New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5743392 = | 49 (1.130) | 8 (0.210) | 6/228 | NT | 15.4% | intergenic (‑169/+78) | fbp/glgP | class 1 fructose‑1,6‑bisphosphatase/glycogen phosphorylase |
? | NC_002947 | 5743446 = | 44 (1.130) | intergenic (‑223/+24) | fbp/glgP | class 1 fructose‑1,6‑bisphosphatase/glycogen phosphorylase |
ACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGG‑TGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCGGTGTGTGCCACAGATC > NC_002947/5743301‑5743595 | aCTCGCCACGGCTCTCAGCCGGCACAATAGTTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGG‑TGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACCGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGt < 2:194587/150‑1 (MQ=255) ctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccattcgcgggcgcgctCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGcc > 1:341728‑M1/89‑150 (MQ=255) aCGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGG‑TGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcgcg > 1:545840/1‑150 (MQ=255) ggCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGG‑TGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaa < 2:190946/150‑1 (MQ=255) gCTCTCAGCAGGAACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGG‑TGGTCTGGTTGTGTGTCCCGTGGCGGGCGAGCTGTTTCCCACAGGTCCAGCGCAAGCATTGCA‑GCTAGTGTGCCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAc < 1:630233/150‑1 (MQ=255) ctctCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGG‑TGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTCTCGCAAG‑CTTCAAGGCTTGCGCTGTACCTGTGGGAGCGAGCGCGCCCGCGaatg < 1:154250/150‑3 (MQ=2) tctcAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGG‑TGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACgg > 1:172634/1‑150 (MQ=255) tcAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGACGGAGCGTTAGTG‑GTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCGTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGcc > 1:922590/1‑150 (MQ=37) aaTAGGTCGGCAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGG‑TGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATc > 1:778157/1‑150 (MQ=255) aTAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGG‑TGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATcc > 1:539821/1‑150 (MQ=255) gctCGGTAGTGACGTCTTTGCCATCCCGG‑TGTTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATccgtt < 2:614697/148‑4 (MQ=38) ggTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCCG‑TAAGCGCGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCt < 1:840912/150‑1 (MQ=38) gTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGG‑TGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCtt > 2:816146/1‑150 (MQ=255) gaGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGG‑TGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGCA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTc < 2:539821/149‑1 (MQ=255) gCCTTCGCCAGGCCGG‑TGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGACTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGAact > 1:232260/1‑150 (MQ=255) cTTCGCCAGGCCGG‑TGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCg < 1:711549/150‑1 (MQ=255) tCGCCAGGCCGG‑TGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGt < 2:20299/150‑1 (MQ=255) tCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATACTCGCGAAt > 2:718236/1‑150 (MQ=255) ggTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTAGCACCCCCAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGt > 1:780516/1‑150 (MQ=255) gTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGcctcacc < 1:349888/104‑1 (MQ=255) gTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGcctcacc > 2:349888/1‑104 (MQ=255) ttGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGGA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGc > 1:1025201/1‑150 (MQ=255) gtgtgtCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCgg > 1:1047443/1‑150 (MQ=255) tgtCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTcc > 1:442591/1‑150 (MQ=255) gtCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCcg > 2:1048709/1‑150 (MQ=255) ccagttgcgGGCGCGCTCGCTCCGACGGGTACCTGGCAAGGCGTGCA‑GCTGGGGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCTCCTCCCAACATTGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCcgac < 2:432080/144‑1 (MQ=255) ccATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCcgac < 1:55255/150‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCaa > 2:899062/1‑102 (MQ=255) aTTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCaa < 1:899062/102‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGAGCGGtgtgtcga > 2:922897/1‑143 (MQ=255) ttCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACgag > 1:947830/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACgag > 1:188574/1‑150 (MQ=255) gggCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCa < 2:442591/150‑1 (MQ=255) ggcacgcccgctcccacaggtgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgtgggagcgAGCGCGCCCGCGAATGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAg > 1:341728‑M2/63‑150 (MQ=255) gctcgttcgctcCCACTGGTACGGCGCAAGCCTTGTA‑GCTGGCGAGACACCTGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGc < 2:672381/144‑1 (MQ=255) ctcgctcCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATc > 2:1099762/1‑150 (MQ=255) tcgctcCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATcc < 2:780516/150‑1 (MQ=255) GCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGTGGTCGGACGAGGACCAGCCCATccgt < 2:1106434‑M1/150‑1 (MQ=255) cCCCACATGGACAGCGCAAGCCCTCCA‑CCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAAGGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATccgtgc > 2:738453‑M1/2‑150 (MQ=255) TCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATccgtgc < 1:422568‑M1/150‑1 (MQ=255) tcccacaggtgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgtgggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAAt > 2:4153‑M2/52‑85 (MQ=255) tcccacaggtgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgtgggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAAt < 1:4153‑M2/34‑1 (MQ=255) CCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCAtccgtgcca < 1:738453‑M1/150‑2 (MQ=255) acaGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCACTCCAAGGCCTTCCATATCTCGGTTGTGGATTCCCGAACCGGGCGGCCCGACGTGGAGCAGCCCATccgtgccgtg > 2:1081419/1‑150 (MQ=255) acaggtgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgtgggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATccgtgccgtg > 2:351639‑M2/48‑150 (MQ=255) ggtgtctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgtgggagcgAGCGCGCCCGCGAATGGACACACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTc > 2:769676‑M2/45‑150 (MQ=255) gtctcgcaagcttcaaggcttgcgcgacacctgtgggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTAAAt > 1:660964‑M2/42‑150 (MQ=255) cAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATa < 2:172634/150‑1 (MQ=255) tctcgcaagcttcaaggcttgcgagacacctgtgggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATa > 2:862041‑M2/41‑150 (MQ=255) tctcgcaagcttcaaggcttgcgagacacctgtgggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATa > 2:1093911‑M2/41‑150 (MQ=255) ggcgcAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGTTTCGGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATAc < 1:851493/149‑1 (MQ=255) aGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATAc > 2:1125771/1‑150 (MQ=255) aGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATAc > 1:186519/1‑150 (MQ=255) gcAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGc < 2:186519/150‑1 (MQ=255) catgCCTTGAT‑GCTTGCGGGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCGTCGCCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGcc < 2:232260/147‑1 (MQ=255) cAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGATCGAGACCGcc > 1:888759/1‑150 (MQ=255) gttGGGAGACACCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGTCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGcctcgtc < 2:545840/149‑6 (MQ=255) ttGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACt > 2:599969/1‑150 (MQ=255) tgtacctgtgggagcgAGCGCGCCCGCGAATGGACACACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCCCCACTCCTTCg > 1:143249‑M2/17‑150 (MQ=255) cggggggagggGCCGGCCCCCCGACCGGCCTC‑CCTTAATCCCATTCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTAAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCGgtgtgt < 2:778157‑M2/139‑1 (MQ=255) tgggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCGGTGTGTGc < 2:1025201‑M2/142‑1 (MQ=255) ggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTg > 1:838110‑M2/7‑138 (MQ=255) ggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTg < 2:838110‑M2/132‑1 (MQ=255) agcgGGCGTTCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATATCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCCACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATCCCGCTTCTGTTCACCACTCCTGCGGTGTGTGCcaca < 1:309497‑M2/146‑1 (MQ=255) ggCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGCCGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTTTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCGGTGTGTGCCACAGATc < 1:862041/150‑1 (MQ=255) | ACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGG‑TGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAA‑GCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCGGTGTGTGCCACAGATC > NC_002947/5743301‑5743595 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |