Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 991,560 | T→C | 8.6% | I60T (ATC→ACC) | der → | GTPase Der |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 991,560 | 0 | T | C | 8.6% | 123.7 / 3.1 | 47 | I60T (ATC→ACC) | der | GTPase Der |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (21/21); new base C (2/2); total (23/24) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.46e-01 |
CCGAACGTCGGCAAATCCACCATGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAGATGATCGCCGAGCACCTGCGCAAGCGG > NC_002947/991412‑991708 | ccGAACGTCGGCAAATCCACCATGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATc > 1:60996/1‑150 (MQ=255) cGGCAAATCCACCATGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTgt < 1:395483/150‑2 (MQ=255) cAAATCCACCATGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGTCACCGGTGATACCACCGGTGTCGa < 2:296619/150‑1 (MQ=255) aTCCACCATGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCAGCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGt < 2:79629/150‑1 (MQ=255) tCCACCATGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTg > 1:39159/1‑150 (MQ=255) tCCACCATGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTg < 2:610543/150‑1 (MQ=255) ccaccaTGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTgg < 1:203161/150‑1 (MQ=255) aTGGTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATg > 2:836351/1‑150 (MQ=255) tGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTTACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATgg > 1:871065/1‑150 (MQ=255) tGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATgg > 2:145119/1‑150 (MQ=255) ccAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCg < 2:39159/150‑1 (MQ=255) aaGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAg < 1:514079/150‑1 (MQ=255) gACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCa < 1:147668/150‑1 (MQ=255) ccGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGaaaa > 1:424853/1‑135 (MQ=255) ccGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGaaaa < 2:424853/135‑1 (MQ=255) gcgATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGc > 1:799166/1‑150 (MQ=255) aTCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAACATGGTGATGCCAGCAGGCAGCGACGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTCGGCATGGACGAAAAAATGGACGAGCAGTCGCTCATGGcc > 2:240117/1‑150 (MQ=255) tcgtcgGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGGAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCa > 1:509498/1‑150 (MQ=255) gCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTc < 2:49324/121‑1 (MQ=255) gCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTc > 1:49324/1‑121 (MQ=255) gCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAt‑g > 1:199234/1‑150 (MQ=255) gACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCt < 2:721645/150‑1 (MQ=255) ccGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCTGtt > 1:681409/1‑150 (MQ=255) ccGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCTGtt > 1:572474/1‑150 (MQ=255) cGCAAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGAGTTGTTCCTTCACCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGNGCAGNCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCTGTTCCTGGtt < 1:1302/150‑1 (MQ=255) gCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGt < 1:162257/150‑1 (MQ=255) ccAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTa < 1:459886/150‑1 (MQ=255) cAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTgg > 2:468711/1‑62 (MQ=255) cAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTgg < 1:468711/62‑1 (MQ=255) gCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGc < 2:871065/150‑1 (MQ=255) gTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCAt < 1:309978/55‑1 (MQ=255) gTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCAt > 2:309978/1‑55 (MQ=255) tCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGa > 1:197798/1‑150 (MQ=255) cGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGAc < 2:681409/150‑1 (MQ=255) ttCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCCTGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAC‑GTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCa < 2:572474/150‑1 (MQ=255) cTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAgat > 2:979489/1‑150 (MQ=255) ttCATCCTGATCGAAACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGGAGCCGACTAT‑GTGCTGTTCCTGGTTGATGCAAGTGCGGGTATGACTGCGGCAGAACAgatg > 2:994285/1‑150 (MQ=255) tCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAGATGATCg < 2:197798/150‑1 (MQ=255) tGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGGAGCAGTGAGGCTGGACGAAAAAAGGTCCGAGCCGTCGCTCACTGACATCGAAGAAG‑AGAAAATCGTTCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGAATGCGGCAGCCCGAATGATCGCCg > 1:810352/1‑150 (MQ=255) gtcacCGGTGATACCACCGGTGTCGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAg < 2:447182/52‑1 (MQ=18) gtcacCGGTGATACCACCGGTGTCGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAg > 1:447182/3‑54 (MQ=18) tcacCGGTGATACCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTCTGACTGCGGCAGACCAGATGATCGCCGAGCAcc > 1:555151/2‑150 (MQ=255) acacCGGTGGTAGCACCGGTGACGAAGTGGTCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAGATGATCGCCGAGCAcc < 1:240117/150‑1 (MQ=255) acCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAGATGATCGCCGAGCACCTg < 2:810352/150‑1 (MQ=255) cGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAGATGATCGCCGCGAACCTgcg > 2:139397/1‑150 (MQ=255) tggtATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCCAGCGGGTAGGACTGCGGCATACCAGATGATCGCCGAGCCCCTgaacga > 2:1030367/1‑145 (MQ=255) aTCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAGATGATCGCCGAGCACCTGCGCAAGCgg < 1:1088040/150‑1 (MQ=255) | CCGAACGTCGGCAAATCCACCATGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAT‑GTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAGATGATCGCCGAGCACCTGCGCAAGCGG > NC_002947/991412‑991708 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |