| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 72 | G→T | intergenic (–/+75) | – / ← parB | –/chromosome‑partitioning protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 72 | 0 | G | T | 97.7% | 756.8 / ‑5.2 | 219 | intergenic (–/+75) | –/parB | –/chromosome‑partitioning protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/5); new base T (112/102); total (112/107) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.65e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCAGAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGAATAACCAACTGGCCTTTGCC > NC_002947/1‑218 | aaattgagccagcagtaccggaaaaaccgcccagcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGt < 2:1138094‑M1/75‑1 (MQ=255) attgagccagcagtaccggaaaaaccgcccagcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGtat < 1:3590901‑M1/77‑1 (MQ=255) tgagccagcagtaccggaaaaaccgcccagcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAg > 1:2118385‑M1/72‑150 (MQ=255) tgagccagcagtaccggaaaaaccgcccagcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAg > 1:4674873‑M1/72‑150 (MQ=255) gagccagcagtaccggaaaaaccgcccagcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAgg > 2:4957866‑M1/71‑150 (MQ=255) cagcagtaccggaaaaaccgcccagcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTg < 1:4573719‑M1/84‑1 (MQ=255) gcagtaccggaaaaaccgcccagcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGa > 1:1599164‑M1/65‑150 (MQ=255) gcagtaccggaaaaaccgcccagcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGa > 2:284708‑M1/65‑150 (MQ=255) gtaccggaaaaaccgcccagcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTa < 1:1429165‑M1/89‑1 (MQ=255) gaccggaaaaaccgcccagcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTaa > 1:267942‑M1/61‑150 (MQ=255) accggaaaaaccgcccagcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAAc > 2:1455339‑M1/60‑150 (MQ=255) cggaaaaaccgcccagcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAAccc > 1:3258606‑M1/58‑150 (MQ=255) cggaaaaaccgcccagcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAAccc > 2:4094629‑M1/58‑150 (MQ=255) gaaaaaccgcccagcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATACTTTGTGCCGAC‑AACCTGCGCGCATAGGATAGGGGTGGATTAACCCCt < 2:4954194‑M1/95‑1 (MQ=255) gaaaaaccgcccagcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCt < 2:1659366‑M1/95‑1 (MQ=255) aaaaaccgcccagcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTTAATCCACCCCTa > 2:880589‑M1/55‑150 (MQ=255) aaaaccgcccagcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTAt > 2:3290061‑M1/54‑150 (MQ=255) aaaccgcccagcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTAtt > 1:1438754‑M1/53‑150 (MQ=255) gcgatggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCg < 1:1924342‑M1/108‑1 (MQ=255) atggaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTa > 2:1415846‑M1/40‑150 (MQ=255) gaaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTg > 2:3942213‑M1/37‑150 (MQ=255) aaaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGa < 1:4358419‑M1/115‑1 (MQ=255) aaggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGAt < 2:3022197‑M1/116‑1 (MQ=255) ggcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGAttt < 2:1218799‑M1/118‑1 (MQ=255) gcaggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTc < 1:855908‑M1/119‑1 (MQ=255) caggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTcc < 1:2551752‑M1/120‑1 (MQ=255) caggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTcc > 2:4290388‑M1/31‑150 (MQ=255) aggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCg < 2:1632902‑M1/121‑1 (MQ=255) ggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGa > 1:2127345‑M1/29‑150 (MQ=255) ggcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGa > 1:1629462‑M1/29‑150 (MQ=255) gcggtttggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGAc < 2:1845953‑M1/123‑1 (MQ=255) tggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACg > 2:3587975‑M1/22‑150 (MQ=255) ggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGc > 2:4335388‑M1/21‑150 (MQ=255) ggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGc > 2:2686781‑M1/21‑150 (MQ=255) ggcgtgcgtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGc > 1:4471819‑M1/21‑150 (MQ=255) gtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTacaaca > 2:1452180‑M1/14‑150 (MQ=255) gtatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTacaaca > 2:2166461‑M1/14‑150 (MQ=255) tatttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAg > 2:320492‑M1/13‑150 (MQ=255) ttccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGaa > 1:3342246‑M1/10‑150 (MQ=255) tccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAAt < 2:4835089‑M1/142‑1 (MQ=255) ccatcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCCATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAAtt < 2:3559832‑M1/143‑1 (MQ=255) catcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTg < 2:1997166‑M1/144‑1 (MQ=255) atcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGt < 2:716286‑M1/145‑1 (MQ=255) atcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGt > 1:2906310‑M1/6‑150 (MQ=255) atcacAACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGt < 1:671886‑M1/145‑1 (MQ=255) aCTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGc < 1:149190/150‑1 (MQ=255) aCTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGc < 1:3998389/150‑1 (MQ=255) cTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGACAAAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGc > 2:579390/1‑150 (MQ=255) tcctcGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGAtg > 2:235485/1‑150 (MQ=255) cctcGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGAtgt < 1:4961272/150‑1 (MQ=255) cctcGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCGTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGAtgt < 1:3010009/150‑1 (MQ=255) ctcGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGAtgtg > 1:1754321/1‑150 (MQ=255) ctcGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGAtgtg < 1:4188171/150‑1 (MQ=255) ctcGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGAtgtg > 1:1754196/1‑150 (MQ=255) tcGGAAGTCGACCACCAAGTCAGCTATGACTTGGCATACTTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCAGAGGATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTga < 2:4755930/150‑1 (MQ=255) tcGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTga > 1:3169743/1‑150 (MQ=255) tcGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTga > 1:3098779/1‑150 (MQ=255) tcGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTga < 2:4358419/150‑1 (MQ=255) ggAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAATTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTgagc < 2:171178/150‑1 (MQ=255) aaGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTgagcga < 2:2193787/150‑1 (MQ=255) gTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTgagcgagc > 2:4646181/1‑150 (MQ=255) tCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCa > 2:4171256/1‑150 (MQ=255) cGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCAc < 1:2379061/150‑1 (MQ=255) caacaaGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCt > 2:1598010/1‑150 (MQ=255) caacaaGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCt > 2:3713256/1‑150 (MQ=255) tCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGACTTGTTTCAGCGGCTGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACt > 2:3468742/1‑150 (MQ=255) tCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACt > 2:3368212/1‑150 (MQ=255) cAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTAGAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTc < 2:738489/150‑1 (MQ=255) gCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGt > 2:3607245/1‑150 (MQ=255) cTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTc < 2:4404397/150‑1 (MQ=255) cTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTc < 1:2923461/150‑1 (MQ=255) cTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTc > 1:4251152/1‑150 (MQ=255) aTGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTTGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCaa > 2:3790288/1‑150 (MQ=255) ttGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAg > 1:2238303/1‑150 (MQ=255) ggCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGtt < 1:2792580/150‑1 (MQ=255) gCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTg > 2:526917/1‑150 (MQ=255) aTAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTa > 2:1952084/1‑150 (MQ=255) aaTTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGc > 1:4652502/1‑150 (MQ=255) ttGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGaa < 2:4976685/150‑1 (MQ=255) ttGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGaa < 1:3208317/150‑1 (MQ=255) ttGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGaa < 1:4082922/150‑1 (MQ=255) ttGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGaa < 1:2743167/150‑1 (MQ=255) tgCCGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGc < 2:3735985/122‑1 (MQ=255) cGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTc > 1:1159692/1‑64 (MQ=255) cGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGAATAACCa < 1:1688232/150‑1 (MQ=255) cGAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGAATAACCa > 1:2411612/1‑150 (MQ=255) gAC‑AAAATGCGCGCCGAGGATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGAATAACCaa < 2:4861228/150‑1 (MQ=255) gAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTc < 2:212878/63‑1 (MQ=255) gAC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGAATAACCaa < 1:3731171/150‑1 (MQ=255) aC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGAATAACCAAc > 2:3225717/1‑150 (MQ=255) aC‑AAAATGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGAATAACCAAc < 1:2967514/150‑1 (MQ=255) aaaaTGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGAATAACCAACTg < 1:91833/150‑1 (MQ=255) aaaTGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGAATAACCAACTgg > 2:2944128/1‑150 (MQ=255) aaaTGCGCGCATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGAATAACCAACTgg > 1:4610472/1‑150 (MQ=255) gcgcATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGAATAACCAACTGGCCTTTg < 2:306157/150‑1 (MQ=255) gcgcATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGAATAACCAACTGGCCTTTg < 1:649588/150‑1 (MQ=255) gcgcATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGAATAACCAACTGGCCTTTg < 1:3282626/150‑1 (MQ=255) gcATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGAATAACCAACTGGCCTTTGcc < 2:2528636/150‑1 (MQ=255) gcATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGAATAACCAACTGGCCTTTGcc > 1:665494/1‑150 (MQ=255) gcATAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGAATAACCAACTGGCCTTTGcc < 1:1254573/150‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AACTGCTCCTCGGAAGTCGACCAACAAGTCAGCTATGACTTGGCATAATTTGTGCCGAC‑AAAATGCGCGCAGAGTATAGGGGTGGATTAACCCCTATTCAACTCTTCGGTAGTGATTTCCGACTTCACGCTACAACAGGAATTGTTTCAGCGGATGTGAGCGAGCACGCCTTGCAACTCGTCAAGCGAGTTGTAGCGAATAACCAACTGGCCTTTGCC > NC_002947/1‑218 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |