| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,355,090 | Δ1 bp | 13.0% | coding (246/681 nt) | modB → | molybdate ABC transporter permease ModB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,355,090 | 0 | G | . | 13.0% | 194.2 / 27.6 | 69 | coding (246/681 nt) | modB | molybdate ABC transporter permease ModB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/33); new base . (5/4); total (32/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.23e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.44e-01 | |||||||||||
GCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGCGA > NC_002947/4354941‑4355234 | gCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGgcg > 2:1087689/1‑150 (MQ=255) ccTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGgcgc < 2:868553/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCt > 2:947167/1‑150 (MQ=255) tggtggCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTa > 1:952010/1‑150 (MQ=255) tggCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑Gc > 2:1180940/1‑150 (MQ=255) ggCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑Gcc < 2:386129/150‑1 (MQ=255) cTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTg < 1:1122735/150‑1 (MQ=255) tCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTgg > 1:465218/1‑150 (MQ=255) cgcgcgCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAC‑GCCTggg < 2:89199/150‑1 (MQ=255) gcgcgcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCGGCTGGTACTGCCACAGACGGTGCTAGGTATTTACGTGATGATCGCGCTTGGCCCGCAGGGCTGGCTTGGTCAGGCTACTCCAGCGCTAG‑GCCTGGGc > 1:453182/1‑150 (MQ=255) gcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAgtg < 1:93823/150‑1 (MQ=255) cgcgCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTgtgg < 2:336313/150‑1 (MQ=255) ctTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCa < 2:430943/150‑1 (MQ=255) cgcgTGCCGGGGGGTGCGGTGTTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTcaca < 2:720824/150‑1 (MQ=255) cGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTgg < 2:1306784/150‑1 (MQ=255) gtgCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTg > 2:395670/1‑150 (MQ=255) tgCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTgg < 1:1102287/150‑1 (MQ=255) cGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCt < 2:618169/150‑1 (MQ=255) cGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCt < 1:419303/150‑1 (MQ=255) ggtggtGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTc < 1:1405605/150‑1 (MQ=255) gtggtgGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCTGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCg > 2:470228/1‑150 (MQ=255) ggtggCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGAc < 2:1074372/150‑1 (MQ=255) aCTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCGCCCAGGC‑CTAGCGCCTgggtggcc > 2:996131/1‑102 (MQ=255) aCTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCGCCCAGGC‑CTAGCGCCTgggtggcc < 1:996131/107‑6 (MQ=255) aCTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGGTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTa > 1:1282363/1‑150 (MQ=255) gCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTc < 1:947167/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGtt > 1:1312695/1‑110 (MQ=255) ccGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGtt < 2:1312695/110‑1 (MQ=255) ccGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGACTAGCTCGACACGGTGACCGTTTCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTcc > 2:692284/1‑150 (MQ=255) gCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCCCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGC‑CTAGCGCCTgggtg > 1:1078752/1‑96 (MQ=255) gCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCCCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGC‑CTAGCGCCTgggtg < 2:1078752/98‑3 (MQ=255) cTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATg > 2:1137037/1‑150 (MQ=255) tGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTg > 2:745455/1‑86 (MQ=255) tGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTg < 1:745455/86‑1 (MQ=255) tGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCa > 2:191040/1‑102 (MQ=255) tGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCa < 1:191040/102‑1 (MQ=255) tGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCg > 1:1077179/1‑150 (MQ=255) gCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACGGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCgt > 1:1058957/1‑150 (MQ=255) ccACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCgtg > 1:919352/1‑150 (MQ=255) aCGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCaa > 2:1278123/1‑150 (MQ=255) aCGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCaa < 2:952010/150‑1 (MQ=255) cGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAAc < 1:152237/150‑1 (MQ=255) ggTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGATGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGaaaaa > 1:1003106/1‑148 (MQ=255) gTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAAccc < 1:496524/150‑1 (MQ=255) gTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCCTGGCCCGCACGGCTGGCTTGCTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTCGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAAccc < 1:519706/150‑1 (MQ=255) tCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGc < 2:200712/141‑1 (MQ=255) tCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGc > 1:200712/1‑141 (MQ=255) cGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGATCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCa > 2:1171075/1‑150 (MQ=255) ttttACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAAt < 2:465218/150‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGAtt > 2:352216/1‑90 (MQ=255) aTCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGAtt < 1:352216/90‑1 (MQ=255) cccTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGAt < 2:148983/85‑1 (MQ=255) cccTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGAt > 1:148983/1‑85 (MQ=255) cGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCt < 2:1282363/150‑1 (MQ=255) ggctTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAg < 2:191702/150‑1 (MQ=255) ggTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTcgcc < 1:1087689/150‑1 (MQ=255) gTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACGGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTAGAACTACCGGGTCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTcgccg < 2:1058957/150‑1 (MQ=255) tCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTcgccg < 2:1420483/149‑1 (MQ=255) tCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTcgccg > 1:1420483/1‑149 (MQ=255) gCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTAct > 1:1185677/1‑150 (MQ=255) gCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTAct > 2:1228973/1‑150 (MQ=255) actgcccAGGC‑CTAGCGCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTg < 2:1136443/131‑1 (MQ=255) actgcccAGGC‑CTAGCGCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTg > 1:1136443/5‑135 (MQ=255) actgcccAGGC‑CTAGCGCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTAct > 2:475346/5‑150 (MQ=255) actgcccAGGC‑CTAGCGCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTAct > 2:1391474/5‑150 (MQ=255) tgcccAGGC‑CTAGCGCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTActct < 1:475346/148‑1 (MQ=255) aCCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCATGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTg < 2:919352/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACCCTGCGa > 2:224190/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTAGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGCGa < 2:453182/150‑1 (MQ=255) aGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGAtt < 2:560857/50‑1 (MQ=255) aGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGAtt > 1:560857/1‑50 (MQ=255) | GCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGCGA > NC_002947/4354941‑4355234 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |