New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2310823 = | 34 (0.780) | 4 (0.100) | 4/230 | NT | 10.8% | coding (531/1311 nt) | PP_2033 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2310888 = | 35 (0.890) | coding (596/1311 nt) | PP_2033 | hypothetical protein |
CAACCTGCTGCACGATGGCGCGGGCGGGCTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGTGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTGGGGGTGGTTACCCGG > NC_002947/2310745‑2311037 | cAACCTGCTGCACGATGGCGCGGGCGGGCTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTgcg > 2:992202/1‑150 (MQ=255) ctgctgCACGATGGCGCGGGCGGGCTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCgcctg > 2:769789/1‑150 (MQ=255) gctgcACGATGGCGCGGGCGGGCTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGAGCGTTTGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCgcctggg > 1:912006/1‑150 (MQ=255) gggcACGAGGGCGCGGGCGGGCTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCgcctgggc < 2:114327/148‑1 (MQ=255) ggCGCGGGCGGGCTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCg < 2:1060870/150‑1 (MQ=255) gggcgggcTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGatat > 1:968142/1‑150 (MQ=255) cgggcTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGc < 1:8467/150‑1 (MQ=255) cTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGccc < 2:788875/148‑1 (MQ=255) cTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGccc > 1:788875/1‑148 (MQ=255) tgttgtCGGTGGCGTGCGAACCATCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACTGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATCTTGCGCGGc > 2:494727/1‑150 (MQ=255) tgttgtCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGc > 2:855272/1‑150 (MQ=255) tgttgtCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGc > 2:855258/1‑150 (MQ=255) tCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACgtg > 1:447560/1‑150 (MQ=255) tCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACgtg > 2:719247/1‑150 (MQ=255) tCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACgtg > 2:650858/1‑150 (MQ=255) cTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGa > 2:947942/1‑150 (MQ=255) tcaatcaaCTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAg > 1:621338/1‑150 (MQ=255) aatcaaCTTTATCGGCCTGGTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACGTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGa < 2:250015/150‑1 (MQ=255) tcaaCTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACg > 1:263178/1‑150 (MQ=255) ttATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAgcggc < 2:968142/150‑1 (MQ=255) gTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACtt > 2:465224/1‑150 (MQ=255) gACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCACCCGCTGGGAATGGTGGTGGGTTAGGGGCTGCACGGGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCGTAACTTCCCg > 1:78662/1‑150 (MQ=255) caccgtggcggccgtctgcagggtcgaagtcaccctgtaagggcgcaatgatcgccgccacggtgGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATaa < 1:1109912‑M2/76‑1 (MQ=255) caccgtggcggccgtctgcagggtcgaagtcaccctgtaagggcgcaatgatcgccgccacggtgGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATaa > 2:1109912‑M2/66‑141 (MQ=255) CACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCt > 1:738063‑M1/1‑150 (MQ=255) ACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTg > 1:769789‑M1/1‑150 (MQ=255) TGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTgc > 1:650858‑M1/1‑150 (MQ=255) GCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGNAGt > 2:703306‑M1/1‑150 (MQ=255) cgtctgcagggtcgaagtcaccctgtaagggcgcaatgatcgccgccacggtgGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGa < 2:351713‑M2/64‑1 (MQ=255) cgtctgcagggtcgaagtcaccctgtaagggcgcaatgatcgccgccacggtgGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGAGATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGa > 1:351713‑M2/54‑117 (MQ=255) ttGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACg < 2:263178/150‑1 (MQ=255) aGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGtgctgc > 2:1084853/1‑150 (MQ=255) ggTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGTGCTGCCg > 2:436132/1‑150 (MQ=255) gTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGTGCTGCCga < 1:436132/150‑2 (MQ=255) cTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGTGCTGCCGGGCGt < 1:855258/150‑1 (MQ=255) cTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGTGCTGCCGGGCGt < 1:855272/150‑1 (MQ=255) ttCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGTGCTGCCGGGCGTg > 1:447827/1‑150 (MQ=255) ttCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGTGCTGCCGGGCGTg > 2:84286/1‑150 (MQ=255) ttCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGTGCTGCCGGGCGTg > 2:895312/1‑150 (MQ=255) gACCCTGCAGACGGTCGCGACGGTGGCCTGCGCCTGGGCATGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGTTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGTGCTGCCGGGCGTGCAc > 2:496792/1‑150 (MQ=255) cccTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGTGCTGCCGGGCGTGCACTc > 1:452858/1‑150 (MQ=255) ccTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTg > 1:762395/1‑52 (MQ=255) ccTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTg < 2:762395/52‑1 (MQ=255) aGACGGCCGCCACGGTGGCCTACGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGTGCTGCCGGGCGt < 2:1115944/138‑1 (MQ=255) aGACGGCCGCCACGGTGGCCTACGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGTGCTGCCGGGCGt > 1:1115944/1‑138 (MQ=255) cGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGTGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTgg < 1:465224/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGTGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTggg < 1:1084853/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGTGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTggg < 1:878041/150‑1 (MQ=255) cacggtgGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGTGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTGGGggtggt > 1:1116936‑M2/8‑150 (MQ=255) gCCTACGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGGCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGAGCGCAGTGGTCACGACATCGTGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTGGGGTTGGTTACCCgg > 1:359393/1‑150 (MQ=255) | CAACCTGCTGCACGATGGCGCGGGCGGGCTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGGCACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGTGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTGGGGGTGGTTACCCGG > NC_002947/2310745‑2311037 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |