| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,992,842 | G→A | 5.6% | A251T (GCC→ACC) | bkdAA → | branched‑chain alpha‑keto acid dehydrogenase complex subunit alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,992,842 | 0 | G | A | 5.6% | 201.5 / 2.4 | 71 | A251T (GCC→ACC) | bkdAA | branched‑chain alpha‑keto acid dehydrogenase complex subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/30); new base A (2/2); total (39/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.50e-01 | |||||||||||
GCGATACCAAGATCGCCTCGGCATGGATCGGTGACGGCGCTACTGCCGAGTCGGACTTCCACACCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGC > NC_002947/4992696‑4992991 | gCGATACCAAGATCGCCTCGGCATGGATCGGTGACGGCGCTACTGCCGAGTCGGACTTCCACACCGCCCTTACCTTTGCCTACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCa > 1:620317/1‑150 (MQ=255) cAAGATCGCCTCGGCATGGATCGGTGACGGCGCTACTGCCGAGTCGGACTTCCACACCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCgg < 1:732775/150‑1 (MQ=255) gCCTCGGCATGGATCGGTGACGGCGCTACTGCCGAGTCGGACTTCCACACCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAg > 1:970814/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCATGGATCGGTGACGGCGCTACTGCCGAGTCGGACTTCCACACCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGt > 1:846291/1‑150 (MQ=255) ggCATGGATCGGTGACGGCGCTACTGCCGAGTCGGACTTCCACACCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGac < 1:1011886/150‑1 (MQ=255) aTGGATCGGTGACGGCGCTACTGCCGAGTCGGACTTCCACACCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGaccac < 1:547118/150‑1 (MQ=255) tGGATCGGTGACGGCGCTACTGCCGAGTCGGACTTCCACACCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGaccacc < 2:337739/150‑1 (MQ=255) gTGACGGCGCTACTGCCGAGTCGGACTTCCACACCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTgccg > 1:95456/1‑150 (MQ=255) tGCCGAGTCGGACTTCCACACCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTggg > 1:797537/1‑150 (MQ=255) gACTTCCACACCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTAtt < 2:1074767/150‑1 (MQ=255) gACTTCCACACCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTAtt > 1:331517/1‑150 (MQ=255) ttCCACACCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCt > 2:433024/1‑150 (MQ=255) ttCCACACCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGGGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGGATTGCt > 2:416973/1‑150 (MQ=255) ccACACCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTc > 1:600406/1‑150 (MQ=255) cacaCCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCcgtggc < 1:87075/129‑1 (MQ=255) cacaCCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCcgtggc > 2:87075/1‑129 (MQ=255) acacCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTgcc > 2:884714/1‑119 (MQ=255) acacCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTgcc < 1:884714/119‑1 (MQ=255) acCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCTAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCcgtggcgtgg > 1:137613/1‑130 (MQ=255) acCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCcgtggcgtgg < 2:137613/130‑1 (MQ=255) acCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTg > 1:4406/1‑150 (MQ=255) ccGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACTGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGc < 2:249188/150‑1 (MQ=255) gCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCCCCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCgg < 2:588568/150‑1 (MQ=255) cccTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCggg > 2:192708/1‑150 (MQ=255) tACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGa < 2:620317/150‑1 (MQ=255) ccTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACg < 2:258325/150‑1 (MQ=255) cTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACgg > 1:1113792/1‑150 (MQ=255) tttGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGc < 2:927325/150‑1 (MQ=255) tttGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTGCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGc > 2:1034851/1‑150 (MQ=255) atcccGCGCCACGGTGCTTCTCAACTTGTGCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCCGCTGGGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTtcgt < 1:801165/147‑1 (MQ=255) tcccGCGCCCCGGTCAGCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTTGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTtcgtc < 1:390689/148‑1 (MQ=255) aCCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTtcgtcg > 1:229316/1‑150 (MQ=255) ccGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTc < 2:485754/113‑1 (MQ=255) ccGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTc > 1:485754/1‑113 (MQ=255) ggTCATCCTCCACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGc < 2:320098/150‑1 (MQ=255) tCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCt < 2:4406/150‑1 (MQ=255) tCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGacca > 2:337868/1‑66 (MQ=255) tCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGacca < 1:337868/66‑1 (MQ=255) tCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTcgc > 1:598459/1‑150 (MQ=255) tCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTcgc > 2:859725/1‑150 (MQ=255) tCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTcgc > 1:694064/1‑150 (MQ=255) aaCGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCgcgc < 2:797537/150‑1 (MQ=255) tGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGTGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTggg > 2:710920/1‑150 (MQ=255) tGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTggg > 1:830604/1‑150 (MQ=255) ggTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGggc < 2:838692/150‑1 (MQ=255) gTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGggcg < 2:1040206/150‑1 (MQ=255) taaacaccCAATGGGCCAGTTCCAGCGTCCAGGGCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTGTTGCTTCACTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCTTGAACGCAGCCTCGCGCTGggcgg > 2:565315/3‑150 (MQ=255) tCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGggcgg > 2:1071362/1‑150 (MQ=255) tCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGggcgg > 2:115572/1‑150 (MQ=255) caacCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGTCCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGa < 1:242838/150‑1 (MQ=255) caacCAATGGGCCATTTCCACCTTACAGGCCATGGCCGGTGGCTAGTCGACCACCTTTGCAGGCTAT‑TAAAGAGTGTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGa < 1:192708/150‑1 (MQ=255) aacCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAg > 2:1077899/1‑150 (MQ=255) aacCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAg > 2:1016196/1‑150 (MQ=255) aacCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAg > 1:936126/1‑150 (MQ=255) aaTGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAgcgcg < 2:1125122/150‑1 (MQ=255) aaTGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCCGCCGAgcgcg > 2:80890/1‑150 (MQ=255) aTGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTCGGCCGCCCAgcgcga < 2:229316/150‑2 (MQ=255) aTGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGGCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAgcgcgc > 2:939848/1‑150 (MQ=255) ggCCATTTCCACCTTCCAGACCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCg < 2:642667/113‑1 (MQ=255) ggCCATTTCCACCTTCCAGACCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCg < 2:642750/113‑1 (MQ=255) ggCCATTTCCACCTTCCAGACCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCg > 1:642750/1‑113 (MQ=255) ggCCATTTCCACCTTCCAGACCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCg > 1:642667/1‑113 (MQ=255) aTTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTTGGCGGCCGAGCGCGCCcgccgc > 2:145410/1‑150 (MQ=255) tttCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGcgcc < 2:1130823/143‑1 (MQ=255) tttCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGcgcc > 1:1130823/1‑143 (MQ=255) tCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGc < 2:95456/150‑1 (MQ=255) cACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGATGCGGGTTGACGGCAACGACTTCTGCGCCGTGTACTCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCt > 2:970403/1‑150 (MQ=255) ccTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACTACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGTCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTgg < 2:205821/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGc > 2:444209/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGNccc < 2:694064/150‑1 (MQ=255) aGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCTGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCaa > 1:183077/1‑150 (MQ=255) gCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGc < 1:859725/150‑1 (MQ=255) | GCGATACCAAGATCGCCTCGGCATGGATCGGTGACGGCGCTACTGCCGAGTCGGACTTCCACACCGCCCTTACCTTTGCCCACGTATACCGCGCCCCGGTCATCCTCAACGTGGTCAACAACCAATGGGCCATTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGT‑TGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGC > NC_002947/4992696‑4992991 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |