Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC | NC_002947 | 5,610,732 | +CTGCTG | 93.7% | coding (96/333 nt) | emrE → | small multidrug resistance protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5610732 | 3 (0.070) | 51 (1.240) +CTGCTG |
46/224 | NT | 93.7% | coding (96/333 nt) | emrE | small multidrug resistance protein |
? | NC_002947 | 5610733 = | 4 (0.090) | coding (97/333 nt) | emrE | small multidrug resistance protein |
TACCCCATCCAGGCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGCCATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTATGGGCAGAA > NC_002947/5610584‑5610881 | atccaggcaacgtctagaatgcccgctcagtaacggaggatcctgccatgaatgcctatacctacctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgc > 2:464393‑M2/150‑150 (MQ=255) tctagaatgcccgctcagtaacggaggatcctgccatgaatgcctatacctacctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGAtgg < 2:424736‑M2/13‑1 (MQ=255) tagaatgcccgctcagtaacggaggatcctgccatgaatgcctatacctacctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGTTGAtggtg > 1:187311‑M2/136‑150 (MQ=255) tagaatgcccgctcagtaacggaggatcctgccatgaatgcctatacctacctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGAtggtg > 1:77006‑M2/136‑150 (MQ=255) atgcccgctcagtaacggaggatcctgccatgaatgcctatacctacctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTg < 2:337786‑M2/19‑1 (MQ=255) agtaacggaggatcctgccatgaatgcctatacctacctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCAt > 2:7249‑M2/122‑150 (MQ=255) gtaacggaggatcctgccatgaatgcctatacctacctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCAtt < 2:77006‑M2/30‑1 (MQ=255) ggaggatcctgccatgaatgcctatacctacctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGtt < 1:269976‑M2/35‑1 (MQ=255) aggatcctgccatgaatgcctatacctacctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgatgCCGTTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCt < 1:88782‑M2/37‑1 (MQ=255) tcctgccatgaatgcctatacctacctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCt > 2:282749‑M2/107‑150 (MQ=255) atgaatgcctatacctacctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGa > 1:162944‑M2/103‑112 (MQ=255) atgaatgcctatacctacctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGa < 2:162944‑M2/10‑1 (MQ=255) atcaatgcctatacctacctcgccattgccatcggcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACg > 1:651396‑M2/103‑150 (MQ=255) tgaatgcctatacctacctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGc > 1:359767‑M2/102‑150 (MQ=255) tGCCATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCt > 2:648390/1‑150 (MQ=255) cctatacctacctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCtggtgg > 2:18917‑M2/96‑150 (MQ=255) ctatacctacctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTggtggt > 2:1028466‑M2/95‑150 (MQ=255) ctatacctacctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGCTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGctggtggg > 2:689539‑M2/95‑149 (MQ=255) gcctatacctacctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTc > 2:134974‑M2/94‑150 (MQ=255) cctacctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCgca < 2:654283‑M2/61‑1 (MQ=255) acctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCgcagca > 2:892019‑M2/87‑150 (MQ=255) ctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCtggtg > 2:455446‑M2/85‑138 (MQ=255) ctcgccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCtggtg < 1:455446‑M2/54‑1 (MQ=255) gccattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCg > 1:320647‑M2/82‑150 (MQ=255) cattgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGCTGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCAGTCcggg > 2:64267‑M2/80‑149 (MQ=255) ttgccatctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTgg > 1:864299‑M2/78‑150 (MQ=255) catctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGAt > 2:364478‑M2/74‑150 (MQ=255) atctgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGAtt > 2:499867‑M2/73‑150 (MQ=255) ctgcgccgaagtcatcgcccccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgggcacgtcgggaccactccttCTTCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGc < 1:131012‑M2/80‑1 (MQ=255) tgcgccgaagtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtggaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGcc > 1:677252‑M2/70‑150 (MQ=255) gtcatcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATc < 1:1028466‑M2/90‑1 (MQ=255) atcgccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTgg > 1:628458‑M2/58‑150 (MQ=255) ccaccgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCgg > 2:975111‑M2/54‑150 (MQ=255) tCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGc > 1:602446/1‑150 (MQ=255) cgcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTCC‑‑‑TGGTGGATGGCTATGGCATTGCGGTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTggg > 1:412136‑M2/50‑150 (MQ=255) gcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTg > 1:76675‑M2/49‑150 (MQ=255) gcctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTg < 1:132265‑M2/102‑1 (MQ=255) cctcgatgaaggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTgg < 1:592279‑M2/103‑1 (MQ=255) ctcgatgaaggcggtgaaaggccggagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTggg > 2:15801‑M2/47‑150 (MQ=255) aggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTNTGc < 2:698752‑M2/112‑1 (MQ=255) aggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGc > 1:656610‑M2/39‑150 (MQ=255) aggcggtgaaaggcctgagcacgccgaagccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGc < 1:1081137‑M2/112‑1 (MQ=255) ggcggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCt < 1:464393‑M2/113‑1 (MQ=255) cggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGa < 1:334943‑M2/115‑1 (MQ=255) cggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGa < 1:64267‑M2/115‑1 (MQ=255) ggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGtt > 2:955372‑M2/35‑52 (MQ=255) ggtgaaaggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGtt < 1:955372‑M2/18‑1 (MQ=255) cGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGACGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAgtg < 1:336300/150‑1 (MQ=255) gaaaggcctgagcacgccgttgccactgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAgtgt < 2:412136‑M2/122‑1 (MQ=255) aggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGTTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAgtgt < 2:187311‑M2/122‑1 (MQ=255) aggcctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAgtgt < 1:499867‑M2/122‑1 (MQ=255) cctgagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTggc > 2:1055‑M2/26‑150 (MQ=255) gagcacgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTggcggc < 2:359767‑M2/128‑1 (MQ=255) acgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGAGCTg > 1:1078800‑M2/19‑150 (MQ=255) cgccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTgg < 1:7249‑M2/133‑1 (MQ=255) gccgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGGGTTCTGGATGCTGACGCTGGTAGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGt > 2:571445‑M2/17‑150 (MQ=255) cgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGa < 1:15801‑M2/136‑1 (MQ=255) cgttgccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGa < 2:882617‑M2/136‑1 (MQ=255) gCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTa < 1:648390/150‑1 (MQ=255) ccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTAt < 2:628458‑M2/141‑1 (MQ=255) ccactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTAt < 1:571445‑M2/141‑1 (MQ=255) cactgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTATg < 1:756426‑M2/142‑1 (MQ=255) actgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTTGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTATgg < 1:277209‑M2/143‑1 (MQ=255) actgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTATgg > 1:144611‑M2/8‑150 (MQ=255) actgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTATgg < 2:780848‑M2/143‑1 (MQ=255) actgctgCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTATgg > 2:1048264‑M2/8‑150 (MQ=255) gCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAACATTCCGGAGGGCTTTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTATGGGCAGaa < 1:134974‑M2/149‑1 (MQ=255) | TACCCCATCCAGGCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGCCATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTATGGGCAGAA > NC_002947/5610584‑5610881 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |