| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,169,312 | G→A | 6.6% | D368D (GAC→GAT) | leuA ← | 2‑isopropylmalate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,169,312 | 0 | G | A | 6.6% | 218.2 / 4.5 | 78 | D368D (GAC→GAT) | leuA | 2‑isopropylmalate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/34); new base A (2/3); total (41/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.71e-01 | |||||||||||
TCAGTCTCACCCTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAGGGGTGACGAGGATGTACCGG > NC_002947/1169166‑1169458 | tCAGTCTCACCCTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCg < 2:1116418/150‑1 (MQ=255)tCAGTCTCACCCTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTCCCAATTCTGTTAGGTGATACAGCAACCGTCC‑ACACGCCCTGAGACGCGTATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCGGATGTCg > 1:1097414/1‑150 (MQ=255) tctcACCCTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCg > 1:60491/1‑150 (MQ=255) tcACCCTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCggg > 1:6299/1‑150 (MQ=255) tcACCCTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCggg > 2:803764/1‑150 (MQ=255) cACCCTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGt < 1:773497/150‑1 (MQ=255) cACCCTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGACATCGGCCgcag < 1:95057/150‑4 (MQ=255) aCCCTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTc < 2:808784/150‑1 (MQ=255) aCCCTGCACCACCTGGCTGAATGCGATCTGCATCCAACGCGGCAGTCTGATGGCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGTTTAAGTTTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTCGCTGCGGCCGAGCTGGGCCGGGTc > 1:922443/1‑150 (MQ=255) tGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATc < 2:153028/150‑1 (MQ=255) ccaccTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCa < 1:803764/150‑1 (MQ=255) caccTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACTCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAg > 1:150471/1‑150 (MQ=255) ccTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTc < 2:947510/139‑1 (MQ=255) ccTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTc > 1:947510/1‑139 (MQ=255) cTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTa > 2:193942/1‑150 (MQ=255) tGGCTGAATTCGATCTGCGTGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTaa < 1:334918/150‑1 (MQ=255) tGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTaa < 2:24449/150‑1 (MQ=255) gCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAgg < 2:359656/150‑1 (MQ=255) gCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAgg > 1:627753/1‑150 (MQ=255) ttCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTc > 1:404793/1‑150 (MQ=255) cTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAg > 2:737363/1‑150 (MQ=255) gCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATc > 2:186203/1‑125 (MQ=255) gCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATc < 1:186203/125‑1 (MQ=255) cGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCa < 2:113314/150‑1 (MQ=255) aCGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATc > 2:1019427/1‑150 (MQ=255) ggCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACCGTTCCCCATCctgc > 2:424031/1‑150 (MQ=255) ggCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCctgc < 2:63827/150‑1 (MQ=255) gCTGATGCCATATTCCTGGTCGTTCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCtt > 2:943314/1‑150 (MQ=255) cTGAGGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGCGACCGCCTTTGCCCGACTGGCTAT‑TATCGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTg < 1:11444/150‑1 (MQ=255) tGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCctgctg > 2:168313/1‑142 (MQ=255) tGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCctgctg < 1:168313/142‑1 (MQ=255) gCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGag > 2:833107/1‑149 (MQ=255) gCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGaa > 1:469557/1‑150 (MQ=255) cATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGTCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGc > 1:785991/1‑150 (MQ=255) cATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGc > 2:1065381/1‑150 (MQ=255) ctaccTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCt > 1:653668/4‑150 (MQ=255) cTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGAt < 2:654702/150‑1 (MQ=255) tCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACATTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATg > 2:488268/1‑150 (MQ=255) tCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATg < 1:193942/150‑1 (MQ=255) tCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATg < 2:653668/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGc < 1:1123261/150‑1 (MQ=255) aggtaggtGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTcc > 2:601222/1‑150 (MQ=255) aggtaggtGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTcc > 1:441420/1‑150 (MQ=255) gtaggtGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGCAGCCCTTCCGGATGGCGTcccg > 2:455280/1‑148 (MQ=255) gtaggtGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGc < 2:999575/131‑1 (MQ=255) gtaggtGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGc > 1:999575/1‑131 (MQ=255) gtaggtGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCt > 1:337729/1‑149 (MQ=255) gtaggtGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCt < 2:337729/149‑1 (MQ=255) gctACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAATCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGa < 1:108492/148‑1 (MQ=255) tACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGt > 2:91956/1‑81 (MQ=255) tACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGt < 1:91956/81‑1 (MQ=255) aCCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGcc > 1:1062155/1‑150 (MQ=255) cGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCgg < 1:943314/150‑1 (MQ=255) cGCCTTTGCCCGACTGGCCGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGACGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCAATTTCTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCTCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCgg > 1:852539/1‑150 (MQ=255) gCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCCCCTGGGCTAAGTCCTTTGTGGTTGCGTCCTGGTGAGCGCCggc > 2:1030365/1‑149 (MQ=255) cccGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGTCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAAcgcg < 2:785991/150‑1 (MQ=255) ccGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCgg > 2:441201/1‑150 (MQ=255) gACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTa < 1:737363/150‑1 (MQ=255) gACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAAGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCTAGCCGGAGAACGCGGTa > 1:372169/1‑150 (MQ=255) aCTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACATTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTAt < 1:488268/150‑1 (MQ=255) gCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGAc < 1:1019427/150‑1 (MQ=255) gCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGAc > 1:946170/1‑150 (MQ=255) gCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGATGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACATCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGaa > 2:194412/1‑149 (MQ=255) cTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTCGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGAcc < 2:443675/150‑1 (MQ=255) aCGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGAt > 1:860462/1‑107 (MQ=255) aCGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGAt < 2:860462/107‑1 (MQ=255) gcgGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATcccc > 1:952720/1‑150 (MQ=255) ggATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCCCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCca < 2:922443/150‑1 (MQ=255) ccGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAgg < 1:441201/150‑1 (MQ=255) cGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAggg > 1:432110/1‑150 (MQ=255) cTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAGGGGt < 2:6299/150‑1 (MQ=255) aGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAGGGGTGACGAg < 2:469557/150‑1 (MQ=255) cccGGCCGACATCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGaa > 1:309491/3‑73 (MQ=255) cccGGCCGACATCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGaa < 2:309491/71‑1 (MQ=255) ccGGCCGACATCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATg < 1:219854/116‑1 (MQ=255) ccGGCCGACATCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATg > 2:219854/2‑117 (MQ=255) gCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAGGGGTGACGAGGATGTAc < 2:952243/150‑1 (MQ=255) gATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAGGGGTGACGAGGATGTACCgg > 2:720244/1‑150 (MQ=255) | TCAGTCTCACCCTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGT‑TGACGCGGATTACCGCTTCGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCTGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAGGGGTGACGAGGATGTACCGG > NC_002947/1169166‑1169458 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |