New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2337360 = | 46 (1.060) | 5 (0.120) | 5/236 | NT | 10.6% | coding (745/894 nt) | ybhD | DNA‑binding transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 2337417 = | 42 (1.040) | coding (688/894 nt) | ybhD | DNA‑binding transcriptional regulator |
GATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCACTCAGGCGGCCGACGCCGATCAGGCGGTAATCAGCCAGCTCTGTCCAGGTAACGGAGG > NC_002947/2337272‑2337563 | gATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGAc > 2:749982/1‑150 (MQ=255) aTGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACg < 2:258316/150‑1 (MQ=255) ggTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGtt < 1:598003/150‑1 (MQ=255) gTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCGCGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTg > 1:847899/1‑150 (MQ=255) tcacCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGTTGTGGCa < 2:496183/149‑1 (MQ=255) acCAGCCCTAGCGGGCGGGTAACTTGCTGGTCGATCACCGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCAca > 1:496183/1‑149 (MQ=255) cAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTc > 2:931118/1‑150 (MQ=255) cccTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTa < 2:558665/150‑1 (MQ=255) cccTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTa < 1:931118/150‑1 (MQ=255) tAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGaa > 1:483063/1‑150 (MQ=255) gCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACtt < 2:329177/150‑1 (MQ=255) ttGNGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAg > 2:701754/1‑150 (MQ=255) ttGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTa > 1:331689/1‑132 (MQ=255) ttGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTa < 2:331689/132‑1 (MQ=255) ttGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAg < 1:71148/150‑1 (MQ=255) gCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAg > 2:549167/1‑112 (MQ=255) gCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAg < 1:549167/112‑1 (MQ=255) gCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGa > 1:698287/1‑150 (MQ=255) aagtggttctacgaagtgcaacacctgtccacgtcgcTGGGCATGGTCGAGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAg < 2:877664‑M1/64‑1 (MQ=255) aagtggttctacgaagtgcaacacctgtccacgtcgcTGGGCATGGTCGAGGCCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAg > 1:877664‑M1/38‑101 (MQ=255) gCANGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACg > 2:702689/1‑150 (MQ=255) aCGCTCACCAGCGCGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGACCCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCa < 1:331012/150‑1 (MQ=255) gCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATg > 1:731866/1‑150 (MQ=255) gCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATg > 2:1076030/1‑150 (MQ=255) cACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAAc < 1:1065241/112‑1 (MQ=255) cACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAAc > 2:1065241/1‑112 (MQ=255) cACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTc < 1:822861/150‑1 (MQ=255) aCCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTcc > 1:156303/1‑150 (MQ=255) cAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCcag < 1:701754/150‑1 (MQ=255) aGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCCGGTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCcagc > 1:456675/1‑150 (MQ=255) gtCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGt > 1:505119/1‑113 (MQ=255) gtCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGt < 2:505119/113‑1 (MQ=255) gtCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCACAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCGGTGGTGCGCATGGTCCAGCAGCATGCGGtt < 1:29565/150‑1 (MQ=255) gCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCa < 1:702689/150‑1 (MQ=255) gCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCa < 2:847899/150‑1 (MQ=255) ctgggcatggtcgaggccgggctgggcgtgtcggccatgcccagcctggcctcgaccatgcccaGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACtt > 1:877664‑M2/65‑101 (MQ=255) ctgggcatggtcgaggccgggctgggcgtgtcggccatgcccagcctggcctcgaccatgcccaGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACtt < 2:877664‑M2/37‑1 (MQ=255) GCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCACTCNggc > 2:698287‑M1/1‑150 (MQ=255) GCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCACTCAggc < 1:1005363‑M1/150‑1 (MQ=255) G‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTgg < 2:314654‑M1/88‑1 (MQ=255) G‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTgg > 1:314654‑M1/1‑88 (MQ=255) gtcgaggccgggctgggcgtgtcggccatgcccagcctggccatgcccaGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCACTCAGGCGGCCg > 1:969728‑M2/50‑150 (MQ=255) tcgaggccgggctgggcgtgtcggccatgcccagcctggccatgcccaGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTgg > 1:448242‑M2/49‑87 (MQ=255) tcgaggccgggctgggcgtgtcggccatgcccagcctggccatgcccaGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTgg < 2:448242‑M2/39‑1 (MQ=255) ccAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCACTCAGGCGGCCGa > 1:344777/1‑150 (MQ=255) cAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTgg > 2:40203/1‑86 (MQ=255) cAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTgg < 1:40203/86‑1 (MQ=255) ggCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCACTCAGGCGGCCGACGCCGATCAGGCg < 1:620553/150‑1 (MQ=255) acGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCACTCAGGCGGCCGACGCCGATCAGGCGGTAATca < 2:344777/150‑1 (MQ=255) acGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCACTCAGGCCTCCGACGCCGATCAGGCGGTAATca < 1:996875/150‑1 (MQ=255) cccAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCACTCAGGCGGCCGACGCCGATCAGGCGGTAATcagcc > 1:1084894/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCagcagc < 2:1073154/101‑1 (MQ=255) ccAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCagcagc > 1:1073154/1‑101 (MQ=255) cGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCACTCAGGCGGCCGACGCCGATCAGGCGGTAATCAGCCAGCTCTg > 1:1076245/1‑150 (MQ=255) tCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCACTCAGGCGGCCGACGCCGATCAGGCGGTAATCAGCCAGCTCTGTCCAg > 2:671544/1‑150 (MQ=255) cccaGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCACTCAGGCGGCCGACGCCGATCAGGCGGTAATCAGCCAGCTCTGTCCAGGTAACGGAg < 2:1084894‑M2/146‑1 (MQ=255) ccaGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCACTCAGGCGGCCGACGCCGATGAGGCGGTAATCAGCCAGCTCTGTCCAGGTAACGGAgg < 1:640737‑M2/147‑1 (MQ=255) ccaGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCACTCAGGCGGCCGACGCCGATCAGGCGGTAATCAGCCAGCTCTGTCCAGGTAACGGAgg > 2:1110254‑M2/4‑150 (MQ=255) | GATGCGCCGCGCCGGTACACCAGCCCTAGCGTGCGGGTGACTTGCGGCTCGATCAACGGCACGCTCACCAGCGTGGGGTGGTCGGCATTGGGCATGG‑‑‑‑‑‑CCAGGCTGGGCATGGCCGACACGCCCAGCCCGGCCTCGACCATGCCCAGCGACGTGGACAGGTGTTGCACTTCGTAGAACCACTTGGGCCGCAGGTTGAGCCCGGACAACGCATGGTCCAGCAGCATGCGGTTGCCACTCAGGCGGCCGACGCCGATCAGGCGGTAATCAGCCAGCTCTGTCCAGGTAACGGAGG > NC_002947/2337272‑2337563 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |