New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2162588 = | 49 (1.130) | 5 (0.120) | 5/242 | NT | 11.0% | intergenic (+227/‑595) | yceG/PP_5482 | septation protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2162638 = | 34 (0.820) | intergenic (+277/‑545) | yceG/PP_5482 | septation protein/hypothetical protein |
AGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGTCGCCTAAGCCAGTAAAATCAGGCGATTCAGCGTAGATCATGGCAGCGTAGCATT > NC_002947/2162490‑2162786 | aGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGc > 2:225954/1‑150 (MQ=255) gCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCtg > 1:158643/1‑150 (MQ=255) gCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCtg > 1:713782/1‑150 (MQ=255) cGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCtgt < 2:158643/150‑1 (MQ=255) cGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCtgt < 2:713782/150‑1 (MQ=255) ggTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCtgtg > 1:45339/1‑150 (MQ=255) cgcTGGCGGAAGAGGTGCGTGAACTCTTGCTGACTCCCAGCGACGAACGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCCGGTGTTCGCCTCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCTTCGCTTGCCCGCGGGGCTGTCGTGCttt < 2:410481/150‑3 (MQ=255) cgcTGGCGGAAAAGGTGCGAGACATGGTGCTGACGCCTAGTGACGAAGGCATGGCGGCCGACACACTATATGC‑GCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCtgt < 1:20447/150‑1 (MQ=255) gTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAgg > 1:1019639/1‑150 (MQ=255) tGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCtat < 2:221348/150‑1 (MQ=255) cTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGttt < 2:924859/131‑1 (MQ=255) cTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGttt > 1:924859/1‑131 (MQ=255) cTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCt < 1:139304/150‑1 (MQ=255) tGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCtt > 2:837218/1‑150 (MQ=255) tGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCtt > 1:974772/1‑150 (MQ=255) cccAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAAt < 2:504013/150‑1 (MQ=255) ccAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGGTAGCCCGTGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATg < 1:412283/150‑1 (MQ=255) cAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGCCTACATTCTCTTAATGc > 2:904890/1‑150 (MQ=255) gacgaAGGCAGGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCaa < 2:866405/150‑1 (MQ=255) acgaAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAg < 2:396053/150‑1 (MQ=255) cgaAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAgg < 2:471842/150‑1 (MQ=255) cgtGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACa < 1:904890/148‑1 (MQ=255) aTGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACAt > 1:1127293/1‑150 (MQ=255) aTGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACAt > 1:1025778/1‑150 (MQ=255) gcggcCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCAAGCCGATGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGaa < 1:88987/150‑1 (MQ=255) cGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGaa > 1:404145/1‑150 (MQ=255) acac‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAAt < 2:1127293/150‑1 (MQ=255) cGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGa < 2:379226/150‑1 (MQ=255) cGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGa < 2:881533/150‑1 (MQ=255) cGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGa < 2:847470/150‑1 (MQ=255) aGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATg > 1:704412/1‑150 (MQ=255) ctgctgGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAg < 1:225954/150‑1 (MQ=255) tgGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAg > 1:387224/1‑150 (MQ=255) cccgcgggccagcgccgggcggatgacctgcgccaggtgctgggcgcgggGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGTCGc < 2:323613‑M2/98‑1 (MQ=255) cccgcgggccagcgccgggcggatgacctgcgccaggtgctgggcgcgggGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGTCGc > 1:323613‑M2/51‑148 (MQ=255) CGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGTCGCCTAAGc > 1:612772‑M1/1‑150 (MQ=255) cccAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGTCGCCTAAGCCa < 2:1025778/150‑1 (MQ=255) gccagagccgggcggatgacctgcgccaggtgctgggcgcgggGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGTCGCCTAAGCCAg > 2:347275‑M2/44‑150 (MQ=255) ccTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGTCGCCTAAGCCAGTAAAAt < 2:974772/150‑1 (MQ=255) ccgggcggatgacctgcgccaggtgctgggcgcgggGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCtt < 1:642286‑M2/43‑1 (MQ=255) ccgggcggatgacctgcgccaggtgctgggcgcgggGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCtt > 2:642286‑M2/37‑79 (MQ=255) tGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGTCGCCTAAGCCAGTAAANTCa < 2:704412/150‑1 (MQ=255) gcAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGTCGCCTAAGCCAGTAAAATCAGGCg > 2:465651/1‑150 (MQ=255) tCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCtt > 2:77657/1‑69 (MQ=255) tCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCtt < 1:77657/69‑1 (MQ=255) gggGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGTCGCCTAAGCCAGTAAAATCAGGCGATTCAGCGTAGATCATGGCAGCGTAGCa > 2:747734‑M2/4‑150 (MQ=255) ggGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGTCGCCTAAGCCAGTAAAATCAGGCGATTCAGCGTAGATCATGGCAGCGTAGCAt < 1:837218‑M2/148‑1 (MQ=255) gGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGTCGCCTAAGCCAGTAAAATCAGGCGATTCAGCGTAGATCATGGCAGCGTAGCAtt < 1:747734‑M2/149‑1 (MQ=255) gGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGTCGCCTAAGCCAGTAAAATCAGGCGATTCAGCGTAGATCATGGCAGCGTAGCAtt < 2:404145‑M2/149‑1 (MQ=255) | AGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACAC‑CGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGTCGCCTAAGCCAGTAAAATCAGGCGATTCAGCGTAGATCATGGCAGCGTAGCATT > NC_002947/2162490‑2162786 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |