298 | glutamine amidotransferase |
TGCGTAGGCATTGCAGGCCTCGCGAAACGCCTGAAACAGACGCAGCGAGACCGGGTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTAT > NC_002947/6045426‑6045714 | gaactgcctggctaccttgaccaccgcgaacctgaggacgcccccctggaggtgcaatacggccctcgccactcggtcagcatcgagcctggcgggttgttcgagcgcctggggttggtggcgcagttcgaggtcaattcgctgcacaGc < 1:691772‑M1/2‑1 (MQ=255) gcGTAGGCATTGCAGGCCTCGCGAAACGCCTGAAACAGACGCAGCGAGACCGGGTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGcc > 2:590550/1‑150 (MQ=255) tAGGCATTGCAGGCCTCGCGAAACGCCTGAAACAGACGCAGCGAGACCGGGTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATTCGGGGCCCGt > 1:180893/1‑150 (MQ=255) tAGGCATTGCAGGCCTCGCGAAACGCCTGAAACAGACGCAGCGAGACCGGGTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGt > 1:677730/1‑150 (MQ=255) aGGCATTGCAGGCCTCGCGAAACGCCTGAAACAGACGCAGCGAGACCGGGTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTg > 2:31989/1‑150 (MQ=255) ggCATTGCAGGCCTCGCGAAACGCCTGAAACAGACGCAGCGAGACCGGGTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGc < 2:362463/150‑1 (MQ=255) gCCTCGCGAAACGCCTGAAACAGACGCAGCGAGACCGGGTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACgcgc > 2:318762/1‑150 (MQ=255) ccTCGCGAAACGCCTGAAACAGACGCAGCGAGACCGGGTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCa > 1:1126189/1‑150 (MQ=255) cTCGCGAAACGCCTGAAACAGACGCAGCGAGACCGGGTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAg > 1:951593/1‑150 (MQ=255) cTCGCGAAACGCCTGAAACAGACGCAGCGAGACCGGGTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAg > 1:365397/1‑150 (MQ=255) cTCGCGAAACGCCTGAAACAGACGCAGCGAGACCGGGTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACAGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAg > 1:455235/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTGAAACAGACGCAGCGAGACCGGGTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTggg < 1:502752/150‑1 (MQ=255) aaCGCCTGAAACAGACGCAGCGAGACCGGGTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTggg > 1:533842/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTGAAACAGACGCAGCGAGACCGGGTTTTCGGTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCAAAAAAAGAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTggg < 1:192299/150‑1 (MQ=255) tGAAACAGACGCAGCGAGACCGGGTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGa < 2:189721/150‑1 (MQ=255) ctgaggacgcccccctggaggtgcaatacggccctcgccactcggtcagcatcgagcctggcgggttgttcgagcgcctggggttggtggcgcagttcgaggtcaattcgctgcacaGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGa < 1:393614‑M1/33‑1 (MQ=255) gAAACAGACGCAGCGAGACCGGGTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGAc < 2:1099124/150‑1 (MQ=255) aCGCAGCGAGACCGGGTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGAt < 1:318762/150‑1 (MQ=255) aGCGAGACCGGGTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGaggcac < 2:78636/150‑6 (MQ=255) tggaggtgcaatacggccctcgccactcggtcagcatcgagcctggcgggttgttcgagcgcctggggttggtggcgcagttcgaggtcaattcgctgcacaGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTgg > 2:623259‑M1/103‑150 (MQ=255) ggaggtgcaatacggccctcgccactcggtcagcatcgagcctggcgggttgttcgagcgcctggggttggtggcgcagttcgaggtcaattcgctgcacaGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGc > 2:393614‑M1/102‑150 (MQ=255) gggTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGc > 2:740429/1‑150 (MQ=255) gggTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGc < 2:1019857/150‑1 (MQ=255) ttttCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGc < 2:542965/150‑1 (MQ=255) tCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCAATGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGaa < 2:986882/150‑1 (MQ=255) cGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAAt < 2:533842/150‑1 (MQ=255) gTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAAtt < 1:446008/150‑1 (MQ=255) ttGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGaa > 1:134651/1‑147 (MQ=255) ttGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGaa < 2:134651/147‑1 (MQ=255) ttGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTg > 2:378357/1‑150 (MQ=255) aGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCt < 2:1129434/150‑1 (MQ=255) actcggtcagcatcgagcctggcgggttgttcgagcgcctggggttggtggcgcagttcgaggtcaattcgctgcacaGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGt > 1:195591‑M1/79‑115 (MQ=255) actcggtcagcatcgagcctggcgggttgttcgagcgcctggggttggtggcgcagttcgaggtcaattcgctgcacaGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGt < 2:195591‑M1/37‑1 (MQ=255) aCTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACt > 1:17834/1‑150 (MQ=255) tCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACAGCCTCGATCAGGCGATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTgc < 2:602761/150‑1 (MQ=255) tCCGGGTGCCACTACACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACTGCCTCGATCAGGCGATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTgc < 2:602781/150‑1 (MQ=255) ccACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCaa < 2:365397/150‑1 (MQ=255) cACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCt > 2:744174/1‑76 (MQ=255) cACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCt < 1:744174/76‑1 (MQ=255) cACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAAc > 2:691772/1‑150 (MQ=255) aCTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCGATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAAcc > 2:706147/1‑150 (MQ=255) ccAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGgcgc > 1:935445/1‑150 (MQ=255) ccAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGGCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGgcgc > 1:822955/1‑150 (MQ=255) cAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCt > 1:224801/1‑150 (MQ=255) cAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCt < 1:811701/150‑1 (MQ=255) aaGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCACCCCCAGGCGCTc < 2:1126189/150‑1 (MQ=255) aaGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTc > 2:903312/1‑150 (MQ=255) cacaAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGaa < 1:31989/150‑1 (MQ=255) aaaGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGaacaa < 1:901937/150‑1 (MQ=255) ccGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCt > 2:664909/1‑150 (MQ=255) aGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGAt < 1:740429/150‑1 (MQ=255) aGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGAt < 2:860288/150‑1 (MQ=255) ggCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCTGATTCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATg < 1:910933/150‑1 (MQ=255) tGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGa < 1:378357/150‑1 (MQ=255) acCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAg > 2:191823/1‑150 (MQ=255) cGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTg > 2:117005/1‑150 (MQ=255) aGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGa > 1:828897/1‑127 (MQ=255) aGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGa < 2:828897/127‑1 (MQ=255) gCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTa < 2:677730/150‑1 (MQ=255) ccATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTAt < 2:17834/150‑1 (MQ=255) | TGCGTAGGCATTGCAGGCCTCGCGAAACGCCTGAAACAGACGCAGCGAGACCGGGTTTTCGTTGAAGCGCCACTCCGGGTGCCACTGCACCCCAAGCACAAAGCCCGGTGCCGCAGGCATGGACACCGCCTCGATCAGGCCATCCGGGGCCCGTGCCTCGACGCGCAGGCCTGGGGCCAGACGGTCGATGCCCTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTAT > NC_002947/6045426‑6045714 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |