New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1332458 | 38 (0.880) | 4 (0.100) | 4/236 | NT | 10.6% | intergenic (+33/‑1223) | PP_1157/PP_1159 | acetolactate synthase/membrane protein |
? | NC_002947 | = 1332481 | 32 (0.800) | intergenic (+56/‑1200) | PP_1157/PP_1159 | acetolactate synthase/membrane protein |
CCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCATGACTATTGGTTCAACACACAACCATCCTGCCGATCTGGCCATCGACCCTTCGCTG > NC_002947/1332332‑1332625 | cccAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTa < 1:760693/150‑1 (MQ=255) ccAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAg > 2:240323‑M2/1‑149 (MQ=255) ccAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAg < 2:1038097‑M2/150‑2 (MQ=255) cACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCa < 1:647908/150‑1 (MQ=255) aCGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAg < 2:756613/150‑1 (MQ=255) aCGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAg < 2:584965/150‑1 (MQ=255) cGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAgg > 1:995645/1‑150 (MQ=255) gTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGt < 1:961104/150‑1 (MQ=255) aTCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCt > 2:123530/1‑150 (MQ=255) gACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACa < 1:134069/150‑1 (MQ=255) tGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCTACAGG‑ATCGTGTGATACCTGTGggtgccggcttactgcgataag > 1:116511‑M2/1‑128 (MQ=255) gATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACtt > 2:1040292/1‑150 (MQ=255) aTTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCTACAGG‑ATCGTGTGATACCTGTGggtgccggcttactgcga > 2:119118‑M2/1‑118 (MQ=255) aTTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCTACAGG‑ATCGTGTGATACCTGTGggtgccggcttactgcga < 1:119118‑M2/136‑19 (MQ=255) aCCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAAtt > 2:330192/1‑150 (MQ=255) cGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGa < 1:330192/150‑1 (MQ=255) cGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGa > 2:485883/1‑150 (MQ=255) gCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGAt > 2:1010016/1‑150 (MQ=255) ccTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCaa < 2:1111006/141‑1 (MQ=255) ccTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCaa > 1:1111006/1‑141 (MQ=255) tCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTg < 1:872342/136‑1 (MQ=255) tCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTg > 2:872342/1‑136 (MQ=255) aCAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAg < 1:1100895/150‑1 (MQ=255) cAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAgg < 2:995645/150‑1 (MQ=255) aGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACATCACGCATTTAGCGATTGATCATTCTCAGGt > 1:335770/1‑150 (MQ=255) cGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTc > 1:331763/1‑119 (MQ=255) cGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTc < 2:331763/119‑1 (MQ=255) aGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTtctc < 1:1046015/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAAc < 2:263313/93‑1 (MQ=255) tGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAAc > 1:263313/1‑93 (MQ=255) tGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACga < 1:123530/150‑1 (MQ=255) tgtAAGGCCTAACTACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGCT‑CCTGTAGGTGCCCGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCAt < 2:603336/150‑1 (MQ=255) gCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCATGACTAt < 2:383057/150‑1 (MQ=255) gCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCATGACTAt > 2:835357/1‑150 (MQ=255) cgttaggccTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCATGACTATTg > 2:72591/8‑150 (MQ=255) cTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCATGACTATTg < 1:282798/150‑1 (MQ=255) cTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCATGACTATTg < 1:1010016/150‑1 (MQ=255) cTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCATGACTATTGGTTCAaca > 2:668139/1‑150 (MQ=255) cTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCATGACTATTGGTTCAaca > 1:601812/1‑150 (MQ=255) cGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCATGACTATTGGTTCAACACACAACCATCCTGcc > 1:768831/1‑150 (MQ=255) cacGAT‑CCTGTAggtgccggcttactgcgataaggtcgttaggccttacaccgccagcgcgcgctcacgcagctcgctgttgaggatgcggtcgttctcgctgtaatcgaccgggcagtcgatcacgtgcacacctggggtcttgatgca < 1:384606‑M2/150‑139 (MQ=255) cacGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTATCTACTCATGGAGAACACGAGATCATGACTATTTGTTCAACACACAACCATCCTGCCGATCTGGCCATCGACCCt > 2:485870/1‑150 (MQ=255) tt‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCATGACTATTGGTTCAACACACAACCATCCTGCCGATCTGGCCATCGACCCTTCGc < 2:335770/149‑1 (MQ=255) ccTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCATGACTATTGGTTCAACACACAACCATCCTGCCGATCTGGCCATCGACCCTTCGCTg < 1:72591/150‑1 (MQ=255) | CCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGAT‑CCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCATGACTATTGGTTCAACACACAACCATCCTGCCGATCTGGCCATCGACCCTTCGCTG > NC_002947/1332332‑1332625 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |