New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3479798 = | 53 (1.220) | 6 (0.140) | 4/244 | NT | 11.3% | coding (1464/2496 nt) | PP_3090 | OmpA domain‑containing protein |
? | NC_002947 | 3479817 = | 43 (1.030) | coding (1445/2496 nt) | PP_3090 | OmpA domain‑containing protein |
GCCCTGGTACAGGCCCAGGCGCATGCCGAGGGGCACGCCCTTAGCGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGG > NC_002947/3479678‑3479964 | gCCCTGGAACAGGCCCAGGCGCATGCCGAGGGGCACGCCCTTAGCGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGc < 1:657987/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGCATGCCGAGGGGCACGCCCTTAGCGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCaa > 2:919545/1‑150 (MQ=255) cgcATGCCGAGGGGCACGCCCTTAGCGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAATAGACCAGGCGCTCGGTGTGTCGAGGCTTAGACAGGCGGGGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTg < 1:78529/150‑1 (MQ=255) ctGCCGAGGGTCACTCCCTTAGCGTGGTGTTGCTCATTGTAGTGAACAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGcc > 2:883843/2‑150 (MQ=255) tGCCGAGGGGCACGCCCTTAGCGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTg < 2:34253/119‑1 (MQ=255) tGCCGAGGGGCACGCCCTTAGCGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTg > 1:34253/1‑119 (MQ=255) tGCCGAGGGGCACGCCCTTAGCGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCa < 1:382815/150‑1 (MQ=255) cGAGGGGCACGCCCTTAGCGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAggg < 2:132526/150‑1 (MQ=255) cGAGGGGCACGCCCTTAGCGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAAAGCTGGCCAggg > 2:395641/1‑150 (MQ=255) aGGGGCACGCCCTTAGCGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGAGGGGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTg < 1:248985/150‑1 (MQ=255) cACGCCCTTAGCGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGcgcg > 2:616774/1‑150 (MQ=255) aCGCCCTTAGCGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCgg < 2:408995/150‑1 (MQ=255) cGCCCTTAGCGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGgt < 1:398730/150‑1 (MQ=255) cTTAGCGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGgttgtt < 1:41144/150‑1 (MQ=255) tAGCGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCa < 1:610563/150‑1 (MQ=255) aGCGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAg < 2:220638/150‑1 (MQ=255) gCGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAgg > 1:739530/1‑150 (MQ=255) cGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGt < 1:96172/150‑1 (MQ=255) tggtgTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTAc > 1:438483/1‑150 (MQ=255) tgtTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGCCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGAc < 2:770759/150‑1 (MQ=255) ttGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCa > 2:972670/1‑150 (MQ=255) tCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGccc < 2:316040/150‑1 (MQ=255) tCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCGGGCCAGGGTGTCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGcgc > 1:232623/1‑148 (MQ=255) tGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTg > 2:1028051/1‑111 (MQ=255) tGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTg < 1:1028051/111‑1 (MQ=255) ggTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCcaca > 1:390850/1‑150 (MQ=255) gTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAg > 2:429949/1‑150 (MQ=255) gTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAg < 2:81291/150‑1 (MQ=255) aGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGc < 2:438483/150‑1 (MQ=255) gAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATCCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCTCAGGCTGc < 2:432616/150‑1 (MQ=255) ctgaacaaccgcgccaccctggccagcattgccgacgaactggcccaggccaaGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTgg > 2:512951‑M1/54‑76 (MQ=255) ctgaacaaccgcgccaccctggccagcattgccgacgaactggcccaggccaaGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTgg < 1:1093202‑M1/23‑1 (MQ=255) ctgaacaaccgcgccaccctggccagcattgccgacgaactggcccaggccaaGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTgg > 2:1093202‑M1/54‑76 (MQ=255) ctgaacaaccgcgccaccctggccagcattgccgacgaactggcccaggccaaGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTgg < 1:512951‑M1/23‑1 (MQ=255) gcCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGc < 2:272851/150‑1 (MQ=255) cgccaccctggccagcattgccgacgaactggcccaggccaaGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGc < 2:486371‑M1/24‑1 (MQ=255) cgccaccctggccagcattgccgacgaactggcccaggccaaGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGc > 1:486371‑M1/43‑66 (MQ=255) tCGAGGCTCCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCc‑g > 2:511393/1‑150 (MQ=255) ggCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCc‑ggcgg > 2:802321/1‑150 (MQ=255) ttCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCC‑GGCCTggcggcac < 1:429949/150‑3 (MQ=255) ttCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTAGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGgcgc > 1:332768/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGcc < 1:533857/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGccca > 2:403580/1‑150 (MQ=255) ggTGTACTGGACGCTCGACCCCTGCTCGACGCCCTTCGCATCGGACCGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGAGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGCCCacccaccc < 2:232623/150‑1 (MQ=255) gtgtACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGCCCACCCACCCg > 2:137400/1‑150 (MQ=255) gtACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGCCCACCCACCCGGc < 1:919545/150‑1 (MQ=255) tACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGCCCACCCACCCGGcc < 1:403580/150‑1 (MQ=255) ctggccgctggccgCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGTGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGCCCACCCACCCGGCCtt > 2:616096/1‑150 (MQ=255) tggccgctggccgcCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTAAAACAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTg > 1:73625/1‑150 (MQ=255) gggccgctggccgcCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTg < 2:449944/149‑1 (MQ=255) gccaaggccgacgaccaggcggccTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGgcg > 1:486371‑M2/25‑66 (MQ=255) gccaaggccgacgaccaggcggccTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGgcg < 2:486371‑M2/42‑1 (MQ=255) ccaaggccgacgaccaggcggccTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAg < 1:1093202‑M2/53‑1 (MQ=255) ccaaggccgacgaccaggcggccTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAg > 2:512951‑M2/24‑76 (MQ=255) ccaaggccgacgaccaggcggccTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAg > 2:1093202‑M2/24‑76 (MQ=255) ccaaggccgacgaccaggcggccTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAg < 1:512951‑M2/53‑1 (MQ=255) CCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGtt < 1:98940‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGtt < 1:427761‑M1/150‑1 (MQ=255) gctgggTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCa < 1:1131645/146‑1 (MQ=255) gtcgtcGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACggtg > 2:471237/1‑150 (MQ=255) tcgGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGAACCAGTGCCCCCAGGCC‑GGCGGCGCCCACCCACCCGGCATTGCGCCGGCGTTCACGGTGCTTg > 1:766196/1‑150 (MQ=255) ggccTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCt < 1:972670‑M2/146‑1 (MQ=255) gccTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTg > 1:1076573‑M2/4‑150 (MQ=255) gccGTGGCCTGGGTCTGTTCGTCGGCAATGTGGGGCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGAGCAGCGCCGCAGGCTGCACTGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTg < 2:405261‑M2/147‑1 (MQ=255) ccTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTgg > 1:479467‑M2/3‑150 (MQ=255) ccTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCACACAGGCt < 1:911192‑M2/74‑1 (MQ=255) ccTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCACACAGGCt > 2:911192‑M2/3‑76 (MQ=255) | GCCCTGGTACAGGCCCAGGCGCATGCCGAGGGGCACGCCCTTAGCGTGGTGTTGCTCATGGTAGTGAGCAGCCCAGAAGCGCAAGCGGTCGAGGCTTCGCCAGGCGGTGTACTGGCCGCTGGCCGCCTGGTCGTCGGCCTTGGCCTGGGCCAGTTCGTCGGCAATGCTGGCCAGGGTGGCGCGGTTGTTCAGGTACGACCAGCCCCACAGGCTGCACAGCACCAGTGCCGCCAGGCC‑GGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGG > NC_002947/3479678‑3479964 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |