| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,476,852 | G→T | 5.7% | R303L (CGG→CTG) | PP_1290 → | polysaccharide deacetylase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,476,852 | 0 | G | T | 5.7% | 223.5 / 2.0 | 70 | R303L (CGG→CTG) | PP_1290 | polysaccharide deacetylase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/32); new base T (2/2); total (36/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.12e-01 | |||||||||||
GCGCAGTGGACCGACTGGCAGGATTCGCTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAGGGCGTGATCCAGTTTCATGACAGCCTTCCCAAGGCGCAGCCGGCGGTGGAT > NC_002947/1476704‑1477000 | gcgcAGTGGACCGACTGGCAGGATTCGCTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTCCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCgg < 2:585358/150‑1 (MQ=255)gcgcAGTGGACCGACTGGCAGGATGCGCTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTTCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGTCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCgg < 1:238907/150‑1 (MQ=255) ccGACTGGCAGGATTCGCTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCTGGTATCGTtgt > 2:659050/1‑150 (MQ=255) cGACTGGCAGGATTCGCTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTATAGTGCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTtgtg > 2:985645/1‑150 (MQ=255) tGGCAGGATTCGCTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGAc > 1:432086/1‑150 (MQ=255) tGGCAGGATTCGCTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCAAAAAGCTGACGGCGAGGCGTTCATGTCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGAc > 1:562037/1‑150 (MQ=255) gCAGGATTCGCTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACAt < 2:332317/150‑1 (MQ=255) gCAGGATTCGCTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACAt > 1:332317/1‑150 (MQ=255) gCAGGATTCGCTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCACTTGCGGGTATCGTTGTGGGACAt > 2:395067/1‑150 (MQ=255) cAGGATTCGCTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATc > 1:909133/1‑150 (MQ=255) ggATTCGCTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGa < 2:432086/150‑1 (MQ=255) gATTCGCTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTTTCGTTGTGGGACATCGAt > 2:1025159/1‑150 (MQ=255) aTTCGCTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATg < 2:354733/150‑1 (MQ=255) ttCGCTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGAt < 1:595726/148‑1 (MQ=255) ttCGCTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGAt > 2:595726/1‑148 (MQ=255) gCTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCAGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCa < 1:738257/150‑1 (MQ=255) cTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCNCAg < 2:702721/150‑1 (MQ=255) tGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAgg > 1:1072130/1‑150 (MQ=255) gcggcgCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGa < 2:774692/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCTGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGa < 1:659050/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGa > 1:782256/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCAGTTCGCTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGGCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGc > 1:758144/1‑150 (MQ=255) cgGGTGCAGGGTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAgc < 2:986158/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCagag < 2:70065/150‑1 (MQ=255) cTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCTGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCAt < 1:139050/150‑1 (MQ=255) cccGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAg > 1:904962/1‑150 (MQ=255) ccGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAgc > 2:956865/1‑150 (MQ=255) cGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAgcg > 2:632414/1‑150 (MQ=255) gAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAgcgc > 1:884782/1‑150 (MQ=255) gCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGt < 1:77938/150‑1 (MQ=255) gTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTAtt > 1:349541/1‑150 (MQ=255) gtgCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGAcc < 1:772391/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCTGGTATCGTTGTgg < 1:59637/85‑1 (MQ=255) gCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCTGGTATCGTTGTgg > 2:59637/1‑85 (MQ=255) ccGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTg > 1:76666/1‑150 (MQ=255) cGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATc > 1:168107/1‑89 (MQ=255) cGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATc < 2:168107/89‑1 (MQ=255) cGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGa > 2:740779/1‑150 (MQ=255) cGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCACAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGa < 2:1000249/150‑1 (MQ=255) cTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGAtg < 1:310641/150‑1 (MQ=255) ttCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGAtgttg > 2:159460/1‑150 (MQ=255) ccGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGAtgttgtt < 2:76666/150‑1 (MQ=255) tCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACg > 2:1007039/1‑95 (MQ=255) tCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACg < 1:1007039/95‑1 (MQ=255) tCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTtgtg < 1:985645/150‑1 (MQ=255) cccgatctATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCACCTCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTtgtg < 1:674608/143‑1 (MQ=255) ccACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTgg < 1:269174/150‑1 (MQ=255) aCCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGa < 2:319079/137‑1 (MQ=255) aCCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGa > 1:319079/1‑137 (MQ=255) ttATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTtgt > 1:270292/1‑65 (MQ=255) ttATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTtgt < 2:270292/65‑1 (MQ=255) aGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGgc < 1:481472/138‑1 (MQ=255) aGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGgc > 2:481472/1‑138 (MQ=255) ggCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAGGGCGTGATCCAGtt > 2:1110825/1‑150 (MQ=255) cTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAGGGCGTGATCCAGTTTc < 2:297443/150‑1 (MQ=255) tGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAGGGCGTGATCCAGTTTCa < 2:281941/150‑1 (MQ=255) ggCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAGGGCGTGATCCAGTTTCATGAc > 1:294757/1‑150 (MQ=255) cGAGGCGGTCATGGCCCGCCAGAAGGTGCGGGGATCGGTGTGGGAAATCGAGGGCCAGGAGGACGGTAAATAGAGCGCGGAGGCATCAGCACAGCGCGGATTGCCCCTGATGGTGTTGTGGGGCAAGGGCGTGATCCAGTTTCATGACAg > 2:512146/1‑150 (MQ=255) gCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAGGGCGTGATCCAGTCTCATGACCGCCtt < 2:884782/150‑1 (MQ=255) cGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAGGGCGTGATCCAGTTTCATGACAGCCTTc < 1:672335/150‑1 (MQ=255) cttgccagccaGCGGTTTCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAGGGCGTGATCCAGTTTCATGACAGCCTTCCCAAg < 2:904962/147‑1 (MQ=255) aTGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAgg < 2:560497/118‑1 (MQ=255) aTGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAgg > 1:560497/1‑118 (MQ=255) aTGGACCGCCAGCAGTTGCGGCTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGTGCGCAGAGGCATCCGCACAGAGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGGAAGGGCGGGCTGCATTGTCGTGACAGCCTTCCCAAg < 2:562037/150‑1 (MQ=255) ggCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAGGGCGTGATCCAGTTTCATGACAGCCTTCCCAAGgc > 2:32341/1‑150 (MQ=255) ggCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAGGGCGTGATCCAGTTTCATGACAGCCTTCCCAAGgc > 2:32346/1‑150 (MQ=255) gCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAGGGCGTGATCCAGTTTCATGACAGCCTTCCCAAGgcg > 1:281648/1‑150 (MQ=255) ccGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAGGGCGTGa < 2:231398/119‑1 (MQ=255) ccGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAGGGCGTGa > 1:231398/1‑119 (MQ=255) ccGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAGGGCGTGATCCAGTTTCATGACAGCCTTCCCAAGGCGCa > 2:483992/1‑150 (MQ=255) agcagTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAGGGCGTGATCCAGTTTCATGACAGCCTTCCCAAGGCGCAGCcgg > 1:184188/1‑150 (MQ=255) cGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAGGGCGTGATCCAGTTTCATGACAGCCTTCCCAAGGCGCAGCCGGCGGTGGAt < 1:1025159/150‑1 (MQ=255) | GCGCAGTGGACCGACTGGCAGGATTCGCTGCGGCGCAGCCAGGCGCGGGTGCAGGCTGATCTACCCGAGCAGTATGTGCCGCTGTTCCGTCCACCTTATGGCCAGCGCCGGGCTGACGGCGAGGCGTTCATGGCCCGCCAGCAGTTGCGGGTATCGTTGTGGGACATCGATGCCCAGGATGACGGTGCATTGAGCGCAGAGGCATCCGCACAGCGCGTATTGACCCTGATGTTGTTGTGGCGCAAGGGCGTGATCCAGTTTCATGACAGCCTTCCCAAGGCGCAGCCGGCGGTGGAT > NC_002947/1476704‑1477000 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |