| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 6013891 | 38 (0.770) | 16 (0.400) | 12/212 | 2.5 | 32.2% | intergenic (+40/+70) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| ? | NC_002947 | = 6013919 | 37 (0.940) | intergenic (+68/+42) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein | |||||
AAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGC > NC_002947/6013744‑6014039 | aaGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgc > 1:4956/1‑150 (MQ=255) gTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGCAATGCCCAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCCTCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCGCAGGTgcag < 1:318944/150‑1 (MQ=255) cGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgcagca < 2:501117/150‑1 (MQ=255) tCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAg < 1:995833/150‑1 (MQ=255) ggcggcCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑Gtctc < 2:378136/150‑1 (MQ=255) ggcCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGGCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGaa > 2:42208/1‑150 (MQ=255) tGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGATGTAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCtg < 1:1149603/150‑1 (MQ=255) ccGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCTGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCtgtg < 2:872764/150‑1 (MQ=255) ccGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCtgtg < 1:455358/150‑1 (MQ=255) ccGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCtgtg < 2:1036504/150‑1 (MQ=255) cGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGc < 1:98679/150‑1 (MQ=255) cTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTa > 1:595417‑M2/1‑149 (MQ=255) tGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTac < 2:943323‑M2/150‑3 (MQ=255) tGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTac > 2:1139257‑M2/1‑148 (MQ=255) gACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacct < 1:764155‑M2/150‑5 (MQ=255) cAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgt < 1:620065‑M1/150‑35 (MQ=255) cAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgt > 2:764155‑M2/1‑144 (MQ=255) aGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtg < 2:982136‑M1/150‑36 (MQ=255) aGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtg > 2:504451‑M2/1‑143 (MQ=255) gCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgg > 1:107978‑M2/1‑142 (MQ=255) ccAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtggg > 2:207444‑M2/1‑141 (MQ=255) gTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgg > 2:4956‑M2/1‑136 (MQ=255) gTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgg > 2:944044‑M2/1‑136 (MQ=255) 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gCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCCAACGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTg > 1:718351/1‑150 (MQ=255) cTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTgg > 1:86437/1‑150 (MQ=255) tGGAAGGTGGTGTTGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgt < 1:1198040‑M1/106‑35 (MQ=255) tGGAAGGTGGTGTTGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgt > 2:1198040‑M1/1‑72 (MQ=255) gtgtggtCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAg > 1:296943/1‑150 (MQ=255) tCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtggg < 2:76495‑M1/85‑38 (MQ=255) tCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtggg > 1:76495‑M1/1‑48 (MQ=255) tCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcac > 1:629736‑M1/1‑48 (MQ=255) tCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcac < 2:629736‑M1/78‑31 (MQ=255) tCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgca < 2:938173‑M1/77‑30 (MQ=255) tCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgca > 1:938173‑M1/1‑48 (MQ=255) tCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaacaacaa > 1:401138/1‑150 (MQ=255) gAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgg < 1:944541‑M1/82‑37 (MQ=255) gAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgg > 2:944541‑M1/1‑46 (MQ=255) 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ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgat > 1:943323‑M1/1‑27 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtg < 2:1165563‑M2/62‑8 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCACCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtg > 1:1165563‑M2/1‑55 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgc < 2:103790‑M1/150‑131 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCtt < 1:470010/87‑1 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCtt > 2:470010/1‑87 (MQ=255) cGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGcc < 2:1206598/77‑1 (MQ=255) cGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGcc > 1:1206598/1‑77 (MQ=255) 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cacaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTg > 2:384701/1‑145 (MQ=255) cacaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCa > 1:674197/1‑150 (MQ=255) acaGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctg > 2:764155‑M1/1‑6 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctg < 1:620065‑M2/150‑117 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgacaacaccaccttcca > 2:1198040‑M2/1‑34 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgacaacaccaccttcca < 1:1198040‑M2/106‑73 (MQ=255) caGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAAc < 2:296943/150‑1 (MQ=255) aGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtc < 1:764155‑M1/150‑147 (MQ=255) aGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATc > 2:1009001/1‑78 (MQ=255) aGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATc < 1:1009001/78‑1 (MQ=255) gTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtcca > 2:1139257‑M1/1‑2 (MQ=255) gTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtcca < 2:943323‑M1/150‑149 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcga > 1:629736‑M2/1‑30 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcga < 2:629736‑M2/78‑49 (MQ=255) tacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtccag > 1:595417‑M1/1‑1 (MQ=255) tGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcga < 2:938173‑M2/77‑49 (MQ=255) tGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcga > 1:938173‑M2/1‑29 (MQ=255) | AAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGC > NC_002947/6013744‑6014039 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |