| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,411,791 | C→A | 6.9% | L50L (CTG→CTT) | PP_1232 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,411,791 | 0 | C | A | 6.9% | 176.9 / 3.2 | 59 | L50L (CTG→CTT) | PP_1232 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/22); new base A (2/2); total (35/24) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.63e-01 | |||||||||||
AAAGGCGTTCAGCTCGCGGCTGTCGATCAGGATGAATTCCAGGCGCCGGTCCTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGGTCGTCAGCATGGCCGGGAAGGGCCATCAGGCAGGCCAGCGTCAGCAGGGTAGGGCGCAGTAGA > NC_002947/1411647‑1411935 | aaaGGCGTTCAGCTCGCGGCTGTCGATCAGGATGAATTCCAGGCGCCGGTCCTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCt > 2:483773/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCTGTCGATCAGGATGAATTCCAGGCGCCGGTCCTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCgcagca < 1:751903/133‑1 (MQ=255) tCGCGGCTGTCGATCAGGATGAATTCCAGGCGCCGGTCCTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCgcagca > 2:751903/1‑133 (MQ=255) gcgGCTGTCGATCAGGATGAATTCCAGGCGCCGGTCCTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGcc > 1:128381/1‑150 (MQ=255) gCTGTCGATCAGGATGAATTCCAGGCGCCGGTCCTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAg > 1:951495/1‑150 (MQ=255) gTCGATCAGGATGAATTCCAGGCGCCGGTCCTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTg > 1:353736/1‑150 (MQ=255) gATGAATTCCAGGCGCCGGGCGTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTg > 1:367339/1‑150 (MQ=255) gATGAATTCCAGGCACCGGGCCTGCAGCTTGCGGGTGGCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGATGTGGGTCCTTCCAGC‑GAGTACCGCGCCCACCCACGAGGCCGAGCCAGGCACTGCCCAGTTGGTGCTCCTg > 2:243103/1‑150 (MQ=255) gAATTCCAGGCGCCGGTCCTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGCTGATGCGGCTGtcg > 2:793646/1‑148 (MQ=255) ttCCAGGCGCCGGTCCTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTgcgg > 2:70365/1‑150 (MQ=255) cAGNCGCCGGTCCTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGCCCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGGTGGTGCTCCTGTTGCGGCga > 2:704430/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCCGGTCCTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGa < 1:297516/113‑1 (MQ=255) cAGGCGCCGGTCCTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGa > 2:297516/1‑113 (MQ=255) cAGGCGCCGGTCCTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCga > 2:739664/1‑150 (MQ=255) gcgcCGGTCCTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTGATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCATCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGAc > 1:249441/1‑150 (MQ=255) gcCGGTCCTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGa > 2:707439/1‑150 (MQ=255) gcCGGTCCTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGa > 2:707349/1‑150 (MQ=255) ccGGTCCTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGAt < 2:128381/150‑1 (MQ=255) cTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGa > 2:765654/1‑150 (MQ=255) tGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAg > 2:646819/1‑101 (MQ=255) tGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAg < 1:646819/101‑1 (MQ=255) gctggctgGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCTAGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTgg < 1:704430/150‑1 (MQ=255) gctggctgGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTgg < 1:243103/150‑1 (MQ=255) ctggctggTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGc < 1:707349/150‑1 (MQ=255) ctggctggTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGc < 1:707439/150‑1 (MQ=255) gctggTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCga < 2:908714/129‑1 (MQ=255) gctggTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCga > 1:908714/1‑129 (MQ=255) tttCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCa < 1:765654/150‑1 (MQ=255) tttCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAATCCTTGGGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGAAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCa > 1:366769/1‑150 (MQ=255) tttCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTCCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGGCGATCGCAGAACTGGCATCACCCa > 2:563582/1‑150 (MQ=255) ttCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCgcagca < 1:644503/80‑1 (MQ=255) ttCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCgcagca > 2:644503/1‑80 (MQ=255) cagCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCAccccatg > 2:100012/3‑146 (MQ=255) gTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGgtc < 1:739664/150‑1 (MQ=255) cacGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGgtcgtc > 1:195166/1‑150 (MQ=255) gCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGGTCGTCAGc > 2:553564/1‑150 (MQ=255) tGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGGAGGCCGACAGCag > 2:631159/1‑149 (MQ=255) ggTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGGTCGTCAGCATg < 2:951495/150‑1 (MQ=255) tttCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGt < 1:874669/92‑1 (MQ=255) tttCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGt > 2:874669/1‑92 (MQ=255) aGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTCGCATCACCCAGTGCTGGCAGGTCGTCAGCATGGCCGGGAAgcg > 2:174574/1‑148 (MQ=255) cTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGGTCGTCAGCATGGCCGGGAAGGGCCAt > 1:402150/1‑150 (MQ=255) gAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGGTCGTCAGCATGGCCGGGAAGGGCCATcag < 1:483773/150‑1 (MQ=255) tgtgGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGGTCGTCAGCATGGCCGGGAAGGGCCATcaggcag < 2:195166/150‑1 (MQ=255) ggTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCa < 2:544576/102‑1 (MQ=255) ggTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCa < 2:545530/102‑1 (MQ=255) ggTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCa > 1:544576/1‑102 (MQ=255) ggTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCa > 1:545530/1‑102 (MQ=255) tCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGGTCGTCAGCATGGCCGGGAAGGGCCATCAGGCAGGCCAGc < 1:94923/150‑1 (MQ=255) tCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTACTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGGTCGTCAGCATGGCCGGGAAGGGCCATCAGGCAGGCCAGc > 2:538449/1‑150 (MQ=255) tGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGGTCGTCAGCATGGCCGGGAAGGGCCATCAGGCAGGCCAGCGTCAGCAgg < 1:793646/150‑1 (MQ=255) tGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGGTCGTCAGCATGGCCGGGAAGGGCCATCAGGCAGGCCAGCGTCAGCAgg > 1:338789/1‑150 (MQ=255) aTTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGGTCGTCAGCATGGCCGGGAAGGGCCATca > 1:894256/1‑128 (MQ=255) aTTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGGTCGTCAGCATGGCCGGGAAGGGCCATca < 2:894256/128‑1 (MQ=255) ttGACCTGGCCGGGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGTTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCATTGATGGCAGGTCGTCAGCATGGCCGGGAAGGGCCATCAGGCAGGCCAGCGTCAGCAGGGTa < 2:212960/150‑1 (MQ=255) gACCTGGCAGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCTAGACGATCTCAGAACTGGCATCACCCAGTGATTCCAGGTCGTCATCATGCACGTGATAGGCTATGAGGCAGTCCAGAGACATCAGGTTAgg < 2:474070/150‑1 (MQ=255) cTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGGTCGTCAGCATGGCCGGGAAGGGCCATCAGGCAGGCCAGCGTCAGCAGGGTAGGgcg > 2:792325/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGCGCAGAAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGgtc < 1:368219/96‑1 (MQ=255) cTGGCCGCGCAGAAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGgtc < 1:368231/96‑1 (MQ=255) cTGGCCGCGCAGAAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGgtc > 2:368231/1‑96 (MQ=255) cTGGCCGCGCAGAAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGgtc > 2:368219/1‑96 (MQ=255) gCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGGTCGTCAGCATGGCCGGGAAGGGCCATCAGGCAGGCCAGCGTCAGCAGGGTAGGGCGCAg > 1:1025252/1‑150 (MQ=255) cgcAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCAGCCAGTGATGGCAGGTCGTCAGCATGGCCGGGAAGGGCCATCAGGCAGGCCAGCGTCAGCAGGGTAGGGCGCAGTAGa < 2:367339/150‑1 (MQ=255) | AAAGGCGTTCAGCTCGCGGCTGTCGATCAGGATGAATTCCAGGCGCCGGTCCTGCAGCTGGCTGGTTTCGGCCAGCTTGTACACGCTGGTTTCGACATAGTCCTTGAGCTGTGGGTCATT‑GAGCTGATTGACCTGGCCGCGCAGCAGGCTGAGCCAGGCACGGCCCAGTTGGTGCTCCTGTTGCGGCGAGACGATCGCAGAACTGGCATCACCCAGTGATGGCAGGTCGTCAGCATGGCCGGGAAGGGCCATCAGGCAGGCCAGCGTCAGCAGGGTAGGGCGCAGTAGA > NC_002947/1411647‑1411935 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |