Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 483,565 | C→A | 8.7% | G293C (GGC→TGC) | yeaG ← | protein kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 483,565 | 0 | C | A | 8.7% | 136.7 / 2.8 | 46 | G293C (GGC→TGC) | yeaG | protein kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (21/21); new base A (2/2); total (23/23) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.16e-01 |
CAGCAGTTTGTCGTAGATCTTGATTTCATCGCTGACCCGCAGGCAGTACGGCACCTTGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTCCATCAGGCCCTGGTTGGCCCGGCAAAGCGCGCCCGA > NC_002947/483416‑483712 | cagcagTTTGTCGTAGATCTTGATTTCATCGCTGACCCGCAGGCAGTACGGCACCTTGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGcc > 1:937273/1‑150 (MQ=255) cagcagTTTGTCGTAGATCTTGATTTCATCGCTGACCCGCAGGCAGTACGGCACCTTGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGcc > 1:717064/1‑150 (MQ=255) agcagTTTGTCGTAGATCTTGATTTCATCGCTGACCCGCAGGCAGTACGGCACCTTGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCg < 2:503544/150‑1 (MQ=255) ttGTCGTAGATCTTGATTTCATCGCTGACCCGCAGGCAGTACGGCACCTTGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAg < 1:818398/150‑1 (MQ=255) tGTCGTAGATCTTGATTTCATCGCTGACCCGCAGGCAGTACGGCACCTTGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAgg < 2:808857/150‑1 (MQ=255) cGTAGATCTTGATTTCATCGCTGACCCGCAGGCAGTACGGCACCTTGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGa < 2:191749/150‑1 (MQ=255) tttCATCGCTGACCCGCAGGCAGTACGGCACCTTGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGc > 1:776489/1‑150 (MQ=255) tCGCTGACCCGCAGGCAGTACGGCACCTTGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCg > 1:717026/1‑150 (MQ=255) cccGCAGGCAGTACGGCACCTTGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCAACTCCGATTCTTTGGAGTTCTCCTGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACtgt > 2:970134/1‑150 (MQ=255) ccGCAGGCAGTACGGCACCTTGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACtgtt < 2:780946/150‑1 (MQ=255) ggCACCTTGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCAGGTATAgg < 2:1080546/109‑1 (MQ=255) ggCACCTTGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCAGGTATAgg < 2:1080637/109‑1 (MQ=255) ggCACCTTGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCAGGTATAgg > 1:1080637/1‑109 (MQ=255) ggCACCTTGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCAGGTATAgg > 1:1080546/1‑109 (MQ=255) ttGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTc > 2:149592/1‑143 (MQ=255) ttGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTc < 1:149592/143‑1 (MQ=255) ttGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTg > 1:871833/1‑150 (MQ=255) ttGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTg < 2:489280/150‑1 (MQ=255) tGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTgg > 1:4546/1‑150 (MQ=255) cTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAgggg < 2:937273/150‑1 (MQ=255) gATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAg < 2:221035/150‑1 (MQ=255) aTGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCa > 1:1044523/1‑148 (MQ=255) aTGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCa < 2:1044523/148‑1 (MQ=255) tGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGa < 2:4546/150‑1 (MQ=255) tCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATc < 2:871833/150‑1 (MQ=255) gttgttCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCgg > 2:502001/1‑150 (MQ=255) gttgttCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCgg > 1:969981/1‑150 (MQ=255) ttgttCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGgc < 2:969981/150‑1 (MQ=255) gttCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACtgttg > 1:1052906/1‑97 (MQ=255) gttCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACtgttg < 2:1052906/97‑1 (MQ=255) gttgttACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGaa < 1:983314/150‑1 (MQ=255) ttgttACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAgggg > 1:237006/1‑63 (MQ=255) ttgttACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAgggg < 2:237006/63‑1 (MQ=255) ttACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGcc < 2:44939/66‑1 (MQ=255) ttACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGcc > 1:44939/1‑66 (MQ=255) tACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACAttt < 2:1117540/150‑1 (MQ=255) tgtgCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAAtt > 1:663318/1‑150 (MQ=255) tgCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTcc > 2:446608/1‑150 (MQ=255) tgCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTcc > 1:959035/1‑150 (MQ=255) ccACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTCCAt > 2:113468/1‑150 (MQ=255) gTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTCCATCAGGCCCTGGtt > 1:967696/1‑150 (MQ=255) ttGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTCCATCAGGCCCTGGTTg > 2:501372/1‑150 (MQ=255) tGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTCCATCAGGCCCTGGTTgg > 2:586544/1‑150 (MQ=255) gTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCt < 2:873009/110‑1 (MQ=255) gTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCt > 1:873009/1‑110 (MQ=255) agcagAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTCCATCAGGCCCTGGTTGGCCCGGCAAAgc > 2:321243/1‑150 (MQ=255) cagAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTCCATCAGGCCCTGGTTGGCCCGGCAAAgcgc < 2:663318/150‑1 (MQ=255) gCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTCCATCAGGCCCTGGTTGGCCCGGCAAAGCGCGCCCGa < 2:959035/150‑1 (MQ=255) | CAGCAGTTTGTCGTAGATCTTGATTTCATCGCTGACCCGCAGGCAGTACGGCACCTTGACGATATAGATCCTGTCGATGAACGCTTCGTTGTTCTTGTTGTTACGGAAGGTGTGCCACTCCGATTCGTTGGAGTGCGCCAGCAGAATGCCGGTATAGGGGATCGCCCCAAGGCCTTCGGTACTGTTGTAGTTGCCTTCCTGGGTGGCGGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTCCATCAGGCCCTGGTTGGCCCGGCAAAGCGCGCCCGA > NC_002947/483416‑483712 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |