New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2475184 = | 41 (0.950) | 4 (0.100) | 4/246 | NT | 9.1% | coding (61/927 nt) | tal | transaldolase |
? | NC_002947 | 2475204 = | 40 (0.950) | coding (41/927 nt) | tal | transaldolase |
TTACCCTTGGCGTCGGCCTTCACCTGTTTAAGCAGGTCGGCGTAGCCCGGGATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAG > NC_002947/2475060‑2475353 | ttACCCTTGGCGTCGGCCTTCACCTGTTTAAGCAGGTCGGCGTAGCCCGGGATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACggtg < 2:386743/150‑1 (MQ=255) aCCCTTGGCGTCGGCCTTCACCTGTTTAAGCAGGTCGGCGTAGCCCGGGATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACggtggt < 2:443767/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCGTCGGCCTTCACCTGTTTAAGCAGGTCGGCGTAGCCCGGGATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCTGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGCTGa > 1:1006294/1‑150 (MQ=255) ttGGCGTCGGCCTTCACCTGTTTAAGCAGGTCGGCGTAGCCCGGGATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAAc > 2:103880/1‑150 (MQ=255) cGTCGGCCTTCACCTGTTTAAGCAGGTCGGCGTAGCCCGGGATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCt < 1:1070903/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCTTCACCTGTTTAAGCAGGTCGGCGTAGCCCGGGATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCtt < 2:569590/150‑1 (MQ=255) ggCCTTCACCTGTTTAAGCAGGTCGGCGTAGCCCGGGATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAg > 1:605404/1‑150 (MQ=255) cACCTGTTTAAGCAGGTCGGCGTAGCCCGGGATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGCCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTc < 2:72889/150‑1 (MQ=255) ttAAGCAGGTCGGCGTAGCCCGGGATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTg < 1:281063/150‑1 (MQ=255) aaGCAGGTCGGCGTAGCCCGGGATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGa < 2:70348/150‑1 (MQ=255) aaGCAGGTCGGCGTAGCCCGGGATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGa < 1:118652/150‑1 (MQ=255) aGCAGGTCGGCGTAGCCCGGGATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAg < 2:1093953/150‑1 (MQ=255) aGCAGGTCGGCGTAGCCCGGGATGGCAGCAGCCTTGAGAAGCAGCGCCGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAg > 1:767569/1‑150 (MQ=255) ccGGGATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTcc < 2:992807/125‑1 (MQ=255) ccGGGATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTcc > 1:992807/1‑125 (MQ=255) gggATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGt < 2:605404/150‑1 (MQ=255) ggATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGTGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTc < 1:750893/150‑1 (MQ=255) ggATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTc < 2:914919/150‑1 (MQ=255) ccTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGTTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTAc < 2:1006294/150‑1 (MQ=255) acaggacagagcacgcccatgacctccaagctggaacaactcaagcagttcaccaccgtGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACggtg > 2:405276‑M1/60‑85 (MQ=255) acaggacagagcacgcccatgacctccaagctggaacaactcaagcagttcaccaccgtGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACggtg < 1:405276‑M1/26‑1 (MQ=255) gcagcagcGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTGCTGTGCATTGACTCGACa > 1:24678/1‑150 (MQ=255) gcagcagcGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCCGTGCATTTACTCGACa < 1:824898/150‑1 (MQ=255) cagcagcGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACAt > 1:455513/1‑150 (MQ=255) gcGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCTGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTCCTCGACATTAccc < 2:523550/150‑1 (MQ=255) gggTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACAACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACGCGACATCAGCCGAGcc > 2:132208/1‑150 (MQ=255) gTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGcccc > 1:909284/1‑150 (MQ=255) tggCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCg > 2:690488/1‑150 (MQ=255) tggCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCg < 2:767569/150‑1 (MQ=255) tggCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCg > 2:518286/1‑150 (MQ=255) ggCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGc > 1:917529/1‑150 (MQ=255) gctggaacaactcaagcagttcaccaccgtGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACgg < 2:872240‑M1/24‑1 (MQ=255) gctggaacaactcaagcagttcaccaccgtGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACgg > 1:872240‑M1/31‑54 (MQ=255) gACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAgg < 1:103880/150‑1 (MQ=255) ggCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGgccg < 2:455513/150‑1 (MQ=255) gATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTg < 1:623953/147‑1 (MQ=255) gATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTg > 2:623953/1‑147 (MQ=255) aTGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCCACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTAGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGa > 2:283468/1‑150 (MQ=255) gCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCaa > 2:139731/1‑126 (MQ=255) gCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCCTCCTATGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGAccc < 2:770462/150‑1 (MQ=255) gCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGAGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCaa < 1:139731/126‑1 (MQ=255) caccgtggtcgccgacaccggggaccACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCtgt > 2:405276‑M2/27‑85 (MQ=255) caccgtggtcgccgacaccggggaccACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCtgt < 1:405276‑M2/59‑1 (MQ=255) cGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGCCCGCCGACAACCCGCGGACCCg > 2:176938/1‑150 (MQ=255) ccgtggtcgccgacaccggggaccACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGc < 2:872240‑M2/30‑1 (MQ=255) ccgtggtcgccgacaccggggaccACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGc > 1:872240‑M2/25‑54 (MQ=255) GTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGccc < 2:625984‑M1/150‑1 (MQ=255) TCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTg > 1:556617‑M1/1‑134 (MQ=255) TCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTg < 2:556617‑M1/134‑1 (MQ=255) cccGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGca > 1:987486/1‑150 (MQ=255) cccGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCAGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGca > 1:1018490/1‑150 (MQ=255) gCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACACTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTa > 2:580349/1‑150 (MQ=255) cACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGaaa > 1:509966‑M2/2‑150 (MQ=255) aCGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAg < 2:987486/150‑1 (MQ=255) | TTACCCTTGGCGTCGGCCTTCACCTGTTTAAGCAGGTCGGCGTAGCCCGGGATGGCAGCAGCCTTGAGCAGCAGCGACGGGTTGGTGGTGGCATCGACCGGCTTCAGGCGGGTGATGGCGTCCAGGTCCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAG > NC_002947/2475060‑2475353 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |